More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0830 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  54.64 
 
 		 686 aa  642    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  52.03 
 
 		 883 aa  656    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  54.92 
 
 		 686 aa  644    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  53.22 
 
 		 971 aa  647    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  54.58 
 
 		 686 aa  641    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  54.75 
 
 		 686 aa  643    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  54.75 
 
 		 686 aa  643    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  51.2 
 
 		 941 aa  834    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  44.07 
 
 		 860 aa  642    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  56.82 
 
 		 732 aa  669    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08040  translation initiation factor IF-2  65.7 
 
 		 929 aa  806    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13732  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  55.73 
 
 		 884 aa  656    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  54.58 
 
 		 686 aa  641    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  52.52 
 
 		 885 aa  636    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  54.3 
 
 		 688 aa  637    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  58.25 
 
 		 903 aa  660    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  55.63 
 
 		 692 aa  644    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  54.5 
 
 		 689 aa  644    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  57.02 
 
 		 739 aa  655    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  54.92 
 
 		 686 aa  644    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  42.27 
 
 		 882 aa  650    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  59.63 
 
 		 920 aa  862    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 879 aa  1767    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  47.66 
 
 		 894 aa  643    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  48.5 
 
 		 986 aa  634  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  54.56 
 
 		 705 aa  634  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  54.56 
 
 		 705 aa  634  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  46.23 
 
 		 1161 aa  631  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  54.61 
 
 		 1029 aa  629  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  54.51 
 
 		 882 aa  629  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  51.84 
 
 		 902 aa  631  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  54.3 
 
 		 688 aa  631  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  41.47 
 
 		 882 aa  631  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  53.3 
 
 		 980 aa  632  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  54.86 
 
 		 720 aa  625  1e-178  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  55.4 
 
 		 924 aa  629  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  47.16 
 
 		 898 aa  626  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  53.54 
 
 		 896 aa  627  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  55.67 
 
 		 854 aa  628  1e-178  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  53.46 
 
 		 896 aa  625  1e-177  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  54.16 
 
 		 885 aa  624  1e-177  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  53.66 
 
 		 947 aa  624  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  54.58 
 
 		 845 aa  624  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  56.38 
 
 		 689 aa  624  1e-177  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  45.97 
 
 		 881 aa  622  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  53.53 
 
 		 880 aa  624  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  51.13 
 
 		 896 aa  622  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  49.7 
 
 		 895 aa  622  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  53.01 
 
 		 885 aa  622  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  54.67 
 
 		 975 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  54.67 
 
 		 975 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  54.33 
 
 		 976 aa  620  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  53.02 
 
 		 884 aa  621  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  54.67 
 
 		 975 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  54.56 
 
 		 979 aa  620  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  54.67 
 
 		 975 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  50.8 
 
 		 894 aa  619  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  53.01 
 
 		 885 aa  621  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  53.01 
 
 		 885 aa  621  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  53.01 
 
 		 889 aa  620  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  53.4 
 
 		 879 aa  619  1e-176  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  52.45 
 
 		 949 aa  617  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  54.5 
 
 		 975 aa  618  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  53.82 
 
 		 686 aa  616  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  53.01 
 
 		 880 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  54.5 
 
 		 975 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1034  translation initiation factor IF-2  50.56 
 
 		 774 aa  618  1e-175  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  53.01 
 
 		 880 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  53.01 
 
 		 880 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  53.01 
 
 		 880 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  53.15 
 
 		 891 aa  616  1e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  54.5 
 
 		 975 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  44.59 
 
 		 964 aa  616  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  54.4 
 
 		 965 aa  616  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  53.26 
 
 		 882 aa  618  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7742  translation initiation factor IF-2  55.13 
 
 		 1051 aa  613  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3346  translation initiation factor IF-2  46.29 
 
 		 901 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.12411  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  54.41 
 
 		 964 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  45.47 
 
 		 752 aa  613  9.999999999999999e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  55.71 
 
 		 1035 aa  615  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  54.81 
 
 		 964 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  53.65 
 
 		 971 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  52.5 
 
 		 822 aa  613  9.999999999999999e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  53.82 
 
 		 971 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  53.65 
 
 		 971 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3190  translation initiation factor IF-2  53.55 
 
 		 938 aa  613  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  54.81 
 
 		 964 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  53.89 
 
 		 986 aa  611  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  52.87 
 
 		 936 aa  610  1e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  53.65 
 
 		 971 aa  612  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  48.31 
 
 		 892 aa  610  1e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  50 
 
 		 907 aa  609  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  53.71 
 
 		 989 aa  611  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  53.99 
 
 		 969 aa  610  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  53.15 
 
 		 997 aa  612  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  51.94 
 
 		 943 aa  612  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  51.84 
 
 		 972 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  43.65 
 
 		 959 aa  606  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  51.06 
 
 		 991 aa  608  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  52.93 
 
 		 1079 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>