More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0222 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0149  translation initiation factor IF-2  76.72 
 
 		 854 aa  1261    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00379745  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0171  translation initiation factor IF-2  84.02 
 
 		 871 aa  1220    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00654664  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0131  translation initiation factor IF-2  84.15 
 
 		 871 aa  1223    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0222  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 877 aa  1753    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0273572  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0676  translation initiation factor IF-2  50.28 
 
 		 874 aa  820    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.391242  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0248  translation initiation factor IF-2  56.42 
 
 		 888 aa  962    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346086  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1679  translation initiation factor IF-2  64.83 
 
 		 914 aa  1094    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.010886  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  69.13 
 
 		 903 aa  1190    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  68.91 
 
 		 885 aa  1161    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  66.89 
 
 		 838 aa  1076    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  51.93 
 
 		 822 aa  630  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  51.87 
 
 		 883 aa  626  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  53.31 
 
 		 1029 aa  626  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  52.21 
 
 		 884 aa  625  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  52.74 
 
 		 739 aa  621  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  52.03 
 
 		 732 aa  621  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  52.44 
 
 		 692 aa  620  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  51.42 
 
 		 882 aa  617  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  49.53 
 
 		 947 aa  618  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  52.13 
 
 		 980 aa  616  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  51.23 
 
 		 986 aa  617  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  53.31 
 
 		 985 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  51.9 
 
 		 1079 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  50.58 
 
 		 903 aa  614  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  46.93 
 
 		 1161 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 892 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  51.42 
 
 		 924 aa  615  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  50.49 
 
 		 921 aa  609  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  51.92 
 
 		 686 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  52.09 
 
 		 686 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  51.92 
 
 		 686 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  51.92 
 
 		 686 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  52.09 
 
 		 686 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  51.74 
 
 		 686 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  50.66 
 
 		 885 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  51.74 
 
 		 686 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  52.17 
 
 		 689 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  48.22 
 
 		 686 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  51.87 
 
 		 845 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  47.52 
 
 		 897 aa  599  1e-170  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  50.5 
 
 		 971 aa  602  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  51.05 
 
 		 688 aa  597  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  51.03 
 
 		 997 aa  598  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01760  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 868 aa  597  1e-169  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  49.84 
 
 		 949 aa  597  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  50.58 
 
 		 880 aa  598  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  51.13 
 
 		 898 aa  596  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  50.5 
 
 		 885 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  50.5 
 
 		 885 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  50.5 
 
 		 889 aa  595  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  51.05 
 
 		 688 aa  598  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  48.76 
 
 		 848 aa  597  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  50.26 
 
 		 720 aa  594  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  50.41 
 
 		 880 aa  595  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  50.33 
 
 		 885 aa  594  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  50.41 
 
 		 880 aa  595  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  51.57 
 
 		 940 aa  594  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  51.47 
 
 		 915 aa  593  1e-168  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  52.97 
 
 		 1035 aa  593  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  50.41 
 
 		 880 aa  595  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  50.25 
 
 		 881 aa  593  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  50.41 
 
 		 880 aa  595  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  51.02 
 
 		 896 aa  591  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 		 711 aa  590  1e-167  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  50.43 
 
 		 1022 aa  589  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 984 aa  591  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  50.69 
 
 		 964 aa  589  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 860 aa  591  1e-167  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  50.95 
 
 		 882 aa  590  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  49.31 
 
 		 705 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  50.43 
 
 		 964 aa  586  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  49.1 
 
 		 894 aa  587  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  47.63 
 
 		 1058 aa  588  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 891 aa  588  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  48.87 
 
 		 936 aa  588  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  50 
 
 		 907 aa  587  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  49.74 
 
 		 979 aa  588  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  50.52 
 
 		 964 aa  589  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  50.35 
 
 		 945 aa  587  1e-166  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  49.31 
 
 		 705 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 		 1079 aa  588  1e-166  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  50.35 
 
 		 894 aa  586  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  51.2 
 
 		 904 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  50.87 
 
 		 888 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  46.8 
 
 		 956 aa  583  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  48.93 
 
 		 902 aa  584  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  50.27 
 
 		 752 aa  584  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  50.52 
 
 		 896 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  50.52 
 
 		 984 aa  582  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  48.91 
 
 		 869 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  47.3 
 
 		 854 aa  583  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  47.98 
 
 		 991 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  50.09 
 
 		 992 aa  582  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  50.6 
 
 		 966 aa  580  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0398  translation initiation factor IF-2  49.05 
 
 		 986 aa  579  1e-164  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0010836  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  48.9 
 
 		 887 aa  580  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  48.77 
 
 		 965 aa  579  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  51.74 
 
 		 679 aa  580  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  51.74 
 
 		 679 aa  580  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  39.09 
 
 		 882 aa  580  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>