More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1679 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1679  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 914 aa  1808    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.010886  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0131  translation initiation factor IF-2  70.49 
 
 		 871 aa  1006    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0676  translation initiation factor IF-2  47.51 
 
 		 874 aa  777    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.391242  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  63.91 
 
 		 903 aa  1083    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0171  translation initiation factor IF-2  70.36 
 
 		 871 aa  1004    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00654664  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0149  translation initiation factor IF-2  70.49 
 
 		 854 aa  1005    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00379745  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  64.32 
 
 		 885 aa  1076    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0248  translation initiation factor IF-2  54.42 
 
 		 888 aa  909    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346086  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0222  translation initiation factor IF-2  72.01 
 
 		 877 aa  1034    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0273572  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  65.38 
 
 		 838 aa  1094    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  52.34 
 
 		 822 aa  618  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  51.8 
 
 		 884 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  52.77 
 
 		 692 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  51.29 
 
 		 883 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  49.43 
 
 		 986 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  49.46 
 
 		 985 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  50.51 
 
 		 739 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  51.11 
 
 		 947 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  51.46 
 
 		 882 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  50.51 
 
 		 732 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  49.13 
 
 		 921 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 964 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  49.76 
 
 		 964 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  50.77 
 
 		 979 aa  601  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  51.8 
 
 		 1161 aa  600  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  50.5 
 
 		 986 aa  597  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  50.16 
 
 		 989 aa  597  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  49.35 
 
 		 980 aa  598  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  49.59 
 
 		 964 aa  594  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  49.83 
 
 		 903 aa  594  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  48.73 
 
 		 1029 aa  595  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  49.74 
 
 		 892 aa  593  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  51.03 
 
 		 924 aa  592  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  48.95 
 
 		 971 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  48.37 
 
 		 907 aa  590  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  48.95 
 
 		 971 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  49.03 
 
 		 969 aa  591  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  49.03 
 
 		 971 aa  591  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  49.76 
 
 		 965 aa  591  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  48.95 
 
 		 971 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  50.43 
 
 		 686 aa  585  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  48.87 
 
 		 975 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  50.94 
 
 		 966 aa  586  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  49.03 
 
 		 975 aa  589  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  49.03 
 
 		 975 aa  588  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  49.03 
 
 		 972 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  50.43 
 
 		 686 aa  585  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  49.03 
 
 		 976 aa  587  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  48.87 
 
 		 975 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  49.03 
 
 		 975 aa  589  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  50.26 
 
 		 689 aa  586  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  48.87 
 
 		 975 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  48.87 
 
 		 975 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  50.67 
 
 		 896 aa  584  1.0000000000000001e-165  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  50.09 
 
 		 686 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 860 aa  582  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  50.26 
 
 		 686 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  50.26 
 
 		 686 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  46.86 
 
 		 875 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  50.09 
 
 		 686 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  52.96 
 
 		 1035 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  48.78 
 
 		 972 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  46.86 
 
 		 875 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  51.33 
 
 		 686 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  51.48 
 
 		 845 aa  582  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  47.4 
 
 		 752 aa  582  1e-164  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  51.11 
 
 		 949 aa  582  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  49.5 
 
 		 971 aa  580  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  49.57 
 
 		 920 aa  582  1e-164  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  47.25 
 
 		 848 aa  580  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  50.09 
 
 		 720 aa  578  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  50.44 
 
 		 688 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  48.64 
 
 		 997 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  47.44 
 
 		 915 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  48.46 
 
 		 897 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  48.39 
 
 		 885 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  48.39 
 
 		 1079 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  48.48 
 
 		 904 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  48.62 
 
 		 945 aa  573  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  50.09 
 
 		 688 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  47.49 
 
 		 880 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  47.72 
 
 		 896 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  49.38 
 
 		 834 aa  573  1.0000000000000001e-162  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  48.26 
 
 		 984 aa  570  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  48.71 
 
 		 705 aa  572  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01760  translation initiation factor IF-2  47.93 
 
 		 868 aa  571  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  48.71 
 
 		 705 aa  572  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  47.14 
 
 		 882 aa  569  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  47.83 
 
 		 992 aa  569  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  47.41 
 
 		 880 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  47.73 
 
 		 885 aa  566  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3608  translation initiation factor IF-2  46.03 
 
 		 828 aa  567  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5462  translation initiation factor IF-2  48.01 
 
 		 837 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  47.41 
 
 		 880 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  47.41 
 
 		 880 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42820  translation initiation factor IF-2  48.18 
 
 		 836 aa  568  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914178  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  48.09 
 
 		 882 aa  569  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  49.3 
 
 		 882 aa  568  1e-160  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  53.12 
 
 		 962 aa  567  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  47.89 
 
 		 889 aa  568  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>