More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0836 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_16741  translation initiation factor IF-2  55.5 
 
 		 1161 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  52.87 
 
 		 883 aa  655    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  61.19 
 
 		 860 aa  759    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  64.03 
 
 		 686 aa  926    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  53.94 
 
 		 896 aa  635    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 720 aa  1454    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  49.13 
 
 		 885 aa  644    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  64.31 
 
 		 686 aa  929    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  49.54 
 
 		 889 aa  635    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  59.3 
 
 		 971 aa  748    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  63.37 
 
 		 927 aa  769    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  58.59 
 
 		 1161 aa  710    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  63.89 
 
 		 686 aa  926    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  64.17 
 
 		 686 aa  928    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  65.19 
 
 		 689 aa  932    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  64.17 
 
 		 686 aa  928    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  63.75 
 
 		 688 aa  917    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  61.97 
 
 		 845 aa  726    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  52.14 
 
 		 673 aa  710    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  54.32 
 
 		 888 aa  690    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  48.17 
 
 		 922 aa  643    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1867  translation initiation factor IF-2  52.44 
 
 		 1038 aa  636    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  53.36 
 
 		 1005 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  53.81 
 
 		 882 aa  674    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  56.57 
 
 		 947 aa  672    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  64.31 
 
 		 686 aa  929    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  51.8 
 
 		 686 aa  705    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  53.04 
 
 		 884 aa  663    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  53.26 
 
 		 984 aa  637    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  63.89 
 
 		 686 aa  926    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  64.54 
 
 		 1035 aa  686    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  54.58 
 
 		 1128 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  51.17 
 
 		 1030 aa  643    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  86.11 
 
 		 705 aa  1181    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  54.41 
 
 		 822 aa  685    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  56.28 
 
 		 903 aa  734    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  63.89 
 
 		 688 aa  918    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  57.69 
 
 		 1131 aa  672    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  50.54 
 
 		 907 aa  654    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  56.35 
 
 		 986 aa  680    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  52.72 
 
 		 894 aa  639    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  55.91 
 
 		 752 aa  819    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  57.73 
 
 		 920 aa  681    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  52.26 
 
 		 1042 aa  639    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  51.5 
 
 		 895 aa  656    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  56.09 
 
 		 924 aa  652    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  51.79 
 
 		 898 aa  642    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  54.97 
 
 		 997 aa  646    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  86.11 
 
 		 705 aa  1181    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  60.1 
 
 		 679 aa  703    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  60.1 
 
 		 679 aa  703    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  54.79 
 
 		 949 aa  649    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  51.87 
 
 		 892 aa  643    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  56.75 
 
 		 882 aa  709    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  56.31 
 
 		 1029 aa  727    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0817  translation initiation factor IF-2  56.97 
 
 		 950 aa  733    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0433  translation initiation factor IF-2  54.53 
 
 		 829 aa  664    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  56.33 
 
 		 882 aa  748    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  57.59 
 
 		 834 aa  728    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  59.61 
 
 		 943 aa  779    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  61.8 
 
 		 985 aa  770    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  71.21 
 
 		 739 aa  874    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  51.28 
 
 		 949 aa  649    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3605  translation initiation factor IF-2  49.12 
 
 		 898 aa  635    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600034  normal  0.0461803 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  52.3 
 
 		 921 aa  654    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  59.31 
 
 		 692 aa  704    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  62.62 
 
 		 732 aa  922    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  56.51 
 
 		 980 aa  679    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  54.5 
 
 		 1079 aa  638    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 943 aa  644    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  55.77 
 
 		 890 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  55.77 
 
 		 890 aa  632  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  50.85 
 
 		 885 aa  632  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  55.77 
 
 		 890 aa  632  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  53.81 
 
 		 984 aa  633  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  48.46 
 
 		 880 aa  633  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3476  translation initiation factor IF-2  49.85 
 
 		 892 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  54.22 
 
 		 711 aa  634  1e-180  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0530  translation initiation factor IF-2  55.77 
 
 		 890 aa  632  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  decreased coverage  0.0000498988 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  55.77 
 
 		 890 aa  632  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02986  hypothetical protein  55.77 
 
 		 890 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.201323  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3464  translation initiation factor IF-2  55.77 
 
 		 890 aa  632  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345648 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3544  translation initiation factor IF-2  49.85 
 
 		 892 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3581  translation initiation factor IF-2  49.85 
 
 		 892 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.544549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  50.31 
 
 		 1059 aa  634  1e-180  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  50.85 
 
 		 885 aa  632  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  50.85 
 
 		 885 aa  632  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3475  translation initiation factor IF-2  49.85 
 
 		 892 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4489  translation initiation factor IF-2  55.77 
 
 		 890 aa  632  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  51 
 
 		 889 aa  633  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3643  translation initiation factor IF-2  49.85 
 
 		 892 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.102541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3603  translation initiation factor IF-2  55.77 
 
 		 890 aa  631  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  55.89 
 
 		 941 aa  631  1e-179  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  53.31 
 
 		 1183 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  50.4 
 
 		 986 aa  629  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  50.24 
 
 		 989 aa  629  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  50.39 
 
 		 884 aa  630  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  50.87 
 
 		 880 aa  628  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3465  translation initiation factor IF-2  50.52 
 
 		 905 aa  630  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  47.96 
 
 		 896 aa  632  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>