More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1051 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  60.95 
 
 
688 aa  722    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  54.94 
 
 
875 aa  650    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  54.1 
 
 
1058 aa  647    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  61.25 
 
 
883 aa  748    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  56.51 
 
 
673 aa  674    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1034  translation initiation factor IF-2  54.39 
 
 
774 aa  655    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  55.12 
 
 
896 aa  653    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  62.48 
 
 
720 aa  753    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  58.52 
 
 
941 aa  655    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  53.03 
 
 
964 aa  637    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  61.8 
 
 
686 aa  728    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  62.03 
 
 
985 aa  769    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  57.68 
 
 
686 aa  673    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  62.11 
 
 
980 aa  757    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  57.75 
 
 
711 aa  675    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  52.93 
 
 
975 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  60.95 
 
 
686 aa  722    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  61.29 
 
 
686 aa  724    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  61.29 
 
 
686 aa  724    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  52.93 
 
 
975 aa  643    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  61.95 
 
 
705 aa  729    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  52.87 
 
 
943 aa  652    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  69.89 
 
 
1035 aa  783    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0993  translation initiation factor IF-2  55.25 
 
 
668 aa  664    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000676499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  52.93 
 
 
975 aa  643    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  58.1 
 
 
658 aa  662    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  59.08 
 
 
854 aa  684    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  53.77 
 
 
922 aa  658    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  52.85 
 
 
965 aa  639    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  52.77 
 
 
975 aa  641    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  52.77 
 
 
975 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  62.28 
 
 
986 aa  762    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  52.93 
 
 
975 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  57.77 
 
 
752 aa  702    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  59.08 
 
 
947 aa  720    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  61.29 
 
 
686 aa  724    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  63.32 
 
 
1029 aa  759    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  58.59 
 
 
920 aa  686    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  62.58 
 
 
1131 aa  729    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  61.94 
 
 
884 aa  755    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  56.97 
 
 
984 aa  679    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  60.95 
 
 
686 aa  722    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  55.37 
 
 
940 aa  649    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  52.44 
 
 
986 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  58.43 
 
 
1079 aa  677    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  53.27 
 
 
873 aa  654    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  61.74 
 
 
903 aa  773    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  52.44 
 
 
976 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  56.34 
 
 
656 aa  647    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  59.54 
 
 
888 aa  715    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  54.94 
 
 
875 aa  650    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  61.95 
 
 
705 aa  729    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  53.96 
 
 
945 aa  676    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  53.03 
 
 
907 aa  664    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  61.8 
 
 
686 aa  728    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  53.09 
 
 
989 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  58.29 
 
 
928 aa  665    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  61.53 
 
 
689 aa  733    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  52.45 
 
 
964 aa  636    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  58.63 
 
 
924 aa  677    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  53.29 
 
 
979 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  53.24 
 
 
895 aa  642    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  52.61 
 
 
964 aa  637    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  52.77 
 
 
975 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  54.58 
 
 
853 aa  646    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08040  translation initiation factor IF-2  57.41 
 
 
929 aa  650    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13732  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  60.33 
 
 
949 aa  726    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3751  translation initiation factor IF-2  57.71 
 
 
729 aa  657    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00372327  unclonable  0.0000243777 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  51.95 
 
 
972 aa  637    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  64.36 
 
 
1161 aa  783    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  60.96 
 
 
679 aa  739    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  60.96 
 
 
679 aa  739    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  52.44 
 
 
969 aa  639    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3035  translation initiation factor IF-2  54.5 
 
 
884 aa  638    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.19789  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  54.53 
 
 
879 aa  646    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  63.48 
 
 
860 aa  761    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  54.83 
 
 
892 aa  684    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  47.03 
 
 
882 aa  739    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  51.95 
 
 
971 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  55.02 
 
 
936 aa  643    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  61.54 
 
 
688 aa  722    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  54.94 
 
 
968 aa  642    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  45.04 
 
 
882 aa  685    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  54.21 
 
 
834 aa  656    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  56.08 
 
 
943 aa  642    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  58.56 
 
 
738 aa  664    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  59.38 
 
 
822 aa  723    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  59.79 
 
 
962 aa  697    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  56.52 
 
 
949 aa  679    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  66.9 
 
 
739 aa  787    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  55.14 
 
 
879 aa  649    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  52.47 
 
 
956 aa  640    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  58.82 
 
 
921 aa  739    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  66.14 
 
 
732 aa  775    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  100 
 
 
845 aa  1691    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  52.69 
 
 
971 aa  748    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  57.17 
 
 
997 aa  677    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  67.65 
 
 
692 aa  805    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  57.24 
 
 
887 aa  672    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  56.83 
 
 
1079 aa  680    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>