More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1662 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  54.36 
 
 		 880 aa  641    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  54.62 
 
 		 885 aa  645    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  56.08 
 
 		 975 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  61.58 
 
 		 883 aa  737    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  54.36 
 
 		 880 aa  641    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  53.65 
 
 		 896 aa  692    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  55.16 
 
 		 720 aa  687    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  47.97 
 
 		 882 aa  749    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  55.65 
 
 		 964 aa  645    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  57.33 
 
 		 686 aa  711    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  53.62 
 
 		 894 aa  636    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  58.8 
 
 		 971 aa  782    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  59.69 
 
 		 986 aa  719    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  48.26 
 
 		 959 aa  649    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  55.31 
 
 		 885 aa  645    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  57.12 
 
 		 1079 aa  671    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  57.17 
 
 		 686 aa  709    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  57.33 
 
 		 686 aa  709    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  57.33 
 
 		 686 aa  709    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  56.08 
 
 		 975 aa  653    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  54.7 
 
 		 880 aa  644    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  55.48 
 
 		 964 aa  646    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  53.87 
 
 		 992 aa  641    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  48.06 
 
 		 964 aa  650    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  55.5 
 
 		 904 aa  650    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  53.97 
 
 		 943 aa  653    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  55.31 
 
 		 966 aa  639    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  51.05 
 
 		 922 aa  655    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  52.23 
 
 		 885 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  56.42 
 
 		 972 aa  654    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  56.25 
 
 		 975 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  57.96 
 
 		 1131 aa  640    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  52.9 
 
 		 949 aa  694    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  54.36 
 
 		 880 aa  641    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  51.77 
 
 		 947 aa  694    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  54.75 
 
 		 972 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  55.75 
 
 		 738 aa  641    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  54.36 
 
 		 880 aa  641    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  58.26 
 
 		 689 aa  719    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1701  translation initiation factor IF-2  54.22 
 
 		 991 aa  636    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192656 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  60.89 
 
 		 884 aa  728    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  52 
 
 		 984 aa  667    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  57.17 
 
 		 686 aa  709    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  53.44 
 
 		 752 aa  645    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  54.48 
 
 		 898 aa  638    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  57.14 
 
 		 876 aa  653    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  57.33 
 
 		 686 aa  710    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  58.57 
 
 		 903 aa  773    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  56.25 
 
 		 976 aa  654    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  50.78 
 
 		 885 aa  645    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  54.28 
 
 		 705 aa  668    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  56.08 
 
 		 975 aa  653    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  55.08 
 
 		 971 aa  657    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  57.33 
 
 		 686 aa  711    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  54.47 
 
 		 907 aa  676    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  56.25 
 
 		 854 aa  660    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  55.16 
 
 		 989 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  58.29 
 
 		 688 aa  702    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  57.22 
 
 		 658 aa  664    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  60.99 
 
 		 985 aa  808    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2295  translation initiation factor IF-2  51.64 
 
 		 886 aa  645    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0792369 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  53.87 
 
 		 894 aa  635    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  54.9 
 
 		 979 aa  652    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  54.56 
 
 		 943 aa  649    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4217  translation initiation factor 2  48.99 
 
 		 1011 aa  639    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726068  normal  0.0540264 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  61.87 
 
 		 692 aa  740    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  56.25 
 
 		 975 aa  654    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  55.08 
 
 		 971 aa  657    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  54.19 
 
 		 965 aa  652    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  54.22 
 
 		 953 aa  642    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  48.45 
 
 		 1008 aa  639    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  58.28 
 
 		 679 aa  697    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  58.28 
 
 		 679 aa  697    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  54.28 
 
 		 705 aa  668    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  56.25 
 
 		 975 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  55.48 
 
 		 885 aa  647    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  55.48 
 
 		 885 aa  647    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  52.96 
 
 		 888 aa  836    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  54.99 
 
 		 968 aa  654    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  46.19 
 
 		 882 aa  728    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  57.48 
 
 		 1079 aa  659    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  56.42 
 
 		 971 aa  656    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  56.08 
 
 		 975 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  53.53 
 
 		 948 aa  636    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  48.26 
 
 		 990 aa  645    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  43.26 
 
 		 882 aa  659    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  54.99 
 
 		 986 aa  646    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  57.02 
 
 		 688 aa  704    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  60.46 
 
 		 1035 aa  689    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  55.08 
 
 		 971 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  57.62 
 
 		 962 aa  667    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  54.67 
 
 		 949 aa  648    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  55.38 
 
 		 889 aa  647    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  45.58 
 
 		 879 aa  648    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  55.15 
 
 		 673 aa  660    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  59.52 
 
 		 921 aa  708    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  56.08 
 
 		 969 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  52.22 
 
 		 887 aa  644    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0831  translation initiation factor IF-2  53.08 
 
 		 882 aa  645    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.857351  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  53.83 
 
 		 882 aa  651    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>