More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1019 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4039  translation initiation factor IF-2  68.54 
 
 		 930 aa  873    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.681084 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  41.2 
 
 		 985 aa  644    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1211  translation initiation factor IF-2  84.34 
 
 		 951 aa  1090    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186812  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1426  translation initiation factor IF-2  79.66 
 
 		 954 aa  1048    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000203462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7742  translation initiation factor IF-2  70.06 
 
 		 1051 aa  899    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11480  translation initiation factor 2  62.85 
 
 		 969 aa  1072    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21089  normal  0.867698 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2152  translation initiation factor IF-2  66.46 
 
 		 938 aa  838    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0901193  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0778  translation initiation factor IF-2  68.02 
 
 		 955 aa  880    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425771  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1743  translation initiation factor IF-2  68.09 
 
 		 975 aa  881    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.695409  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  41.21 
 
 		 1029 aa  653    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14570  translation initiation factor 2  67.55 
 
 		 938 aa  876    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00182457  normal  0.54145 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1370  translation initiation factor IF-2  69.45 
 
 		 999 aa  868    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.515442  normal  0.133918 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1510  translation initiation factor IF-2  87.6 
 
 		 957 aa  1124    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2065  translation initiation factor IF-2  66.98 
 
 		 920 aa  837    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.636635  normal  0.928572 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1019  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 1004 aa  1990    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3562  translation initiation factor IF-2  70.42 
 
 		 1062 aa  862    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23450  translation initiation factor 2  86.98 
 
 		 939 aa  1113    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0250989  normal  0.0490514 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07010  translation initiation factor 2  77.55 
 
 		 930 aa  976    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5834  translation initiation factor IF-2  69.33 
 
 		 1034 aa  869    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1327  translation initiation factor IF-2  69.5 
 
 		 995 aa  870    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335521 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2082  translation initiation factor IF-2  66.98 
 
 		 920 aa  837    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12854  translation initiation factor IF-2  66.72 
 
 		 900 aa  843    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000971271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3592  translation initiation factor IF-2  67.82 
 
 		 1012 aa  866    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10320  translation initiation factor 2  60.37 
 
 		 957 aa  1054    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0686977  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1443  translation initiation factor IF-2  80.4 
 
 		 1044 aa  1047    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1061  translation initiation factor IF-2  69.5 
 
 		 961 aa  876    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271136  normal  0.0744531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2116  translation initiation factor IF-2  68.92 
 
 		 1051 aa  887    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  41.45 
 
 		 882 aa  642    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1416  translation initiation factor IF-2  78.88 
 
 		 968 aa  1046    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.919668  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  57.3 
 
 		 879 aa  973    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2207  translation initiation factor IF-2  69.97 
 
 		 612 aa  854    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537417  decreased coverage  0.000616715 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2128  translation initiation factor IF-2  66.98 
 
 		 920 aa  837    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524074  normal  0.0207369 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1182  translation initiation factor IF-2  71.43 
 
 		 1046 aa  891    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  42.08 
 
 		 971 aa  634  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  51.12 
 
 		 884 aa  623  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  41.83 
 
 		 903 aa  623  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  50.32 
 
 		 883 aa  619  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  46.28 
 
 		 882 aa  622  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  47.62 
 
 		 986 aa  611  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  53.37 
 
 		 739 aa  610  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  52.51 
 
 		 920 aa  603  1.0000000000000001e-171  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  50.76 
 
 		 692 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  52.12 
 
 		 732 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 921 aa  599  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  45.43 
 
 		 1079 aa  602  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  40.72 
 
 		 956 aa  594  1e-168  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  50.33 
 
 		 1161 aa  595  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  47.87 
 
 		 984 aa  591  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  46.19 
 
 		 888 aa  587  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  52.93 
 
 		 924 aa  588  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  52.2 
 
 		 885 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  43.77 
 
 		 947 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  51.61 
 
 		 689 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  47.71 
 
 		 907 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  53.75 
 
 		 1035 aa  581  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  51.51 
 
 		 720 aa  582  1e-164  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  51.77 
 
 		 860 aa  580  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  51.35 
 
 		 892 aa  579  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  51.94 
 
 		 686 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  51.94 
 
 		 686 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  51.94 
 
 		 686 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  51.94 
 
 		 686 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  51.95 
 
 		 686 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  47.79 
 
 		 949 aa  578  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  51.77 
 
 		 686 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  46.92 
 
 		 922 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  51.77 
 
 		 686 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  46.72 
 
 		 979 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  48.33 
 
 		 936 aa  575  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  49.03 
 
 		 949 aa  571  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  47.77 
 
 		 971 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  50.25 
 
 		 1131 aa  571  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  51.27 
 
 		 686 aa  569  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  51.78 
 
 		 688 aa  572  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  50.93 
 
 		 845 aa  569  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  50.76 
 
 		 688 aa  567  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  47.93 
 
 		 876 aa  569  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  44.73 
 
 		 873 aa  568  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 705 aa  568  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  47.77 
 
 		 971 aa  568  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  46.24 
 
 		 940 aa  566  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  49.16 
 
 		 752 aa  567  1e-160  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 705 aa  568  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  47.77 
 
 		 971 aa  568  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  52.68 
 
 		 962 aa  567  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 898 aa  565  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  48.91 
 
 		 896 aa  562  1.0000000000000001e-159  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  45.61 
 
 		 915 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  51 
 
 		 879 aa  564  1.0000000000000001e-159  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 822 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  48.09 
 
 		 911 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  47.56 
 
 		 971 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  45.66 
 
 		 991 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  47.24 
 
 		 975 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  47.24 
 
 		 975 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  46.93 
 
 		 904 aa  559  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  47.24 
 
 		 975 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  47.27 
 
 		 894 aa  560  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  47.71 
 
 		 834 aa  562  1e-158  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  46.61 
 
 		 952 aa  560  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>