More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1658 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  58.08 
 
 		 882 aa  688    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  56.47 
 
 		 689 aa  751    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  56.48 
 
 		 883 aa  675    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  60.59 
 
 		 888 aa  721    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  55.65 
 
 		 997 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  53.69 
 
 		 738 aa  646    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  53.31 
 
 		 720 aa  732    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  55.64 
 
 		 686 aa  740    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  55.23 
 
 		 927 aa  642    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  53.15 
 
 		 1005 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  53.92 
 
 		 656 aa  637    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  55.35 
 
 		 686 aa  739    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  55.64 
 
 		 686 aa  741    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  55.64 
 
 		 686 aa  741    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  55.83 
 
 		 822 aa  705    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  53.44 
 
 		 1042 aa  635    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  59.22 
 
 		 1131 aa  712    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  54.89 
 
 		 752 aa  655    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  57.53 
 
 		 947 aa  679    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  60.96 
 
 		 845 aa  729    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  63.05 
 
 		 1035 aa  701    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  56.86 
 
 		 692 aa  806    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  56.95 
 
 		 884 aa  682    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  57.31 
 
 		 980 aa  682    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  55.35 
 
 		 686 aa  739    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  54.24 
 
 		 673 aa  697    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  56.05 
 
 		 1128 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  53.3 
 
 		 1030 aa  637    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  55.78 
 
 		 686 aa  741    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  59.12 
 
 		 903 aa  743    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  64.78 
 
 		 971 aa  765    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  61.26 
 
 		 1029 aa  740    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  52.45 
 
 		 920 aa  641    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  54.59 
 
 		 907 aa  644    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  57.14 
 
 		 986 aa  681    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  63.98 
 
 		 1161 aa  761    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  49.86 
 
 		 689 aa  638    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  56.76 
 
 		 711 aa  673    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  55.14 
 
 		 688 aa  738    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  56.98 
 
 		 686 aa  768    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  99.85 
 
 		 679 aa  1355    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 679 aa  1357    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  48.18 
 
 		 658 aa  635    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  62.91 
 
 		 732 aa  750    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  55.19 
 
 		 949 aa  648    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  56.41 
 
 		 882 aa  700    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  62.56 
 
 		 739 aa  743    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  55.06 
 
 		 686 aa  740    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  55.57 
 
 		 688 aa  740    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  54.83 
 
 		 962 aa  636    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  56.6 
 
 		 892 aa  649    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  57.26 
 
 		 921 aa  691    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3751  translation initiation factor IF-2  53.52 
 
 		 729 aa  645    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00372327  unclonable  0.0000243777 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  62.44 
 
 		 985 aa  773    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  60 
 
 		 860 aa  716    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0476  translation initiation factor IF-2  51.45 
 
 		 602 aa  632  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258534  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  53.74 
 
 		 924 aa  634  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  55.11 
 
 		 1079 aa  635  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1867  translation initiation factor IF-2  52.29 
 
 		 1038 aa  629  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16741  translation initiation factor IF-2  57.09 
 
 		 1161 aa  631  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  52.81 
 
 		 922 aa  625  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  55.15 
 
 		 969 aa  625  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  53.58 
 
 		 964 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  55.15 
 
 		 989 aa  627  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0993  translation initiation factor IF-2  47.77 
 
 		 668 aa  625  1e-178  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000676499  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  52.74 
 
 		 1059 aa  628  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  53.58 
 
 		 964 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  54.64 
 
 		 971 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  51.04 
 
 		 882 aa  626  1e-178  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  53.78 
 
 		 943 aa  627  1e-178  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  54.64 
 
 		 972 aa  624  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  54.02 
 
 		 971 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  54.37 
 
 		 964 aa  624  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  53.9 
 
 		 889 aa  624  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  54.81 
 
 		 975 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  54.98 
 
 		 975 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  54.98 
 
 		 975 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  53.69 
 
 		 904 aa  622  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  54.03 
 
 		 984 aa  624  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  54.81 
 
 		 975 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16981  translation initiation factor IF-2  55.71 
 
 		 1126 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  54.98 
 
 		 975 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  51.16 
 
 		 898 aa  622  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  54.53 
 
 		 986 aa  622  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  55.04 
 
 		 968 aa  624  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  54.81 
 
 		 975 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16851  translation initiation factor IF-2  55.88 
 
 		 1114 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  54.98 
 
 		 975 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  54.02 
 
 		 971 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  52.32 
 
 		 945 aa  623  1e-177  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  51.86 
 
 		 879 aa  625  1e-177  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  54.02 
 
 		 971 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  53.61 
 
 		 891 aa  622  1e-177  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  54.51 
 
 		 882 aa  624  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  54.51 
 
 		 1183 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  54.47 
 
 		 976 aa  619  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  53.81 
 
 		 965 aa  620  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  54.67 
 
 		 992 aa  619  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2357  translation initiation factor IF-2  52.65 
 
 		 1101 aa  619  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  54.2 
 
 		 889 aa  618  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>