More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1309 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  56.75 
 
 		 890 aa  639    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  56.75 
 
 		 890 aa  639    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  61.18 
 
 		 883 aa  713    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  57.19 
 
 		 705 aa  660    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0255  translation initiation factor IF-2  45.45 
 
 		 979 aa  763    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  49.85 
 
 		 896 aa  664    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  56.09 
 
 		 720 aa  657    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  57.61 
 
 		 975 aa  657    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  55.68 
 
 		 964 aa  648    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  55.02 
 
 		 686 aa  650    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  54.89 
 
 		 889 aa  652    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  49.78 
 
 		 854 aa  654    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  57.19 
 
 		 705 aa  660    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  58.74 
 
 		 888 aa  646    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  55.75 
 
 		 885 aa  682    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3476  translation initiation factor IF-2  57.26 
 
 		 892 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  54.68 
 
 		 686 aa  647    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  54.68 
 
 		 686 aa  647    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  54.68 
 
 		 686 aa  647    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  57.78 
 
 		 975 aa  659    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  54.81 
 
 		 868 aa  640    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  54.64 
 
 		 868 aa  639    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  56.75 
 
 		 890 aa  639    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  57.44 
 
 		 969 aa  655    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  56.24 
 
 		 904 aa  638    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  58.31 
 
 		 936 aa  755    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  56.75 
 
 		 965 aa  651    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  56.07 
 
 		 922 aa  642    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  51.81 
 
 		 985 aa  660    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3603  translation initiation factor IF-2  56.75 
 
 		 890 aa  639    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  57.61 
 
 		 975 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3581  translation initiation factor IF-2  57.26 
 
 		 892 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.544549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  56.78 
 
 		 894 aa  669    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  55.5 
 
 		 689 aa  658    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  44.29 
 
 		 947 aa  670    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  56.24 
 
 		 972 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  57.52 
 
 		 915 aa  757    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  47.26 
 
 		 1022 aa  731    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  58.69 
 
 		 1079 aa  694    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  55.45 
 
 		 984 aa  675    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  56.75 
 
 		 972 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  54.68 
 
 		 686 aa  647    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  56.41 
 
 		 971 aa  650    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  59.45 
 
 		 882 aa  691    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  58.61 
 
 		 876 aa  654    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  53.2 
 
 		 688 aa  637    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  61.86 
 
 		 903 aa  700    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  57.44 
 
 		 976 aa  654    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  52.4 
 
 		 880 aa  659    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01760  translation initiation factor IF-2  54.79 
 
 		 868 aa  643    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  57.78 
 
 		 975 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  57.78 
 
 		 975 aa  659    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  56.01 
 
 		 964 aa  654    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  55.84 
 
 		 894 aa  657    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  55.59 
 
 		 880 aa  677    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  56.06 
 
 		 907 aa  672    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  55.59 
 
 		 880 aa  677    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  56.75 
 
 		 989 aa  654    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  54.31 
 
 		 884 aa  667    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  59.46 
 
 		 956 aa  777    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  55.9 
 
 		 843 aa  647    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  55.41 
 
 		 885 aa  676    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  57.61 
 
 		 975 aa  658    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  54.92 
 
 		 979 aa  649    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  56.72 
 
 		 898 aa  665    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  52.16 
 
 		 895 aa  665    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  56.75 
 
 		 890 aa  639    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  58.1 
 
 		 692 aa  692    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  56.41 
 
 		 971 aa  650    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  59.27 
 
 		 949 aa  680    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  54.49 
 
 		 869 aa  647    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0139  translation initiation factor IF-2  47.25 
 
 		 908 aa  757    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  55.87 
 
 		 1008 aa  743    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3464  translation initiation factor IF-2  56.75 
 
 		 890 aa  639    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345648 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0530  translation initiation factor IF-2  56.75 
 
 		 890 aa  639    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  decreased coverage  0.0000498988 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  56.8 
 
 		 831 aa  651    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  57.78 
 
 		 975 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  55.92 
 
 		 885 aa  682    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  55.92 
 
 		 885 aa  682    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  45.83 
 
 		 911 aa  744    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  53.5 
 
 		 881 aa  663    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  56.94 
 
 		 854 aa  647    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3544  translation initiation factor IF-2  57.26 
 
 		 892 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  56.75 
 
 		 971 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  57.05 
 
 		 952 aa  741    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  56.58 
 
 		 986 aa  650    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  53.08 
 
 		 885 aa  640    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  55.75 
 
 		 880 aa  682    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  56.7 
 
 		 896 aa  669    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  56.41 
 
 		 971 aa  650    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  53.49 
 
 		 962 aa  691    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  54.04 
 
 		 949 aa  644    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  55.92 
 
 		 889 aa  683    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0398  translation initiation factor IF-2  60.2 
 
 		 986 aa  737    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0010836  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  56.43 
 
 		 896 aa  671    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  56 
 
 		 921 aa  694    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  57.37 
 
 		 991 aa  741    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  55.59 
 
 		 880 aa  677    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  54.28 
 
 		 943 aa  638    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  55.36 
 
 		 882 aa  677    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>