More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08040 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  57.14 
 
 		 688 aa  638    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  54.98 
 
 		 720 aa  641    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  57.84 
 
 		 686 aa  645    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  57.24 
 
 		 686 aa  644    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  65.7 
 
 		 879 aa  851    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  57.59 
 
 		 686 aa  646    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  57.59 
 
 		 686 aa  646    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  57.59 
 
 		 686 aa  646    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  57.67 
 
 		 688 aa  639    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08040  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 929 aa  1847    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13732  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  55.63 
 
 		 692 aa  651    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  57.07 
 
 		 845 aa  655    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  59.86 
 
 		 739 aa  676    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  54.02 
 
 		 947 aa  644    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  56.99 
 
 		 924 aa  637    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  52.61 
 
 		 884 aa  640    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  53.55 
 
 		 986 aa  635    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  57.59 
 
 		 686 aa  646    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  57.49 
 
 		 689 aa  647    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  43.9 
 
 		 903 aa  670    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  54.05 
 
 		 985 aa  640    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  72.47 
 
 		 920 aa  1181    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  52.4 
 
 		 1029 aa  641    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  53.6 
 
 		 885 aa  637    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  57.24 
 
 		 686 aa  644    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  67.26 
 
 		 941 aa  1073    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  40.99 
 
 		 882 aa  638    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  56.4 
 
 		 971 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  55.38 
 
 		 686 aa  650    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  55 
 
 		 752 aa  638    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  59.3 
 
 		 732 aa  674    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  54.14 
 
 		 883 aa  635  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  53.55 
 
 		 980 aa  634  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  54.7 
 
 		 882 aa  632  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  54.81 
 
 		 705 aa  632  1e-179  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  54.81 
 
 		 705 aa  632  1e-179  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  57.83 
 
 		 689 aa  631  1e-179  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  53.11 
 
 		 882 aa  627  1e-178  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14570  translation initiation factor 2  54.37 
 
 		 938 aa  627  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00182457  normal  0.54145 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  52.77 
 
 		 898 aa  627  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  51.76 
 
 		 894 aa  623  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  51.93 
 
 		 891 aa  624  1e-177  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  53.83 
 
 		 879 aa  623  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  52.78 
 
 		 921 aa  625  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  51.62 
 
 		 885 aa  622  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  52.28 
 
 		 1161 aa  620  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  54.22 
 
 		 822 aa  616  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  53.85 
 
 		 854 aa  615  1e-175  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  51.55 
 
 		 885 aa  617  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  50.64 
 
 		 902 aa  617  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  51.55 
 
 		 885 aa  617  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  51.55 
 
 		 885 aa  617  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3190  translation initiation factor IF-2  52.61 
 
 		 938 aa  616  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  51.22 
 
 		 880 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  51.73 
 
 		 896 aa  613  9.999999999999999e-175  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0778  translation initiation factor IF-2  53.32 
 
 		 955 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425771  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1061  translation initiation factor IF-2  54.42 
 
 		 961 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271136  normal  0.0744531 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  51.47 
 
 		 945 aa  613  9.999999999999999e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11480  translation initiation factor 2  52.95 
 
 		 969 aa  612  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21089  normal  0.867698 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  51.55 
 
 		 889 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  56.02 
 
 		 1035 aa  612  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  52.5 
 
 		 896 aa  610  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 885 aa  612  1e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  50.82 
 
 		 882 aa  612  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  49.62 
 
 		 895 aa  607  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  52.48 
 
 		 1022 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  51.55 
 
 		 936 aa  606  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  51.44 
 
 		 679 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  51.61 
 
 		 679 aa  608  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2116  translation initiation factor IF-2  52.85 
 
 		 1051 aa  608  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  48.45 
 
 		 881 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7742  translation initiation factor IF-2  53.85 
 
 		 1051 aa  608  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3221  translation initiation factor IF-2  53.1 
 
 		 815 aa  604  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.109257 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  50.41 
 
 		 880 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  50.41 
 
 		 880 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12854  translation initiation factor IF-2  52.99 
 
 		 900 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000971271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  50.41 
 
 		 880 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  50.41 
 
 		 880 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  52.13 
 
 		 949 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  53.2 
 
 		 907 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  49.36 
 
 		 894 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5834  translation initiation factor IF-2  53.42 
 
 		 1034 aa  605  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  50.16 
 
 		 991 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2207  translation initiation factor IF-2  54.61 
 
 		 612 aa  602  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537417  decreased coverage  0.000616715 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  49.22 
 
 		 915 aa  600  1e-170  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  49.43 
 
 		 884 aa  599  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  54.81 
 
 		 1131 aa  602  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3331  translation initiation factor IF-2  55.61 
 
 		 992 aa  602  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  51.3 
 
 		 896 aa  600  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  52.05 
 
 		 949 aa  602  1e-170  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3966  translation initiation factor IF-2  51.74 
 
 		 998 aa  598  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.602986  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2152  translation initiation factor IF-2  52.37 
 
 		 938 aa  596  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0901193  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  53.43 
 
 		 997 aa  596  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  53.1 
 
 		 853 aa  598  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0141  translation initiation factor IF-2  49.37 
 
 		 1010 aa  596  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  51.72 
 
 		 911 aa  599  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2314  translation initiation factor IF-2  52.28 
 
 		 930 aa  597  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596134  normal  0.0338999 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4489  translation initiation factor IF-2  53.02 
 
 		 890 aa  593  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4039  translation initiation factor IF-2  51.65 
 
 		 930 aa  595  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.681084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1443  translation initiation factor IF-2  51.81 
 
 		 1044 aa  592  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>