More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1630 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0032  translation initiation factor IF-2  61.54 
 
 		 1016 aa  792    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.247962 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  54.03 
 
 		 883 aa  689    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0255  translation initiation factor IF-2  49.55 
 
 		 979 aa  875    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  55.56 
 
 		 1029 aa  656    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  55.33 
 
 		 949 aa  657    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  58.83 
 
 		 924 aa  749    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0653  translation initiation factor IF-2  57.02 
 
 		 1204 aa  743    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.696738  normal  0.0609071 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  63.08 
 
 		 945 aa  1151    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  54.02 
 
 		 936 aa  706    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  44.34 
 
 		 947 aa  655    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0398  translation initiation factor IF-2  55.23 
 
 		 986 aa  679    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0010836  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  54.75 
 
 		 915 aa  709    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  56.25 
 
 		 1022 aa  693    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  54.75 
 
 		 884 aa  696    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  46.91 
 
 		 1079 aa  638    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  50.6 
 
 		 986 aa  681    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1215  translation initiation factor IF-2  61.13 
 
 		 1148 aa  783    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  49.09 
 
 		 903 aa  640    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0141  translation initiation factor IF-2  49.57 
 
 		 1010 aa  904    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  42.78 
 
 		 907 aa  639    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  51.05 
 
 		 980 aa  684    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0139  translation initiation factor IF-2  47.82 
 
 		 908 aa  828    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  48.7 
 
 		 882 aa  694    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  56.03 
 
 		 971 aa  651    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  46.65 
 
 		 1008 aa  875    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  51.25 
 
 		 985 aa  655    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 956 aa  1928    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  40.95 
 
 		 952 aa  697    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  56.36 
 
 		 921 aa  681    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  52.83 
 
 		 991 aa  691    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  64.2 
 
 		 943 aa  1149    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  51.36 
 
 		 885 aa  632  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  55.59 
 
 		 692 aa  634  1e-180  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  50.16 
 
 		 881 aa  634  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  52.58 
 
 		 896 aa  629  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  50.64 
 
 		 880 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  50.64 
 
 		 880 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  50.64 
 
 		 880 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  50.64 
 
 		 880 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 896 aa  629  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01760  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 		 868 aa  625  1e-178  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  55.09 
 
 		 732 aa  627  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  50.16 
 
 		 880 aa  628  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  50.66 
 
 		 869 aa  628  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  50.32 
 
 		 885 aa  625  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  50.32 
 
 		 885 aa  625  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  51.62 
 
 		 962 aa  626  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  52.14 
 
 		 896 aa  622  1e-177  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 885 aa  622  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  48.13 
 
 		 984 aa  624  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  52.85 
 
 		 898 aa  623  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  49.6 
 
 		 884 aa  623  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  51.8 
 
 		 892 aa  622  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 894 aa  624  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  50.16 
 
 		 889 aa  624  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  45.37 
 
 		 964 aa  619  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  55.09 
 
 		 739 aa  621  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  50.32 
 
 		 894 aa  620  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  51.45 
 
 		 822 aa  619  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  51.63 
 
 		 889 aa  616  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  52.98 
 
 		 686 aa  616  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 882 aa  617  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  48.95 
 
 		 875 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  54.18 
 
 		 845 aa  615  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  50.64 
 
 		 902 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  53.33 
 
 		 979 aa  613  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  48.95 
 
 		 875 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  51.62 
 
 		 997 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  49.6 
 
 		 880 aa  613  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  51.12 
 
 		 891 aa  610  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  50.16 
 
 		 922 aa  610  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  53.69 
 
 		 1079 aa  609  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  49.75 
 
 		 943 aa  609  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3346  translation initiation factor IF-2  52.56 
 
 		 901 aa  609  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.12411  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2134  translation initiation factor IF-2  52.91 
 
 		 978 aa  611  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149988  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  52.87 
 
 		 1161 aa  611  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3465  translation initiation factor IF-2  49.69 
 
 		 905 aa  606  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  53.23 
 
 		 992 aa  608  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0808  translation initiation factor IF-2  52.22 
 
 		 900 aa  607  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.925902  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  51.22 
 
 		 964 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  51.22 
 
 		 964 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  45.92 
 
 		 888 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  50 
 
 		 949 aa  609  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  44.22 
 
 		 879 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  50.86 
 
 		 895 aa  608  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  50.6 
 
 		 848 aa  608  9.999999999999999e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  54.67 
 
 		 860 aa  605  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0585  translation initiation factor IF-2  51.88 
 
 		 899 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  53.5 
 
 		 966 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  49.12 
 
 		 876 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 943 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 		 943 aa  605  1.0000000000000001e-171  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2757  translation initiation factor IF-2  48.55 
 
 		 838 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  47.73 
 
 		 835 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  45.03 
 
 		 882 aa  604  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  49.06 
 
 		 1058 aa  605  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  50.75 
 
 		 984 aa  605  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  48.54 
 
 		 959 aa  601  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  54.1 
 
 		 968 aa  599  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  52.31 
 
 		 989 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>