More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1555 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  52.64 
 
 		 890 aa  665    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  52.64 
 
 		 890 aa  665    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  57.22 
 
 		 920 aa  660    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  55.57 
 
 		 883 aa  916    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  50.27 
 
 		 964 aa  676    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0255  translation initiation factor IF-2  43.17 
 
 		 979 aa  659    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  56.57 
 
 		 896 aa  682    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  57.54 
 
 		 720 aa  670    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  55.93 
 
 		 887 aa  665    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  53.13 
 
 		 964 aa  662    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  57.56 
 
 		 686 aa  676    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  51.34 
 
 		 889 aa  645    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3608  translation initiation factor IF-2  53.27 
 
 		 828 aa  636    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  51.92 
 
 		 880 aa  671    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  49.12 
 
 		 959 aa  678    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  52.76 
 
 		 885 aa  671    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  54.42 
 
 		 752 aa  659    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  57.22 
 
 		 686 aa  674    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  57.56 
 
 		 686 aa  675    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  57.56 
 
 		 686 aa  675    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  57.63 
 
 		 975 aa  671    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  55.52 
 
 		 868 aa  640    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  55.35 
 
 		 868 aa  639    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  49.12 
 
 		 990 aa  676    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3605  translation initiation factor IF-2  55.74 
 
 		 898 aa  660    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600034  normal  0.0461803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  53.74 
 
 		 904 aa  665    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  55.46 
 
 		 948 aa  653    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  53.09 
 
 		 896 aa  672    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  56.63 
 
 		 966 aa  652    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  49.38 
 
 		 922 aa  688    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  51.92 
 
 		 880 aa  670    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  57.46 
 
 		 975 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  50.78 
 
 		 845 aa  637    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  51.92 
 
 		 880 aa  670    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  52.64 
 
 		 890 aa  665    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 947 aa  1895    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0293  translation initiation factor IF-2  53.46 
 
 		 1083 aa  642    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00928073 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  55.43 
 
 		 884 aa  953    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  54.69 
 
 		 984 aa  724    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  51.11 
 
 		 956 aa  652    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  57.22 
 
 		 686 aa  674    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  52.42 
 
 		 943 aa  664    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  55.42 
 
 		 898 aa  666    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  54.61 
 
 		 876 aa  643    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  50.15 
 
 		 873 aa  664    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  57.12 
 
 		 903 aa  705    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  56.95 
 
 		 976 aa  666    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1102  translation initiation factor IF-2  54.59 
 
 		 950 aa  645    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.397412  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  55.13 
 
 		 886 aa  639    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  52.79 
 
 		 885 aa  664    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2134  translation initiation factor IF-2  54.47 
 
 		 978 aa  647    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149988  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  52.67 
 
 		 885 aa  679    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  53.91 
 
 		 880 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  43.77 
 
 		 907 aa  711    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  55.38 
 
 		 968 aa  653    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  55.43 
 
 		 989 aa  668    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  52.22 
 
 		 884 aa  668    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0231  translation initiation factor IF-2  55.13 
 
 		 883 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0340219  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  53.78 
 
 		 843 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0031  translation initiation factor IF-2  55.28 
 
 		 868 aa  642    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  54.67 
 
 		 985 aa  724    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  53.76 
 
 		 979 aa  676    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  49.35 
 
 		 854 aa  644    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4217  translation initiation factor 2  49.78 
 
 		 1011 aa  656    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726068  normal  0.0540264 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  52.28 
 
 		 835 aa  637    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  57.63 
 
 		 975 aa  671    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  57.17 
 
 		 1035 aa  644    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  53.31 
 
 		 869 aa  650    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  48.04 
 
 		 1008 aa  661    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  56.43 
 
 		 679 aa  667    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  56.43 
 
 		 679 aa  666    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  55.01 
 
 		 896 aa  671    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  54.93 
 
 		 970 aa  671    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  52.91 
 
 		 885 aa  673    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  52.91 
 
 		 885 aa  673    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  54.04 
 
 		 883 aa  647    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  52.23 
 
 		 881 aa  677    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  41.97 
 
 		 882 aa  678    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  54.67 
 
 		 887 aa  639    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  52.64 
 
 		 890 aa  665    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  57.46 
 
 		 975 aa  669    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  56.76 
 
 		 921 aa  666    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  52.4 
 
 		 834 aa  646    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3596  translation initiation factor IF-2  51.83 
 
 		 892 aa  646    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000160504  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  57.63 
 
 		 975 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  56.67 
 
 		 962 aa  748    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  53.79 
 
 		 949 aa  676    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  52.76 
 
 		 889 aa  671    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  56.77 
 
 		 705 aa  660    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  56.77 
 
 		 705 aa  660    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  59.63 
 
 		 921 aa  868    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  58.83 
 
 		 689 aa  687    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  51.99 
 
 		 895 aa  674    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  57.63 
 
 		 975 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  52.85 
 
 		 882 aa  676    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  54.55 
 
 		 880 aa  667    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  55.95 
 
 		 894 aa  678    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  52.66 
 
 		 848 aa  644    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  59.29 
 
 		 1079 aa  719    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  51.58 
 
 		 943 aa  669    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>