More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3853 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  55.44 
 
 		 883 aa  690    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  55.03 
 
 		 997 aa  680    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  53.52 
 
 		 986 aa  685    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  52.21 
 
 		 896 aa  637    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  53.94 
 
 		 980 aa  682    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  53.34 
 
 		 940 aa  639    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  57.02 
 
 		 947 aa  698    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  55.2 
 
 		 970 aa  646    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  54.44 
 
 		 884 aa  683    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  50.35 
 
 		 903 aa  654    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  52.06 
 
 		 884 aa  635    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  55.16 
 
 		 882 aa  685    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  56.33 
 
 		 822 aa  641    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 1058 aa  2100    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  54.19 
 
 		 949 aa  668    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  55.71 
 
 		 1079 aa  661    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  53.91 
 
 		 962 aa  657    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  51.64 
 
 		 885 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  53.86 
 
 		 921 aa  671    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  52.62 
 
 		 892 aa  664    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  56.39 
 
 		 1079 aa  687    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1034  translation initiation factor IF-2  50.9 
 
 		 774 aa  635  1e-180  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0725  translation initiation factor IF-2  52.16 
 
 		 912 aa  635  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0457048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  51.59 
 
 		 881 aa  633  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1230  translation initiation factor IF-2  54.17 
 
 		 951 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0683246  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  51.8 
 
 		 985 aa  629  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  54.22 
 
 		 894 aa  631  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  49.85 
 
 		 907 aa  632  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  54.97 
 
 		 845 aa  629  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  51.51 
 
 		 880 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  51.51 
 
 		 880 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  51.51 
 
 		 880 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  50.72 
 
 		 979 aa  627  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  51.51 
 
 		 880 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  50.31 
 
 		 971 aa  628  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  51.2 
 
 		 964 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  51.36 
 
 		 964 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  51.35 
 
 		 880 aa  627  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  54.16 
 
 		 924 aa  627  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  51.75 
 
 		 896 aa  625  1e-177  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  50.39 
 
 		 922 aa  624  1e-177  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  53.16 
 
 		 896 aa  622  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  51.18 
 
 		 885 aa  624  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  51.18 
 
 		 885 aa  624  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  52.87 
 
 		 732 aa  623  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  53.57 
 
 		 692 aa  624  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  50.86 
 
 		 889 aa  622  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  50.71 
 
 		 885 aa  622  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  51.34 
 
 		 904 aa  619  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  51.6 
 
 		 975 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 		 989 aa  620  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  51.6 
 
 		 975 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  50.4 
 
 		 971 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  51.44 
 
 		 975 aa  618  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  51.44 
 
 		 975 aa  618  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  51.44 
 
 		 975 aa  618  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  51.44 
 
 		 975 aa  618  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  51.44 
 
 		 976 aa  618  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  50.4 
 
 		 971 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  51.6 
 
 		 969 aa  617  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  51.6 
 
 		 975 aa  619  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  50.4 
 
 		 971 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  50.72 
 
 		 964 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  53.12 
 
 		 894 aa  615  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  53.24 
 
 		 968 aa  615  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  52.22 
 
 		 965 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  51.12 
 
 		 972 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01760  translation initiation factor IF-2  52.32 
 
 		 868 aa  614  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  51.64 
 
 		 986 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1102  translation initiation factor IF-2  54.34 
 
 		 950 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.397412  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 		 1161 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  50.96 
 
 		 971 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  50.16 
 
 		 882 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  51.6 
 
 		 992 aa  610  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  52.48 
 
 		 984 aa  611  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  49.4 
 
 		 888 aa  609  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  50.24 
 
 		 972 aa  610  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  49.06 
 
 		 956 aa  610  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  52.43 
 
 		 898 aa  610  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  52.41 
 
 		 843 aa  609  1e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  50.94 
 
 		 739 aa  611  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  48.03 
 
 		 882 aa  609  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  51.22 
 
 		 902 aa  610  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  45.86 
 
 		 845 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  48.63 
 
 		 943 aa  607  9.999999999999999e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  50.73 
 
 		 860 aa  606  9.999999999999999e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  49.68 
 
 		 880 aa  607  9.999999999999999e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  52.54 
 
 		 853 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  52.75 
 
 		 868 aa  603  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  52.43 
 
 		 891 aa  603  1.0000000000000001e-171  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  52.49 
 
 		 875 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  52.49 
 
 		 875 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  51.28 
 
 		 876 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3346  translation initiation factor IF-2  50.86 
 
 		 901 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.12411  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  49.23 
 
 		 968 aa  604  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  51.32 
 
 		 869 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  50.46 
 
 		 949 aa  605  1.0000000000000001e-171  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3035  translation initiation factor IF-2  51.77 
 
 		 884 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.19789  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  49.15 
 
 		 945 aa  603  1.0000000000000001e-171  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  50.41 
 
 		 848 aa  604  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>