More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3190 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1743  translation initiation factor IF-2  62.54 
 
 		 975 aa  803    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.695409  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10320  translation initiation factor 2  54.49 
 
 		 957 aa  937    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0686977  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3331  translation initiation factor IF-2  72.45 
 
 		 992 aa  918    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0285  translation initiation factor IF-2  61.9 
 
 		 954 aa  796    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2489  translation initiation factor IF-2  66.82 
 
 		 956 aa  843    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.872607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11480  translation initiation factor 2  54.08 
 
 		 969 aa  917    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21089  normal  0.867698 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0778  translation initiation factor IF-2  69.91 
 
 		 955 aa  898    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425771  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3966  translation initiation factor IF-2  67.94 
 
 		 998 aa  871    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.602986  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1211  translation initiation factor IF-2  67.55 
 
 		 951 aa  866    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186812  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7742  translation initiation factor IF-2  71.52 
 
 		 1051 aa  917    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07010  translation initiation factor 2  66.03 
 
 		 930 aa  828    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1426  translation initiation factor IF-2  65.94 
 
 		 954 aa  846    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000203462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4039  translation initiation factor IF-2  72.1 
 
 		 930 aa  948    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.681084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5834  translation initiation factor IF-2  70.13 
 
 		 1034 aa  900    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12854  translation initiation factor IF-2  70.27 
 
 		 900 aa  923    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000971271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14570  translation initiation factor 2  69.45 
 
 		 938 aa  908    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00182457  normal  0.54145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2082  translation initiation factor IF-2  71.52 
 
 		 920 aa  927    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2065  translation initiation factor IF-2  71.52 
 
 		 920 aa  927    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.636635  normal  0.928572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23450  translation initiation factor 2  68.01 
 
 		 939 aa  867    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0250989  normal  0.0490514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2207  translation initiation factor IF-2  67.54 
 
 		 612 aa  827    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537417  decreased coverage  0.000616715 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  42.45 
 
 		 882 aa  648    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1421  translation initiation factor IF-2  66.67 
 
 		 980 aa  835    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1715  translation initiation factor IF-2  72.03 
 
 		 934 aa  938    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2116  translation initiation factor IF-2  69.4 
 
 		 1051 aa  882    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1510  translation initiation factor IF-2  67.39 
 
 		 957 aa  858    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1416  translation initiation factor IF-2  68.12 
 
 		 968 aa  876    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.919668  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1443  translation initiation factor IF-2  68.43 
 
 		 1044 aa  875    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1061  translation initiation factor IF-2  70.87 
 
 		 961 aa  877    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271136  normal  0.0744531 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2152  translation initiation factor IF-2  70.86 
 
 		 938 aa  910    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0901193  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  60.23 
 
 		 879 aa  995    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3190  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 938 aa  1840    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2128  translation initiation factor IF-2  71.52 
 
 		 920 aa  927    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524074  normal  0.0207369 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2314  translation initiation factor IF-2  71.63 
 
 		 930 aa  933    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596134  normal  0.0338999 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  55.42 
 
 		 739 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  42.71 
 
 		 903 aa  632  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  52.25 
 
 		 920 aa  632  1e-179  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  54.34 
 
 		 732 aa  625  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  41.59 
 
 		 860 aa  619  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  55.11 
 
 		 879 aa  620  1e-176  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  53.04 
 
 		 692 aa  622  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  41.18 
 
 		 985 aa  621  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  42.22 
 
 		 883 aa  617  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  50.07 
 
 		 971 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  50.8 
 
 		 884 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  49.55 
 
 		 922 aa  610  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  50.55 
 
 		 947 aa  606  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  41.55 
 
 		 907 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  52.61 
 
 		 720 aa  604  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  46.95 
 
 		 888 aa  602  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  54.52 
 
 		 885 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3221  translation initiation factor IF-2  52.93 
 
 		 815 aa  604  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.109257 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  49.18 
 
 		 752 aa  604  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  51.52 
 
 		 1029 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  52.44 
 
 		 705 aa  599  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  51.51 
 
 		 1161 aa  599  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  52.44 
 
 		 705 aa  599  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 686 aa  598  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  41.66 
 
 		 882 aa  598  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 686 aa  597  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 686 aa  598  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 686 aa  598  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 686 aa  597  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 686 aa  598  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 686 aa  598  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08040  translation initiation factor IF-2  54.03 
 
 		 929 aa  598  1e-169  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13732  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  46.99 
 
 		 881 aa  596  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  52.86 
 
 		 845 aa  595  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  47.63 
 
 		 986 aa  594  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  51.24 
 
 		 689 aa  595  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  47.45 
 
 		 964 aa  592  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  52.75 
 
 		 822 aa  592  1e-168  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  50.77 
 
 		 898 aa  590  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  47.79 
 
 		 964 aa  589  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  47.77 
 
 		 980 aa  592  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  51.6 
 
 		 688 aa  592  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  47.88 
 
 		 885 aa  590  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  51.78 
 
 		 686 aa  590  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  47.12 
 
 		 896 aa  591  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  49.44 
 
 		 688 aa  591  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  45.12 
 
 		 956 aa  588  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  48.74 
 
 		 979 aa  586  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  51.85 
 
 		 1131 aa  587  1e-166  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  46.36 
 
 		 894 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  51.17 
 
 		 896 aa  584  1.0000000000000001e-165  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  49 
 
 		 964 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 		 880 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 896 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  51.01 
 
 		 873 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  48.65 
 
 		 884 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 		 880 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  54.28 
 
 		 689 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  51.16 
 
 		 887 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 882 aa  585  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 		 880 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 		 880 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  46.93 
 
 		 894 aa  580  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  42.33 
 
 		 964 aa  579  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  48.64 
 
 		 975 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  48.34 
 
 		 976 aa  580  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  48.64 
 
 		 975 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>