More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1515 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5834  translation initiation factor IF-2  72.28 
 
 		 1034 aa  898    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1510  translation initiation factor IF-2  70.96 
 
 		 957 aa  889    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1743  translation initiation factor IF-2  65.45 
 
 		 975 aa  844    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.695409  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23450  translation initiation factor 2  71.74 
 
 		 939 aa  895    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0250989  normal  0.0490514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3966  translation initiation factor IF-2  73.89 
 
 		 998 aa  933    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.602986  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0285  translation initiation factor IF-2  64.66 
 
 		 954 aa  834    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2116  translation initiation factor IF-2  76.03 
 
 		 1051 aa  976    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1715  translation initiation factor IF-2  70.78 
 
 		 934 aa  898    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11480  translation initiation factor 2  56.88 
 
 		 969 aa  958    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21089  normal  0.867698 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1443  translation initiation factor IF-2  71.38 
 
 		 1044 aa  909    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1211  translation initiation factor IF-2  70.19 
 
 		 951 aa  879    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186812  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0778  translation initiation factor IF-2  73.24 
 
 		 955 aa  923    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1182  translation initiation factor IF-2  77.39 
 
 		 1046 aa  960    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3592  translation initiation factor IF-2  71.61 
 
 		 1012 aa  910    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1061  translation initiation factor IF-2  79.06 
 
 		 961 aa  993    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271136  normal  0.0744531 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  45.11 
 
 		 903 aa  650    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  55.54 
 
 		 1029 aa  639    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3562  translation initiation factor IF-2  76.95 
 
 		 1062 aa  929    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  55.24 
 
 		 692 aa  642    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12854  translation initiation factor IF-2  71.88 
 
 		 900 aa  914    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000971271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7742  translation initiation factor IF-2  73.92 
 
 		 1051 aa  939    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2152  translation initiation factor IF-2  71.86 
 
 		 938 aa  899    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0901193  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1327  translation initiation factor IF-2  71.56 
 
 		 995 aa  877    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4039  translation initiation factor IF-2  71.41 
 
 		 930 aa  924    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.681084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2082  translation initiation factor IF-2  71.56 
 
 		 920 aa  902    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2489  translation initiation factor IF-2  70.61 
 
 		 956 aa  881    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.872607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2065  translation initiation factor IF-2  71.56 
 
 		 920 aa  902    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.636635  normal  0.928572 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10320  translation initiation factor 2  56.98 
 
 		 957 aa  936    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0686977  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  55.76 
 
 		 920 aa  641    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  43.14 
 
 		 882 aa  641    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2207  translation initiation factor IF-2  73.08 
 
 		 612 aa  901    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537417  decreased coverage  0.000616715 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07010  translation initiation factor 2  69.86 
 
 		 930 aa  854    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1416  translation initiation factor IF-2  69.21 
 
 		 968 aa  889    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.919668  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1426  translation initiation factor IF-2  68.43 
 
 		 954 aa  880    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000203462 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 879 aa  1724    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1370  translation initiation factor IF-2  71.68 
 
 		 999 aa  879    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.515442  normal  0.133918 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3190  translation initiation factor IF-2  72.34 
 
 		 938 aa  901    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2128  translation initiation factor IF-2  71.56 
 
 		 920 aa  902    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524074  normal  0.0207369 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2314  translation initiation factor IF-2  71.41 
 
 		 930 aa  908    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596134  normal  0.0338999 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  55.67 
 
 		 822 aa  630  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  54.59 
 
 		 732 aa  628  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  49.67 
 
 		 888 aa  627  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  55.48 
 
 		 845 aa  627  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  56.81 
 
 		 924 aa  626  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  44.67 
 
 		 860 aa  625  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  54.33 
 
 		 739 aa  623  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  56.06 
 
 		 885 aa  623  1e-177  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  51.7 
 
 		 884 aa  619  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  43.36 
 
 		 882 aa  621  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  51.7 
 
 		 883 aa  619  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  55.11 
 
 		 879 aa  616  1e-175  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  47.88 
 
 		 947 aa  615  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  50.46 
 
 		 949 aa  617  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  51.85 
 
 		 1161 aa  609  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  49.39 
 
 		 907 aa  609  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  49.18 
 
 		 986 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  51.39 
 
 		 971 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  46.34 
 
 		 980 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  46.23 
 
 		 921 aa  608  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  49.85 
 
 		 922 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  46.66 
 
 		 956 aa  604  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  51.09 
 
 		 936 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  51.42 
 
 		 720 aa  599  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  51.43 
 
 		 885 aa  601  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  50.92 
 
 		 971 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  51.78 
 
 		 854 aa  601  1e-170  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  50.92 
 
 		 971 aa  601  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  50.92 
 
 		 971 aa  601  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  51.43 
 
 		 882 aa  599  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  53.12 
 
 		 1079 aa  600  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  51.96 
 
 		 686 aa  595  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  53.02 
 
 		 975 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  53.02 
 
 		 975 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  53.06 
 
 		 895 aa  597  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  53.02 
 
 		 975 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  50.92 
 
 		 972 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  48.75 
 
 		 915 aa  598  1e-169  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  50.92 
 
 		 843 aa  597  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  50.15 
 
 		 979 aa  597  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  53.02 
 
 		 975 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  51.96 
 
 		 686 aa  595  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  52.64 
 
 		 898 aa  598  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  51.96 
 
 		 689 aa  598  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  51.43 
 
 		 885 aa  596  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  51.43 
 
 		 885 aa  596  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  48.77 
 
 		 880 aa  597  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  51.43 
 
 		 889 aa  598  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  51.09 
 
 		 911 aa  598  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  44.67 
 
 		 985 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  48.31 
 
 		 880 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  50.92 
 
 		 896 aa  593  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  52.85 
 
 		 975 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  48.31 
 
 		 880 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  52.85 
 
 		 975 aa  595  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  48.31 
 
 		 880 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  52.85 
 
 		 975 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  50.99 
 
 		 686 aa  595  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  52.61 
 
 		 997 aa  593  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  50.59 
 
 		 991 aa  593  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 1058 aa  593  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.329833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>