More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09360 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  54.82 
 
 		 1161 aa  655    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  52.69 
 
 		 883 aa  669    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  56.25 
 
 		 720 aa  670    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08040  translation initiation factor IF-2  66.95 
 
 		 929 aa  1085    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13732  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  56.62 
 
 		 686 aa  665    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  52.69 
 
 		 880 aa  642    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  53.92 
 
 		 896 aa  645    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  53.51 
 
 		 885 aa  650    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  52.69 
 
 		 880 aa  642    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  56.62 
 
 		 686 aa  665    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  56.97 
 
 		 686 aa  667    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  56.97 
 
 		 686 aa  667    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 941 aa  1879    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  54.29 
 
 		 894 aa  651    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  55.15 
 
 		 705 aa  658    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  55.61 
 
 		 985 aa  644    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  54.42 
 
 		 980 aa  653    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  58.81 
 
 		 732 aa  692    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  54.89 
 
 		 686 aa  657    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  67.89 
 
 		 920 aa  1147    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  56.77 
 
 		 971 aa  646    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  55.13 
 
 		 895 aa  643    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  54.47 
 
 		 947 aa  659    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  59.34 
 
 		 739 aa  698    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  55.17 
 
 		 1022 aa  639    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  52.86 
 
 		 884 aa  673    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  56.47 
 
 		 924 aa  647    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  57.66 
 
 		 845 aa  672    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  56.62 
 
 		 686 aa  665    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  54.04 
 
 		 885 aa  665    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  54.62 
 
 		 902 aa  642    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  54.79 
 
 		 898 aa  649    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  44.96 
 
 		 903 aa  703    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  54.25 
 
 		 882 aa  646    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  52.69 
 
 		 880 aa  642    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  59.1 
 
 		 879 aa  859    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  52.37 
 
 		 884 aa  640    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  57.02 
 
 		 979 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  55.92 
 
 		 688 aa  655    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  57.02 
 
 		 692 aa  672    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  53.78 
 
 		 891 aa  652    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  59.14 
 
 		 689 aa  647    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  56.79 
 
 		 686 aa  665    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  49.51 
 
 		 1029 aa  657    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  60.73 
 
 		 860 aa  682    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  51.59 
 
 		 894 aa  642    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  53.51 
 
 		 885 aa  649    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  53.51 
 
 		 885 aa  649    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  52.05 
 
 		 881 aa  641    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  56.62 
 
 		 686 aa  665    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  52.69 
 
 		 880 aa  642    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  57.39 
 
 		 689 aa  670    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  56.28 
 
 		 822 aa  655    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  54.76 
 
 		 949 aa  639    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  53.51 
 
 		 889 aa  650    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  56.1 
 
 		 688 aa  655    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  54.77 
 
 		 921 aa  652    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  51.55 
 
 		 882 aa  641    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  54.88 
 
 		 885 aa  639    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  53.51 
 
 		 880 aa  649    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  55.15 
 
 		 705 aa  658    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  54.42 
 
 		 986 aa  655    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  51.75 
 
 		 896 aa  644    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  54.83 
 
 		 853 aa  633  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  56.34 
 
 		 964 aa  633  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  52.89 
 
 		 907 aa  635  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  51.88 
 
 		 949 aa  633  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  56.34 
 
 		 964 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  54.15 
 
 		 936 aa  632  1e-180  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  56.26 
 
 		 975 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  49.71 
 
 		 888 aa  631  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  56.26 
 
 		 975 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  57.02 
 
 		 966 aa  630  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  56.19 
 
 		 989 aa  629  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  56.26 
 
 		 975 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  57.12 
 
 		 971 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  57.12 
 
 		 971 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  56.95 
 
 		 971 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  56.53 
 
 		 986 aa  632  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  57.12 
 
 		 971 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  51.19 
 
 		 991 aa  632  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  56.26 
 
 		 975 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  56.26 
 
 		 969 aa  628  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  53.53 
 
 		 896 aa  627  1e-178  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  56.09 
 
 		 975 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  56.09 
 
 		 975 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  56.09 
 
 		 976 aa  629  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  53.82 
 
 		 952 aa  626  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  40.59 
 
 		 882 aa  627  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  53.18 
 
 		 752 aa  626  1e-178  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  56.95 
 
 		 972 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  56.09 
 
 		 975 aa  628  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  54.48 
 
 		 943 aa  627  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1701  translation initiation factor IF-2  55.75 
 
 		 991 aa  622  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14570  translation initiation factor 2  53.66 
 
 		 938 aa  623  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00182457  normal  0.54145 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3465  translation initiation factor IF-2  55.94 
 
 		 905 aa  622  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3544  translation initiation factor IF-2  56.3 
 
 		 892 aa  625  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3475  translation initiation factor IF-2  56.3 
 
 		 892 aa  625  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  55.54 
 
 		 879 aa  625  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  56.19 
 
 		 965 aa  624  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>