More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12854 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1061  translation initiation factor IF-2  70.19 
 
 		 961 aa  864    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271136  normal  0.0744531 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2489  translation initiation factor IF-2  66.36 
 
 		 956 aa  820    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.872607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11480  translation initiation factor 2  54.63 
 
 		 969 aa  920    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21089  normal  0.867698 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1715  translation initiation factor IF-2  86.48 
 
 		 934 aa  1100    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0778  translation initiation factor IF-2  67.82 
 
 		 955 aa  867    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425771  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1443  translation initiation factor IF-2  67.86 
 
 		 1044 aa  853    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14570  translation initiation factor 2  78.83 
 
 		 938 aa  1007    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00182457  normal  0.54145 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2207  translation initiation factor IF-2  72.43 
 
 		 612 aa  858    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537417  decreased coverage  0.000616715 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3562  translation initiation factor IF-2  70.7 
 
 		 1062 aa  839    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1327  translation initiation factor IF-2  67.56 
 
 		 995 aa  816    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335521 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1211  translation initiation factor IF-2  66.51 
 
 		 951 aa  828    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186812  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3592  translation initiation factor IF-2  68.72 
 
 		 1012 aa  886    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1370  translation initiation factor IF-2  67.51 
 
 		 999 aa  814    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.515442  normal  0.133918 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10320  translation initiation factor 2  56.86 
 
 		 957 aa  919    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0686977  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1426  translation initiation factor IF-2  65.68 
 
 		 954 aa  819    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000203462 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1019  translation initiation factor IF-2  54.21 
 
 		 1004 aa  875    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07010  translation initiation factor 2  66.19 
 
 		 930 aa  801    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12854  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 900 aa  1772    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000971271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1416  translation initiation factor IF-2  65.52 
 
 		 968 aa  822    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.919668  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7742  translation initiation factor IF-2  73.76 
 
 		 1051 aa  934    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2116  translation initiation factor IF-2  68.72 
 
 		 1051 aa  869    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  61.33 
 
 		 879 aa  991    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2152  translation initiation factor IF-2  88.24 
 
 		 938 aa  1088    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0901193  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1182  translation initiation factor IF-2  71.18 
 
 		 1046 aa  864    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3190  translation initiation factor IF-2  70.27 
 
 		 938 aa  895    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23450  translation initiation factor 2  67.13 
 
 		 939 aa  831    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0250989  normal  0.0490514 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0285  translation initiation factor IF-2  63.06 
 
 		 954 aa  787    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1510  translation initiation factor IF-2  65.26 
 
 		 957 aa  808    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  43.04 
 
 		 882 aa  611  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  42.83 
 
 		 884 aa  590  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  53.11 
 
 		 920 aa  588  1e-166  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  46.16 
 
 		 980 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  46.36 
 
 		 986 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  51.61 
 
 		 883 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  45.66 
 
 		 882 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  52.93 
 
 		 686 aa  575  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  51.86 
 
 		 947 aa  571  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  41.3 
 
 		 903 aa  572  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  47.32 
 
 		 922 aa  566  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08040  translation initiation factor IF-2  54.96 
 
 		 929 aa  568  1e-160  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13732  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  50.42 
 
 		 898 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  51.19 
 
 		 732 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  51.53 
 
 		 1029 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  52.2 
 
 		 739 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  46.18 
 
 		 860 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  46.07 
 
 		 907 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  46.03 
 
 		 888 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  49.58 
 
 		 891 aa  560  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3221  translation initiation factor IF-2  51.76 
 
 		 815 aa  559  1e-158  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.109257 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  51.42 
 
 		 921 aa  560  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  39.2 
 
 		 985 aa  558  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  50.86 
 
 		 692 aa  558  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  51.59 
 
 		 879 aa  556  1e-157  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  47.35 
 
 		 949 aa  557  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4217  translation initiation factor 2  47.3 
 
 		 1011 aa  555  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726068  normal  0.0540264 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  48.1 
 
 		 902 aa  554  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  48.73 
 
 		 752 aa  550  1e-155  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 		 936 aa  550  1e-155  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  50 
 
 		 843 aa  550  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 894 aa  551  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  50.49 
 
 		 887 aa  547  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  48.79 
 
 		 971 aa  546  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  43.82 
 
 		 834 aa  546  1e-154  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  47.4 
 
 		 880 aa  549  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  46.18 
 
 		 889 aa  545  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  48.74 
 
 		 896 aa  543  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  51.44 
 
 		 885 aa  545  1e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 		 895 aa  542  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  43.06 
 
 		 873 aa  544  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  47.45 
 
 		 979 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0293  translation initiation factor IF-2  49.36 
 
 		 1083 aa  543  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00928073 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  53.09 
 
 		 941 aa  544  1e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1749  translation initiation factor IF-2  49.04 
 
 		 890 aa  545  1e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0133551  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  44.84 
 
 		 956 aa  545  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  49.33 
 
 		 720 aa  542  9.999999999999999e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  50.76 
 
 		 822 aa  540  9.999999999999999e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  46.19 
 
 		 964 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  48.48 
 
 		 885 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  47.15 
 
 		 964 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 1022 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 845 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  47.94 
 
 		 992 aa  542  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  49.75 
 
 		 689 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  47.99 
 
 		 894 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  48.15 
 
 		 1161 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  47.64 
 
 		 885 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  47.64 
 
 		 885 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  48.6 
 
 		 883 aa  542  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 911 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  47.39 
 
 		 882 aa  539  9.999999999999999e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  47.72 
 
 		 964 aa  537  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  50.86 
 
 		 948 aa  538  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  47.05 
 
 		 945 aa  537  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1867  translation initiation factor IF-2  49.57 
 
 		 1038 aa  536  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  45.62 
 
 		 880 aa  539  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  46.48 
 
 		 984 aa  538  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  46.8 
 
 		 885 aa  539  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  46.35 
 
 		 1058 aa  539  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  45.14 
 
 		 896 aa  537  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  48.48 
 
 		 889 aa  538  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>