More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0638 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  54.47 
 
 		 688 aa  643    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  55.07 
 
 		 883 aa  640    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  53.39 
 
 		 720 aa  637    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  55.33 
 
 		 686 aa  651    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 971 aa  649    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  55.15 
 
 		 686 aa  649    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  54.98 
 
 		 686 aa  648    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  55.33 
 
 		 686 aa  650    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  55.33 
 
 		 686 aa  650    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  55.67 
 
 		 692 aa  644    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  55.59 
 
 		 732 aa  672    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  55.74 
 
 		 739 aa  665    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 885 aa  1743    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  54.98 
 
 		 686 aa  648    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  54.3 
 
 		 688 aa  642    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  44.32 
 
 		 903 aa  674    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  55.72 
 
 		 920 aa  663    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  44.25 
 
 		 860 aa  652    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  53.7 
 
 		 689 aa  645    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  55.33 
 
 		 686 aa  651    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  53.56 
 
 		 705 aa  640    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  43.65 
 
 		 882 aa  677    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  53.56 
 
 		 705 aa  640    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1416  translation initiation factor IF-2  53.46 
 
 		 968 aa  637    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.919668  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  48.12 
 
 		 879 aa  674    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  40.78 
 
 		 985 aa  651    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  49.21 
 
 		 888 aa  636    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  54.16 
 
 		 879 aa  635  1e-180  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  50.71 
 
 		 1029 aa  633  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  47.56 
 
 		 947 aa  630  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  54.55 
 
 		 686 aa  630  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  54.36 
 
 		 882 aa  623  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  55.15 
 
 		 822 aa  624  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  53.55 
 
 		 986 aa  623  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1510  translation initiation factor IF-2  53.61 
 
 		 957 aa  622  1e-177  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3190  translation initiation factor IF-2  54.55 
 
 		 938 aa  624  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  53.55 
 
 		 980 aa  623  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1443  translation initiation factor IF-2  53.22 
 
 		 1044 aa  620  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1182  translation initiation factor IF-2  55.21 
 
 		 1046 aa  621  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  44.69 
 
 		 964 aa  617  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2116  translation initiation factor IF-2  52.9 
 
 		 1051 aa  617  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  57.75 
 
 		 941 aa  618  1e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  47.86 
 
 		 921 aa  619  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08040  translation initiation factor IF-2  55.05 
 
 		 929 aa  614  9.999999999999999e-175  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13732  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7742  translation initiation factor IF-2  53.41 
 
 		 1051 aa  613  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1211  translation initiation factor IF-2  53.6 
 
 		 951 aa  613  9.999999999999999e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186812  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1370  translation initiation factor IF-2  54.4 
 
 		 999 aa  614  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.515442  normal  0.133918 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23450  translation initiation factor 2  52.84 
 
 		 939 aa  614  9.999999999999999e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0250989  normal  0.0490514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2489  translation initiation factor IF-2  54.23 
 
 		 956 aa  615  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.872607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11480  translation initiation factor 2  46.65 
 
 		 969 aa  614  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21089  normal  0.867698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1327  translation initiation factor IF-2  54.39 
 
 		 995 aa  610  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335521 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  52.77 
 
 		 845 aa  609  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1061  translation initiation factor IF-2  53.83 
 
 		 961 aa  610  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271136  normal  0.0744531 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  52.71 
 
 		 896 aa  609  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  48.94 
 
 		 907 aa  609  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  52.54 
 
 		 885 aa  608  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3966  translation initiation factor IF-2  52.34 
 
 		 998 aa  605  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.602986  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  48.04 
 
 		 922 aa  606  9.999999999999999e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  51.6 
 
 		 679 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  51.6 
 
 		 679 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  49.38 
 
 		 949 aa  605  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  50.25 
 
 		 894 aa  605  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  51.29 
 
 		 896 aa  604  1.0000000000000001e-171  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  45.72 
 
 		 959 aa  604  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0778  translation initiation factor IF-2  50.85 
 
 		 955 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425771  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14570  translation initiation factor 2  52.17 
 
 		 938 aa  605  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00182457  normal  0.54145 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  44.94 
 
 		 990 aa  603  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07010  translation initiation factor 2  52.43 
 
 		 930 aa  603  1.0000000000000001e-171  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  50.93 
 
 		 1161 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2207  translation initiation factor IF-2  55.13 
 
 		 612 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537417  decreased coverage  0.000616715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  52.23 
 
 		 896 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3331  translation initiation factor IF-2  54.88 
 
 		 992 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1743  translation initiation factor IF-2  51.1 
 
 		 975 aa  602  1e-170  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.695409  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  48.13 
 
 		 885 aa  601  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  52.16 
 
 		 898 aa  599  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  47.05 
 
 		 1079 aa  600  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  55.41 
 
 		 689 aa  602  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  55.69 
 
 		 924 aa  600  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0993  translation initiation factor IF-2  51.93 
 
 		 668 aa  600  1e-170  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000676499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 		 881 aa  599  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  49.24 
 
 		 882 aa  602  1e-170  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  52.68 
 
 		 894 aa  602  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  51.55 
 
 		 880 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  50.75 
 
 		 885 aa  597  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  51.55 
 
 		 880 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  51.3 
 
 		 868 aa  596  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  51.55 
 
 		 880 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  51.55 
 
 		 880 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  52.89 
 
 		 949 aa  597  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  53.02 
 
 		 997 aa  596  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  45.19 
 
 		 752 aa  598  1e-169  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  50.41 
 
 		 902 aa  595  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  49.3 
 
 		 882 aa  596  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  49.71 
 
 		 975 aa  595  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  49.56 
 
 		 975 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  53.16 
 
 		 711 aa  595  1e-168  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 		 976 aa  594  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  51.2 
 
 		 889 aa  595  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  49.56 
 
 		 975 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  51.55 
 
 		 880 aa  593  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>