More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1355 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  60.68 
 
 		 720 aa  716    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  59.64 
 
 		 686 aa  716    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  51.07 
 
 		 927 aa  744    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  59.31 
 
 		 686 aa  713    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  59.47 
 
 		 686 aa  715    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  59.47 
 
 		 686 aa  715    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  59.76 
 
 		 705 aa  692    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  53.08 
 
 		 1029 aa  635    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  47.07 
 
 		 985 aa  665    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  55.38 
 
 		 947 aa  644    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  62.52 
 
 		 739 aa  738    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  67.18 
 
 		 752 aa  879    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  59.31 
 
 		 686 aa  713    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  62.56 
 
 		 732 aa  750    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  54.26 
 
 		 1161 aa  644    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  59.64 
 
 		 686 aa  716    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  59.97 
 
 		 689 aa  722    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  60.3 
 
 		 688 aa  711    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  61.06 
 
 		 686 aa  713    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  60.38 
 
 		 688 aa  708    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0817  translation initiation factor IF-2  58.58 
 
 		 950 aa  728    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0433  translation initiation factor IF-2  60.54 
 
 		 829 aa  969    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  55.22 
 
 		 882 aa  830    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 834 aa  1697    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  62.84 
 
 		 943 aa  739    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  58.67 
 
 		 860 aa  674    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  59.76 
 
 		 705 aa  692    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  56.39 
 
 		 845 aa  634  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  48.87 
 
 		 986 aa  630  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  47.6 
 
 		 903 aa  632  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  42.57 
 
 		 882 aa  631  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  53.27 
 
 		 971 aa  629  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  56.91 
 
 		 1035 aa  623  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  53 
 
 		 822 aa  624  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  48.27 
 
 		 980 aa  623  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  52.28 
 
 		 888 aa  615  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  49.27 
 
 		 883 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  49.76 
 
 		 882 aa  611  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  48.94 
 
 		 884 aa  609  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  49.45 
 
 		 949 aa  609  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  52.71 
 
 		 907 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  53.77 
 
 		 920 aa  607  9.999999999999999e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  52.18 
 
 		 692 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  48.57 
 
 		 984 aa  598  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  49.59 
 
 		 945 aa  598  1e-169  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  45.44 
 
 		 921 aa  597  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  51.53 
 
 		 1079 aa  596  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  47.97 
 
 		 971 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  51.54 
 
 		 979 aa  594  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  51.74 
 
 		 948 aa  593  1e-168  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  47.64 
 
 		 904 aa  590  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  47.97 
 
 		 971 aa  592  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  47.97 
 
 		 971 aa  592  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  52.23 
 
 		 686 aa  591  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  51.44 
 
 		 964 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  51.61 
 
 		 964 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  50.49 
 
 		 1131 aa  586  1e-166  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  49.14 
 
 		 975 aa  588  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  49.14 
 
 		 975 aa  588  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  48.98 
 
 		 975 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  48.98 
 
 		 975 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  47.73 
 
 		 892 aa  587  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  49.14 
 
 		 975 aa  588  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  49.14 
 
 		 975 aa  588  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  48.98 
 
 		 975 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  50.77 
 
 		 679 aa  587  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  50.77 
 
 		 679 aa  588  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  49.69 
 
 		 962 aa  587  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1701  translation initiation factor IF-2  51.92 
 
 		 991 aa  587  1e-166  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192656 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 969 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  48.67 
 
 		 976 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 989 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  49.6 
 
 		 949 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 986 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  50.61 
 
 		 964 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  50.7 
 
 		 894 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 971 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0285  translation initiation factor IF-2  51.67 
 
 		 954 aa  582  1.0000000000000001e-165  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  52.71 
 
 		 879 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  48.19 
 
 		 898 aa  585  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  51.19 
 
 		 964 aa  581  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  50.43 
 
 		 959 aa  582  1e-164  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  52.08 
 
 		 879 aa  579  1e-164  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  47.05 
 
 		 972 aa  579  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  47.5 
 
 		 902 aa  579  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  50.43 
 
 		 990 aa  581  1e-164  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 972 aa  582  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  51.26 
 
 		 924 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 		 997 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  51.12 
 
 		 673 aa  575  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  51.13 
 
 		 922 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  45.36 
 
 		 845 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  51.06 
 
 		 965 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  48.3 
 
 		 992 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  48.47 
 
 		 943 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  50.43 
 
 		 970 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2295  translation initiation factor IF-2  47.57 
 
 		 886 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0792369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 917 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  50.09 
 
 		 953 aa  578  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  49.32 
 
 		 943 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>