More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0149 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0131  translation initiation factor IF-2  95.98 
 
 
871 aa  1563    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  67.55 
 
 
903 aa  1151    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  68.91 
 
 
885 aa  1130    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0171  translation initiation factor IF-2  95.87 
 
 
871 aa  1560    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00654664  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0248  translation initiation factor IF-2  57.17 
 
 
888 aa  947    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346086  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0676  translation initiation factor IF-2  48.3 
 
 
874 aa  797    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.391242  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1679  translation initiation factor IF-2  62.17 
 
 
914 aa  1041    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.010886  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0149  translation initiation factor IF-2  100 
 
 
854 aa  1706    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00379745  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  68.83 
 
 
838 aa  1098    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0222  translation initiation factor IF-2  76.74 
 
 
877 aa  1261    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0273572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  52.05 
 
 
883 aa  615  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  53.1 
 
 
1029 aa  619  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  52.41 
 
 
884 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  53.82 
 
 
985 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  52.61 
 
 
822 aa  614  9.999999999999999e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  52.61 
 
 
986 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 
892 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  52.06 
 
 
882 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  52.11 
 
 
924 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  52.61 
 
 
980 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  50.91 
 
 
903 aa  602  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  52.26 
 
 
739 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  51.95 
 
 
732 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  50.58 
 
 
1079 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  51.36 
 
 
947 aa  601  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  51.57 
 
 
692 aa  599  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  51.55 
 
 
921 aa  601  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  49.68 
 
 
915 aa  596  1e-169  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 
1022 aa  597  1e-169  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  51.87 
 
 
689 aa  595  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  51.03 
 
 
686 aa  592  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  51.03 
 
 
686 aa  591  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  50.86 
 
 
686 aa  591  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  50.86 
 
 
686 aa  591  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  51.03 
 
 
686 aa  592  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  49.84 
 
 
984 aa  589  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  51.03 
 
 
686 aa  591  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 
711 aa  592  1e-167  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  50.86 
 
 
997 aa  592  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  51.21 
 
 
686 aa  590  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  48.76 
 
 
971 aa  590  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  49.58 
 
 
1161 aa  589  1e-167  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  48.44 
 
 
991 aa  589  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 
945 aa  585  1e-166  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  41 
 
 
845 aa  586  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0398  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 
986 aa  587  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0010836  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  49.15 
 
 
936 aa  588  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01760  translation initiation factor IF-2  49.91 
 
 
868 aa  587  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  50.78 
 
 
898 aa  586  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  51.15 
 
 
940 aa  585  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  49.14 
 
 
920 aa  588  1e-166  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  48.27 
 
 
848 aa  587  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 
688 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  48.24 
 
 
752 aa  583  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  49.09 
 
 
885 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  48.03 
 
 
686 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 
956 aa  583  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  49.07 
 
 
720 aa  579  1e-164  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 
688 aa  581  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  51.55 
 
 
949 aa  582  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 
705 aa  581  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  47.43 
 
 
1058 aa  581  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 
705 aa  581  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  46.33 
 
 
881 aa  582  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  49.91 
 
 
894 aa  579  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  51.71 
 
 
1079 aa  582  1e-164  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  49.22 
 
 
952 aa  580  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  48.4 
 
 
897 aa  579  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0255  translation initiation factor IF-2  48.73 
 
 
979 aa  579  1.0000000000000001e-163  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  49.01 
 
 
880 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  49.57 
 
 
891 aa  577  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  50.09 
 
 
902 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  50.35 
 
 
979 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  49.49 
 
 
911 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  50.6 
 
 
992 aa  578  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  46.67 
 
 
854 aa  575  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  50 
 
 
896 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0139  translation initiation factor IF-2  48.58 
 
 
908 aa  573  1.0000000000000001e-162  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  48.77 
 
 
896 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  49.25 
 
 
880 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  50 
 
 
907 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  48.54 
 
 
879 aa  575  1.0000000000000001e-162  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  48.38 
 
 
964 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  49.25 
 
 
880 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  48.54 
 
 
964 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  49.25 
 
 
880 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  49.25 
 
 
880 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  49.65 
 
 
882 aa  575  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  48.99 
 
 
860 aa  575  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  49.49 
 
 
882 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  50.87 
 
 
943 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 
896 aa  570  1e-161  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  47.97 
 
 
964 aa  570  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  48.94 
 
 
965 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  51.56 
 
 
966 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  51.2 
 
 
968 aa  570  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  47.94 
 
 
884 aa  572  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  48.22 
 
 
1008 aa  572  1e-161  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  48.28 
 
 
894 aa  571  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  48.63 
 
 
975 aa  568  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>