More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0676 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0131  translation initiation factor IF-2  48.35 
 
 		 871 aa  764    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0149  translation initiation factor IF-2  47.84 
 
 		 854 aa  769    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00379745  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  47.26 
 
 		 885 aa  766    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  48.24 
 
 		 903 aa  791    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0248  translation initiation factor IF-2  50.56 
 
 		 888 aa  826    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346086  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0676  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 874 aa  1763    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.391242  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0222  translation initiation factor IF-2  52.85 
 
 		 877 aa  755    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0273572  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1679  translation initiation factor IF-2  47.62 
 
 		 914 aa  768    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.010886  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  47.45 
 
 		 838 aa  765    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0171  translation initiation factor IF-2  47.79 
 
 		 871 aa  763    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00654664  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  48.43 
 
 		 889 aa  585  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  49.36 
 
 		 894 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  47.43 
 
 		 897 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  48.89 
 
 		 885 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  49.75 
 
 		 848 aa  583  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  48.55 
 
 		 896 aa  582  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  50.69 
 
 		 720 aa  580  1e-164  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  50.58 
 
 		 985 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  49.42 
 
 		 822 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 896 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  47.56 
 
 		 971 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 		 895 aa  573  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  38.4 
 
 		 903 aa  573  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  47.92 
 
 		 881 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 		 705 aa  569  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  48.46 
 
 		 965 aa  572  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  49.39 
 
 		 732 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 		 705 aa  569  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  47.21 
 
 		 885 aa  569  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  47.21 
 
 		 885 aa  569  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  47.21 
 
 		 889 aa  570  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  47.28 
 
 		 882 aa  570  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  49.74 
 
 		 739 aa  568  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  47.62 
 
 		 880 aa  568  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  47.05 
 
 		 885 aa  568  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  51.52 
 
 		 868 aa  568  1e-160  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  51.69 
 
 		 868 aa  569  1e-160  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  48.29 
 
 		 986 aa  566  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  49.13 
 
 		 692 aa  565  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  47.62 
 
 		 880 aa  568  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  47.62 
 
 		 880 aa  568  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  48.06 
 
 		 989 aa  567  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  47.8 
 
 		 972 aa  568  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  49.57 
 
 		 882 aa  568  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  47.64 
 
 		 971 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  47.14 
 
 		 880 aa  566  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  47.62 
 
 		 880 aa  568  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  50.6 
 
 		 689 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  48.07 
 
 		 898 aa  565  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  47.15 
 
 		 976 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  47.38 
 
 		 884 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  48.8 
 
 		 894 aa  564  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  48.99 
 
 		 902 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  47.32 
 
 		 964 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  48.87 
 
 		 883 aa  561  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  47.32 
 
 		 964 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 686 aa  561  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  50.52 
 
 		 686 aa  561  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 		 686 aa  561  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 		 686 aa  561  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  46.75 
 
 		 975 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  46.99 
 
 		 975 aa  562  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  48.87 
 
 		 986 aa  559  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  46.92 
 
 		 975 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  47.08 
 
 		 972 aa  559  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  50.52 
 
 		 686 aa  561  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  46.92 
 
 		 975 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  46.75 
 
 		 975 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  46.04 
 
 		 843 aa  562  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  47.77 
 
 		 1161 aa  561  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  47.4 
 
 		 971 aa  562  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  49.17 
 
 		 891 aa  560  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  49.04 
 
 		 679 aa  559  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  49.04 
 
 		 679 aa  559  1e-158  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  49.04 
 
 		 980 aa  560  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  46.75 
 
 		 975 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  47.4 
 
 		 971 aa  562  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  46.99 
 
 		 969 aa  560  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 686 aa  561  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  47.4 
 
 		 971 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  46.75 
 
 		 975 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  49.5 
 
 		 686 aa  560  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  49.74 
 
 		 892 aa  558  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  47.91 
 
 		 1029 aa  557  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  48 
 
 		 884 aa  557  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  47.21 
 
 		 907 aa  556  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  39.54 
 
 		 845 aa  558  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3605  translation initiation factor IF-2  49.58 
 
 		 898 aa  556  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600034  normal  0.0461803 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3346  translation initiation factor IF-2  49.33 
 
 		 901 aa  556  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.12411  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0585  translation initiation factor IF-2  49.16 
 
 		 899 aa  556  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 688 aa  557  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  48.75 
 
 		 1079 aa  556  1e-157  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  47.85 
 
 		 964 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  48.98 
 
 		 997 aa  555  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0808  translation initiation factor IF-2  49 
 
 		 900 aa  555  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.925902  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3993  translation initiation factor IF-2  49.24 
 
 		 884 aa  552  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01760  translation initiation factor IF-2  47.89 
 
 		 868 aa  553  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  46.12 
 
 		 979 aa  555  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3608  translation initiation factor IF-2  48.92 
 
 		 828 aa  553  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  48.9 
 
 		 688 aa  551  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>