More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0609 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 732 aa  682    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  48.03 
 
 		 720 aa  655    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  56.91 
 
 		 985 aa  673    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  48.13 
 
 		 688 aa  643    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  48.09 
 
 		 686 aa  646    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  48.09 
 
 		 686 aa  647    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  48.37 
 
 		 686 aa  649    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  48.37 
 
 		 686 aa  649    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  48.09 
 
 		 686 aa  645    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  54.75 
 
 		 971 aa  668    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  57.37 
 
 		 739 aa  667    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  48.09 
 
 		 686 aa  647    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  53.08 
 
 		 692 aa  703    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  48.27 
 
 		 688 aa  638    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  57.52 
 
 		 903 aa  690    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 711 aa  1421    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  56.61 
 
 		 1029 aa  678    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  56.58 
 
 		 1161 aa  670    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  57.53 
 
 		 845 aa  653    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 689 aa  659    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  51.28 
 
 		 679 aa  676    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  51.28 
 
 		 679 aa  675    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  57.05 
 
 		 1131 aa  639    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  53.11 
 
 		 882 aa  648    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  47.97 
 
 		 686 aa  649    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  51.54 
 
 		 686 aa  661    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  54.77 
 
 		 884 aa  632  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  51.82 
 
 		 921 aa  633  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  55.46 
 
 		 883 aa  630  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  48.1 
 
 		 705 aa  631  1e-179  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  48.1 
 
 		 705 aa  631  1e-179  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  54.77 
 
 		 986 aa  631  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  54.59 
 
 		 980 aa  629  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  53.37 
 
 		 882 aa  629  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  51.41 
 
 		 888 aa  624  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  44.74 
 
 		 752 aa  620  1e-176  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  52.97 
 
 		 860 aa  617  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  53.34 
 
 		 924 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  52.21 
 
 		 892 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  49.65 
 
 		 673 aa  613  9.999999999999999e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  53.7 
 
 		 997 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  53.16 
 
 		 947 aa  608  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  56.84 
 
 		 1035 aa  610  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  50.74 
 
 		 822 aa  612  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  51.02 
 
 		 920 aa  607  9.999999999999999e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  47.32 
 
 		 689 aa  606  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  52.44 
 
 		 949 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  52.77 
 
 		 898 aa  604  1.0000000000000001e-171  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  53.37 
 
 		 1079 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  53.29 
 
 		 962 aa  600  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  48.33 
 
 		 848 aa  598  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  52.27 
 
 		 1079 aa  595  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  47.27 
 
 		 880 aa  595  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  50.81 
 
 		 885 aa  597  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  51.47 
 
 		 945 aa  596  1e-169  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  52.41 
 
 		 894 aa  598  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  52.24 
 
 		 902 aa  593  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0131  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 		 871 aa  593  1e-168  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  48.85 
 
 		 896 aa  593  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0149  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 		 854 aa  592  1e-168  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00379745  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  48.49 
 
 		 895 aa  594  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  51.63 
 
 		 943 aa  592  1e-168  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  47.08 
 
 		 885 aa  588  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0222  translation initiation factor IF-2  50.09 
 
 		 877 aa  588  1e-167  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0273572  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  52.69 
 
 		 879 aa  589  1e-167  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0171  translation initiation factor IF-2  51.02 
 
 		 871 aa  590  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00654664  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  47.08 
 
 		 885 aa  589  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  47.08 
 
 		 885 aa  589  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  46.95 
 
 		 881 aa  590  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  49.37 
 
 		 949 aa  590  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  47.08 
 
 		 889 aa  589  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0725  translation initiation factor IF-2  51.28 
 
 		 912 aa  591  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0457048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  48.19 
 
 		 897 aa  587  1e-166  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  48.22 
 
 		 896 aa  587  1e-166  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  51.11 
 
 		 656 aa  587  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2316  translation initiation factor IF-2  49.65 
 
 		 1116 aa  586  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100815  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  46.83 
 
 		 880 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  52.23 
 
 		 843 aa  586  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  46.83 
 
 		 880 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  46.83 
 
 		 880 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  46.83 
 
 		 880 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  52.92 
 
 		 992 aa  585  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_002950  PG0255  translation initiation factor IF-2  51.12 
 
 		 979 aa  582  1.0000000000000001e-165  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  46.88 
 
 		 889 aa  584  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  51.19 
 
 		 927 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  49.02 
 
 		 1058 aa  582  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  48.8 
 
 		 894 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  52.08 
 
 		 984 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  50 
 
 		 907 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  47.65 
 
 		 884 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0817  translation initiation factor IF-2  51.68 
 
 		 950 aa  585  1.0000000000000001e-165  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  48.53 
 
 		 903 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  49.05 
 
 		 879 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  48.68 
 
 		 882 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3035  translation initiation factor IF-2  52.77 
 
 		 884 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.19789  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  49.61 
 
 		 940 aa  581  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3605  translation initiation factor IF-2  47.65 
 
 		 898 aa  580  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600034  normal  0.0461803 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  52.07 
 
 		 975 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  51.55 
 
 		 896 aa  581  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 738 aa  580  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>