More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_14570 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12854  translation initiation factor IF-2  79 
 
 		 900 aa  1019    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000971271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1182  translation initiation factor IF-2  70.97 
 
 		 1046 aa  874    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1743  translation initiation factor IF-2  63.77 
 
 		 975 aa  818    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.695409  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1370  translation initiation factor IF-2  66.98 
 
 		 999 aa  822    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.515442  normal  0.133918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2116  translation initiation factor IF-2  68.66 
 
 		 1051 aa  868    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1426  translation initiation factor IF-2  65.53 
 
 		 954 aa  842    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000203462 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0778  translation initiation factor IF-2  69.84 
 
 		 955 aa  889    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425771  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1327  translation initiation factor IF-2  67.3 
 
 		 995 aa  826    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335521 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11480  translation initiation factor 2  68.68 
 
 		 969 aa  885    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21089  normal  0.867698 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4039  translation initiation factor IF-2  78.21 
 
 		 930 aa  1007    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.681084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2065  translation initiation factor IF-2  79.47 
 
 		 920 aa  1002    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.636635  normal  0.928572 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1019  translation initiation factor IF-2  67.7 
 
 		 1004 aa  868    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1510  translation initiation factor IF-2  67.7 
 
 		 957 aa  870    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  55.52 
 
 		 920 aa  640    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1061  translation initiation factor IF-2  70.55 
 
 		 961 aa  883    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271136  normal  0.0744531 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3562  translation initiation factor IF-2  70.61 
 
 		 1062 aa  860    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0285  translation initiation factor IF-2  63.13 
 
 		 954 aa  812    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07010  translation initiation factor 2  66.88 
 
 		 930 aa  826    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2152  translation initiation factor IF-2  78.98 
 
 		 938 aa  992    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0901193  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23450  translation initiation factor 2  67.55 
 
 		 939 aa  867    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0250989  normal  0.0490514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3966  translation initiation factor IF-2  73.65 
 
 		 998 aa  942    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.602986  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2082  translation initiation factor IF-2  79.47 
 
 		 920 aa  1002    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2489  translation initiation factor IF-2  65.84 
 
 		 956 aa  833    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.872607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1211  translation initiation factor IF-2  68.01 
 
 		 951 aa  868    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186812  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10320  translation initiation factor 2  57.11 
 
 		 957 aa  931    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0686977  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1421  translation initiation factor IF-2  67.24 
 
 		 980 aa  837    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1715  translation initiation factor IF-2  77.46 
 
 		 934 aa  987    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1416  translation initiation factor IF-2  66.61 
 
 		 968 aa  856    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.919668  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3331  translation initiation factor IF-2  70.79 
 
 		 992 aa  887    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  60.04 
 
 		 879 aa  978    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14570  translation initiation factor 2  100 
 
 		 938 aa  1845    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00182457  normal  0.54145 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2207  translation initiation factor IF-2  73.37 
 
 		 612 aa  896    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537417  decreased coverage  0.000616715 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3190  translation initiation factor IF-2  69.58 
 
 		 938 aa  894    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2128  translation initiation factor IF-2  79.47 
 
 		 920 aa  1002    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524074  normal  0.0207369 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2314  translation initiation factor IF-2  79.15 
 
 		 930 aa  998    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596134  normal  0.0338999 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  41.29 
 
 		 882 aa  619  1e-176  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  39.05 
 
 		 1029 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  55.08 
 
 		 739 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  54.75 
 
 		 732 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  46.91 
 
 		 860 aa  598  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  39.55 
 
 		 947 aa  593  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08040  translation initiation factor IF-2  55.85 
 
 		 929 aa  592  1e-168  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13732  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  40 
 
 		 985 aa  591  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  50.75 
 
 		 883 aa  588  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  55.84 
 
 		 941 aa  587  1e-166  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  49.13 
 
 		 884 aa  588  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  50.31 
 
 		 903 aa  587  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  44.7 
 
 		 882 aa  587  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  50.81 
 
 		 971 aa  587  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  45.97 
 
 		 888 aa  585  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 1161 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  47.53 
 
 		 907 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  52.18 
 
 		 879 aa  584  1.0000000000000001e-165  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  51.09 
 
 		 752 aa  581  1e-164  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  50.84 
 
 		 692 aa  580  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  44.69 
 
 		 1079 aa  579  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  49.69 
 
 		 922 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  47.78 
 
 		 894 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  52.76 
 
 		 885 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  48.7 
 
 		 949 aa  574  1.0000000000000001e-162  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  52.55 
 
 		 686 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  51.09 
 
 		 898 aa  571  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  51.69 
 
 		 845 aa  571  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  48.83 
 
 		 882 aa  571  1e-161  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  52.79 
 
 		 822 aa  571  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  50.84 
 
 		 720 aa  568  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  51.43 
 
 		 686 aa  568  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  50.99 
 
 		 689 aa  568  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  51.43 
 
 		 686 aa  568  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  51.26 
 
 		 686 aa  568  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  51.26 
 
 		 686 aa  568  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  51.26 
 
 		 686 aa  568  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  47.63 
 
 		 902 aa  567  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  51.43 
 
 		 686 aa  568  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  47.55 
 
 		 979 aa  567  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  51.43 
 
 		 686 aa  568  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  50.84 
 
 		 834 aa  569  1e-160  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  49.25 
 
 		 921 aa  566  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  46.78 
 
 		 975 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  46.78 
 
 		 975 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  50.76 
 
 		 688 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  46.78 
 
 		 975 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  46.78 
 
 		 975 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  46.64 
 
 		 975 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  50.25 
 
 		 895 aa  560  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  47.28 
 
 		 964 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1867  translation initiation factor IF-2  38.02 
 
 		 1038 aa  560  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  46.64 
 
 		 975 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  46.2 
 
 		 971 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  46.64 
 
 		 975 aa  562  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  46.2 
 
 		 971 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  56.85 
 
 		 928 aa  560  1e-158  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  51.26 
 
 		 688 aa  561  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  46.2 
 
 		 971 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  49.58 
 
 		 891 aa  562  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  49.5 
 
 		 992 aa  561  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  47.06 
 
 		 969 aa  557  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  46.2 
 
 		 976 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  45.66 
 
 		 896 aa  558  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  51.17 
 
 		 984 aa  559  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>