More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0570 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  59 
 
 		 732 aa  679    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  54.72 
 
 		 882 aa  662    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  53.54 
 
 		 883 aa  656    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  56.16 
 
 		 689 aa  648    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  54.53 
 
 		 720 aa  649    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  55.48 
 
 		 686 aa  637    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  54.61 
 
 		 705 aa  645    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  55.48 
 
 		 686 aa  637    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  54.44 
 
 		 980 aa  650    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  52.21 
 
 		 945 aa  652    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  55.63 
 
 		 888 aa  642    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  55.63 
 
 		 947 aa  655    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  62.48 
 
 		 854 aa  726    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  54.61 
 
 		 705 aa  645    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  43.6 
 
 		 884 aa  656    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  54.05 
 
 		 822 aa  659    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  58.13 
 
 		 860 aa  660    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  54.88 
 
 		 686 aa  647    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  55.56 
 
 		 924 aa  659    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  49.31 
 
 		 903 aa  669    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  52.54 
 
 		 907 aa  640    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 928 aa  1798    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  58.93 
 
 		 1035 aa  645    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  59.35 
 
 		 692 aa  694    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  53.11 
 
 		 679 aa  643    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  53.28 
 
 		 679 aa  644    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  58.58 
 
 		 739 aa  676    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  53.08 
 
 		 892 aa  638    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  51.59 
 
 		 1029 aa  661    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  42.26 
 
 		 882 aa  656    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  48.32 
 
 		 985 aa  658    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  52.04 
 
 		 949 aa  657    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  53.33 
 
 		 921 aa  643    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  56.05 
 
 		 1161 aa  677    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  57.22 
 
 		 971 aa  670    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  54.44 
 
 		 986 aa  650    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  49.51 
 
 		 845 aa  691    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  53.23 
 
 		 1079 aa  636    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  54.97 
 
 		 686 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  55.14 
 
 		 686 aa  634  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  55.14 
 
 		 686 aa  634  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  53.71 
 
 		 686 aa  634  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  54.97 
 
 		 686 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  53.57 
 
 		 997 aa  630  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  51.95 
 
 		 673 aa  631  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  54.19 
 
 		 688 aa  630  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  53.58 
 
 		 989 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  48.32 
 
 		 1131 aa  627  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  54.68 
 
 		 922 aa  628  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  53.26 
 
 		 986 aa  625  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  51.87 
 
 		 875 aa  625  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0993  translation initiation factor IF-2  60.32 
 
 		 668 aa  624  1e-177  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000676499  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4217  translation initiation factor 2  53.48 
 
 		 1011 aa  624  1e-177  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726068  normal  0.0540264 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  51.87 
 
 		 875 aa  625  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  50.47 
 
 		 943 aa  625  1e-177  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  53.48 
 
 		 962 aa  625  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  52.75 
 
 		 898 aa  623  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  53.09 
 
 		 975 aa  622  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  52.85 
 
 		 658 aa  622  1e-176  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  52.93 
 
 		 975 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  53.09 
 
 		 975 aa  622  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  52.7 
 
 		 979 aa  620  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  52.93 
 
 		 975 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  53.09 
 
 		 975 aa  622  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  50.31 
 
 		 895 aa  621  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  53.09 
 
 		 975 aa  622  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  54.4 
 
 		 688 aa  620  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0255  translation initiation factor IF-2  50.49 
 
 		 979 aa  617  1e-175  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  52.93 
 
 		 975 aa  619  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  51.86 
 
 		 936 aa  616  1e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  52.61 
 
 		 971 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  53.63 
 
 		 879 aa  616  1e-175  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  53.46 
 
 		 948 aa  617  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  53.57 
 
 		 1079 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  52.77 
 
 		 969 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  54.27 
 
 		 971 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  53.07 
 
 		 968 aa  614  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  52.82 
 
 		 711 aa  615  9.999999999999999e-175  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  51.88 
 
 		 894 aa  615  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  50.82 
 
 		 956 aa  614  9.999999999999999e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  52.79 
 
 		 949 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  52.61 
 
 		 976 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1034  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 774 aa  613  9.999999999999999e-175  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  54.27 
 
 		 971 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  52.44 
 
 		 972 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  52.28 
 
 		 965 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  54.27 
 
 		 971 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  51.79 
 
 		 943 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  53.28 
 
 		 964 aa  610  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  52.21 
 
 		 885 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  50.41 
 
 		 915 aa  609  1e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  52.38 
 
 		 885 aa  612  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0141  translation initiation factor IF-2  50.81 
 
 		 1010 aa  609  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  51.88 
 
 		 884 aa  610  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  53.08 
 
 		 992 aa  612  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  52.05 
 
 		 881 aa  612  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  46.57 
 
 		 882 aa  612  1e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  52.21 
 
 		 889 aa  609  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  50.87 
 
 		 879 aa  612  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  53.08 
 
 		 984 aa  610  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>