More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10320 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1327  translation initiation factor IF-2  67.3 
 
 		 995 aa  843    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335521 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1510  translation initiation factor IF-2  76.74 
 
 		 957 aa  976    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12854  translation initiation factor IF-2  66.61 
 
 		 900 aa  842    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000971271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5834  translation initiation factor IF-2  65.57 
 
 		 1034 aa  825    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11480  translation initiation factor 2  78.35 
 
 		 969 aa  1002    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21089  normal  0.867698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14570  translation initiation factor 2  65.51 
 
 		 938 aa  849    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00182457  normal  0.54145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3592  translation initiation factor IF-2  66.93 
 
 		 1012 aa  857    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0778  translation initiation factor IF-2  66.88 
 
 		 955 aa  864    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425771  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2065  translation initiation factor IF-2  67.55 
 
 		 920 aa  836    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.636635  normal  0.928572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7742  translation initiation factor IF-2  69.54 
 
 		 1051 aa  884    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23450  translation initiation factor 2  75.5 
 
 		 939 aa  953    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0250989  normal  0.0490514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1182  translation initiation factor IF-2  65.34 
 
 		 1046 aa  816    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2489  translation initiation factor IF-2  73.76 
 
 		 956 aa  929    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.872607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3562  translation initiation factor IF-2  65.02 
 
 		 1062 aa  790    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07010  translation initiation factor 2  72.67 
 
 		 930 aa  909    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1019  translation initiation factor IF-2  60.45 
 
 		 1004 aa  1023    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2082  translation initiation factor IF-2  67.55 
 
 		 920 aa  836    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3966  translation initiation factor IF-2  64.68 
 
 		 998 aa  837    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.602986  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1211  translation initiation factor IF-2  75.35 
 
 		 951 aa  957    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186812  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1443  translation initiation factor IF-2  75.74 
 
 		 1044 aa  978    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10320  translation initiation factor 2  100 
 
 		 957 aa  1884    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0686977  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1370  translation initiation factor IF-2  66.93 
 
 		 999 aa  842    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.515442  normal  0.133918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1421  translation initiation factor IF-2  67.08 
 
 		 980 aa  825    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2207  translation initiation factor IF-2  67.32 
 
 		 612 aa  825    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537417  decreased coverage  0.000616715 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1416  translation initiation factor IF-2  72.78 
 
 		 968 aa  951    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.919668  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  57.81 
 
 		 879 aa  940    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3331  translation initiation factor IF-2  66.19 
 
 		 992 aa  842    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2128  translation initiation factor IF-2  67.55 
 
 		 920 aa  836    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524074  normal  0.0207369 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1743  translation initiation factor IF-2  68.04 
 
 		 975 aa  858    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.695409  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2314  translation initiation factor IF-2  67.08 
 
 		 930 aa  847    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596134  normal  0.0338999 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1715  translation initiation factor IF-2  67.34 
 
 		 934 aa  863    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  41.56 
 
 		 971 aa  617  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  40.33 
 
 		 882 aa  617  1e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  40.42 
 
 		 1029 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  40.33 
 
 		 985 aa  601  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  41.99 
 
 		 903 aa  597  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  49.76 
 
 		 883 aa  593  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  46.68 
 
 		 980 aa  590  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  41.61 
 
 		 956 aa  591  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  46.97 
 
 		 986 aa  592  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  52.54 
 
 		 739 aa  587  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  51.08 
 
 		 920 aa  585  1e-166  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  43.59 
 
 		 882 aa  589  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  49.12 
 
 		 884 aa  589  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  50.91 
 
 		 921 aa  588  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  51.61 
 
 		 732 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  47.86 
 
 		 880 aa  581  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  45.02 
 
 		 860 aa  582  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  48.01 
 
 		 880 aa  581  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  47.47 
 
 		 885 aa  580  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  47.86 
 
 		 880 aa  581  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  47.86 
 
 		 880 aa  581  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  47.86 
 
 		 880 aa  581  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  47.22 
 
 		 896 aa  580  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  47.11 
 
 		 889 aa  579  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  48.32 
 
 		 882 aa  582  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  47.52 
 
 		 902 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  46.72 
 
 		 907 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  47.31 
 
 		 885 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  47.31 
 
 		 885 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  51.83 
 
 		 720 aa  573  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  48.43 
 
 		 922 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  47.93 
 
 		 894 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  47.23 
 
 		 881 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  51.53 
 
 		 895 aa  574  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  46.38 
 
 		 752 aa  570  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  49.24 
 
 		 692 aa  570  1e-161  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  49.16 
 
 		 876 aa  569  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  47.49 
 
 		 894 aa  571  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  48.19 
 
 		 884 aa  571  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  47.35 
 
 		 979 aa  571  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  40.43 
 
 		 1008 aa  570  1e-161  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 896 aa  570  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  47.54 
 
 		 975 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  47.54 
 
 		 975 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  46.18 
 
 		 885 aa  567  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  47.54 
 
 		 975 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  47.54 
 
 		 975 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 		 883 aa  567  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 		 898 aa  566  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  51.52 
 
 		 1131 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  46.37 
 
 		 889 aa  564  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  44.72 
 
 		 888 aa  564  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  47.39 
 
 		 975 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  48.85 
 
 		 968 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  45.23 
 
 		 984 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  47.24 
 
 		 976 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  47.39 
 
 		 975 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  47.39 
 
 		 975 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  48.09 
 
 		 971 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  48.8 
 
 		 949 aa  562  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  48.09 
 
 		 972 aa  561  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  48.36 
 
 		 904 aa  560  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  47.41 
 
 		 897 aa  561  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  44.74 
 
 		 949 aa  560  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  46.59 
 
 		 971 aa  562  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  51.36 
 
 		 948 aa  561  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  51.1 
 
 		 984 aa  560  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  46.59 
 
 		 971 aa  562  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  44.09 
 
 		 1079 aa  561  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>