More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1155 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  55.9 
 
 		 738 aa  647    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  52.42 
 
 		 894 aa  644    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  70.22 
 
 		 686 aa  995    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  54.59 
 
 		 883 aa  699    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  50.68 
 
 		 880 aa  637    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  56.3 
 
 		 896 aa  654    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  63.44 
 
 		 720 aa  927    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  61.74 
 
 		 1131 aa  706    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  55.01 
 
 		 964 aa  654    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  70.49 
 
 		 686 aa  999    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  53.79 
 
 		 889 aa  640    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  55.46 
 
 		 975 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  64.36 
 
 		 927 aa  778    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  55.87 
 
 		 969 aa  648    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  55.39 
 
 		 965 aa  651    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  69.95 
 
 		 686 aa  993    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  70.36 
 
 		 686 aa  996    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl295  translation initiation factor IF-2  56.21 
 
 		 629 aa  638    Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000364465  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  70.36 
 
 		 686 aa  996    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  55.46 
 
 		 975 aa  654    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  54.7 
 
 		 952 aa  646    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1701  translation initiation factor IF-2  55.23 
 
 		 991 aa  645    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2749  translation initiation factor IF-2  54.67 
 
 		 990 aa  637    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.867679  normal  0.130193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  54.44 
 
 		 904 aa  635    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3035  translation initiation factor IF-2  49.7 
 
 		 884 aa  637    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.19789  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  56.26 
 
 		 966 aa  649    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  56.16 
 
 		 922 aa  672    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1867  translation initiation factor IF-2  56.13 
 
 		 1038 aa  644    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  55.3 
 
 		 975 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  56.12 
 
 		 986 aa  658    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  54.81 
 
 		 972 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  57.31 
 
 		 947 aa  699    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  55.23 
 
 		 972 aa  647    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  54.97 
 
 		 915 aa  643    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  50.98 
 
 		 895 aa  644    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  54.88 
 
 		 1022 aa  637    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  72.23 
 
 		 705 aa  863    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  54.41 
 
 		 884 aa  699    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  58.79 
 
 		 984 aa  682    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  69.95 
 
 		 686 aa  993    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  56.6 
 
 		 936 aa  664    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  55.27 
 
 		 911 aa  642    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  55.63 
 
 		 949 aa  680    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3751  translation initiation factor IF-2  56.07 
 
 		 729 aa  648    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00372327  unclonable  0.0000243777 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  47.82 
 
 		 873 aa  639    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  56.08 
 
 		 903 aa  767    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  55.3 
 
 		 976 aa  651    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  55.46 
 
 		 975 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  55.57 
 
 		 953 aa  655    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  70.63 
 
 		 686 aa  998    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  66.08 
 
 		 1035 aa  717    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  55.71 
 
 		 943 aa  653    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  56.7 
 
 		 907 aa  674    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  56.23 
 
 		 968 aa  639    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  55.45 
 
 		 989 aa  657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  55.2 
 
 		 968 aa  647    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  55.46 
 
 		 975 aa  654    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  60.21 
 
 		 888 aa  717    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  72.23 
 
 		 705 aa  863    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  54.99 
 
 		 979 aa  657    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  55.59 
 
 		 882 aa  701    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  54.11 
 
 		 1042 aa  638    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  60.9 
 
 		 985 aa  776    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  54.9 
 
 		 971 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  50.95 
 
 		 689 aa  675    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  55.17 
 
 		 887 aa  635    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  51.21 
 
 		 898 aa  646    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  56.77 
 
 		 692 aa  785    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  62.61 
 
 		 679 aa  742    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  62.61 
 
 		 679 aa  743    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  69.89 
 
 		 688 aa  990    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  54.13 
 
 		 1059 aa  639    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  51.56 
 
 		 673 aa  708    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  54.68 
 
 		 964 aa  654    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  52.93 
 
 		 883 aa  638    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  58.75 
 
 		 928 aa  647    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  56.36 
 
 		 882 aa  742    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  54.81 
 
 		 971 aa  649    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  55.3 
 
 		 975 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0817  translation initiation factor IF-2  61.6 
 
 		 950 aa  749    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0433  translation initiation factor IF-2  58.54 
 
 		 829 aa  720    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  62.44 
 
 		 882 aa  786    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  60.42 
 
 		 834 aa  750    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  66.16 
 
 		 943 aa  790    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  55.21 
 
 		 948 aa  642    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  54.9 
 
 		 971 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  51.34 
 
 		 962 aa  653    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  55.17 
 
 		 949 aa  679    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  55.96 
 
 		 854 aa  650    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  54.9 
 
 		 971 aa  648    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  52.45 
 
 		 875 aa  642    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  53.28 
 
 		 921 aa  689    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  54.97 
 
 		 991 aa  643    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  57.48 
 
 		 752 aa  841    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  53.51 
 
 		 986 aa  696    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  54.03 
 
 		 882 aa  636    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  71.49 
 
 		 689 aa  1011    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  55.3 
 
 		 975 aa  652    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  59.42 
 
 		 1079 aa  694    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  53.67 
 
 		 943 aa  652    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>