More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1061 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2065  translation initiation factor IF-2  70.47 
 
 		 920 aa  889    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.636635  normal  0.928572 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2489  translation initiation factor IF-2  68.9 
 
 		 956 aa  867    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.872607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1421  translation initiation factor IF-2  72.14 
 
 		 980 aa  885    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14570  translation initiation factor 2  70.6 
 
 		 938 aa  909    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00182457  normal  0.54145 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2152  translation initiation factor IF-2  71.07 
 
 		 938 aa  892    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0901193  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23450  translation initiation factor 2  69.98 
 
 		 939 aa  894    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0250989  normal  0.0490514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4039  translation initiation factor IF-2  70 
 
 		 930 aa  909    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.681084 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3592  translation initiation factor IF-2  73.34 
 
 		 1012 aa  949    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1510  translation initiation factor IF-2  70.03 
 
 		 957 aa  894    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1019  translation initiation factor IF-2  69.3 
 
 		 1004 aa  893    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1443  translation initiation factor IF-2  70.45 
 
 		 1044 aa  904    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0285  translation initiation factor IF-2  64.08 
 
 		 954 aa  827    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2207  translation initiation factor IF-2  72.8 
 
 		 612 aa  888    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537417  decreased coverage  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2116  translation initiation factor IF-2  85.15 
 
 		 1051 aa  1104    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7742  translation initiation factor IF-2  75.24 
 
 		 1051 aa  944    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3966  translation initiation factor IF-2  73.7 
 
 		 998 aa  944    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.602986  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2082  translation initiation factor IF-2  70.47 
 
 		 920 aa  889    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10320  translation initiation factor 2  56.91 
 
 		 957 aa  934    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0686977  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1743  translation initiation factor IF-2  64.08 
 
 		 975 aa  823    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.695409  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1370  translation initiation factor IF-2  70.73 
 
 		 999 aa  870    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.515442  normal  0.133918 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  40.57 
 
 		 1029 aa  644    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1061  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 961 aa  1879    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271136  normal  0.0744531 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  41.83 
 
 		 882 aa  645    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1426  translation initiation factor IF-2  67.19 
 
 		 954 aa  863    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000203462 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1327  translation initiation factor IF-2  70.77 
 
 		 995 aa  871    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1416  translation initiation factor IF-2  68.58 
 
 		 968 aa  880    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.919668  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  66.63 
 
 		 879 aa  1103    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5834  translation initiation factor IF-2  71.74 
 
 		 1034 aa  897    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11480  translation initiation factor 2  54.99 
 
 		 969 aa  946    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21089  normal  0.867698 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3190  translation initiation factor IF-2  71.09 
 
 		 938 aa  887    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2128  translation initiation factor IF-2  70.47 
 
 		 920 aa  889    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524074  normal  0.0207369 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2314  translation initiation factor IF-2  70.22 
 
 		 930 aa  892    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596134  normal  0.0338999 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07010  translation initiation factor 2  67.36 
 
 		 930 aa  831    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  41.21 
 
 		 985 aa  633  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  54.76 
 
 		 920 aa  632  1e-180  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  42.76 
 
 		 971 aa  629  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  54.64 
 
 		 692 aa  626  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  54.42 
 
 		 732 aa  621  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  54.67 
 
 		 739 aa  620  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  53.56 
 
 		 903 aa  617  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  51.61 
 
 		 884 aa  610  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  49.85 
 
 		 907 aa  612  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  51.52 
 
 		 883 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  41.14 
 
 		 882 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  55.2 
 
 		 879 aa  607  9.999999999999999e-173  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  47.3 
 
 		 888 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  49.33 
 
 		 986 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  39.55 
 
 		 947 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  52.55 
 
 		 689 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  52.05 
 
 		 686 aa  599  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  47.01 
 
 		 860 aa  601  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08040  translation initiation factor IF-2  56.59 
 
 		 929 aa  602  1e-170  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13732  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  52.5 
 
 		 921 aa  600  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  52.6 
 
 		 686 aa  596  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  52.05 
 
 		 686 aa  598  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  51.89 
 
 		 686 aa  597  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  52.05 
 
 		 686 aa  598  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  52.05 
 
 		 686 aa  598  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  50.69 
 
 		 922 aa  597  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  51.89 
 
 		 686 aa  597  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  51.06 
 
 		 980 aa  597  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  49.7 
 
 		 979 aa  596  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  45.86 
 
 		 1079 aa  597  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  48.47 
 
 		 894 aa  594  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  51.59 
 
 		 936 aa  593  1e-168  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  53.64 
 
 		 885 aa  595  1e-168  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  53.87 
 
 		 845 aa  594  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  52.26 
 
 		 688 aa  590  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  52.94 
 
 		 822 aa  589  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  54.09 
 
 		 686 aa  589  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  51.59 
 
 		 896 aa  586  1e-166  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  51.83 
 
 		 720 aa  587  1e-166  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  51 
 
 		 1161 aa  588  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  47.4 
 
 		 896 aa  587  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  51.76 
 
 		 688 aa  588  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  51.11 
 
 		 898 aa  588  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  51.85 
 
 		 911 aa  588  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  54.03 
 
 		 924 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  49.58 
 
 		 885 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  49.03 
 
 		 971 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  49.84 
 
 		 992 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  49.03 
 
 		 971 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  48.91 
 
 		 881 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  49.03 
 
 		 971 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  49.68 
 
 		 949 aa  585  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  49.58 
 
 		 889 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  49.38 
 
 		 902 aa  584  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  47.47 
 
 		 889 aa  580  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  48.87 
 
 		 975 aa  581  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  48.87 
 
 		 975 aa  581  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  48.72 
 
 		 975 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 		 880 aa  581  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  48.87 
 
 		 975 aa  581  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  48.87 
 
 		 975 aa  581  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  48.57 
 
 		 976 aa  580  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  47.73 
 
 		 885 aa  579  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  48.72 
 
 		 975 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  49.85 
 
 		 971 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  48.28 
 
 		 834 aa  579  1e-164  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  48.35 
 
 		 880 aa  581  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>