More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1810 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  60.77 
 
 
879 aa  878    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  54.86 
 
 
986 aa  659    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  42.18 
 
 
883 aa  674    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  51.58 
 
 
985 aa  649    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  51.08 
 
 
895 aa  641    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  57.73 
 
 
720 aa  683    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  59.16 
 
 
686 aa  682    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  54.08 
 
 
885 aa  655    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  51.14 
 
 
885 aa  640    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  59.16 
 
 
686 aa  682    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  59.34 
 
 
686 aa  683    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  59.34 
 
 
686 aa  683    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  56.12 
 
 
924 aa  651    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  55 
 
 
752 aa  640    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  58.25 
 
 
845 aa  668    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  60.14 
 
 
732 aa  706    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  59.23 
 
 
689 aa  684    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  53.99 
 
 
882 aa  647    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  54.19 
 
 
947 aa  653    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14570  translation initiation factor 2  54.44 
 
 
938 aa  649    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00182457  normal  0.54145 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08040  translation initiation factor IF-2  73.29 
 
 
929 aa  1168    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13732  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  52.62 
 
 
884 aa  673    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  57.56 
 
 
705 aa  673    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  59.16 
 
 
686 aa  682    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  53.45 
 
 
898 aa  647    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  57.71 
 
 
692 aa  681    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  57.56 
 
 
705 aa  673    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  55.83 
 
 
903 aa  676    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  54.51 
 
 
980 aa  655    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  51.51 
 
 
885 aa  650    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  52.94 
 
 
894 aa  652    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  59.16 
 
 
686 aa  682    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  59.16 
 
 
686 aa  682    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  54.34 
 
 
686 aa  649    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  58.25 
 
 
689 aa  649    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  51.82 
 
 
902 aa  649    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  68.71 
 
 
941 aa  1121    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  51.3 
 
 
885 aa  642    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  51.3 
 
 
885 aa  642    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  54.13 
 
 
1161 aa  650    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  40.91 
 
 
882 aa  644    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  58.16 
 
 
971 aa  679    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  58.46 
 
 
688 aa  675    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  51.14 
 
 
889 aa  639    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  53.86 
 
 
879 aa  644    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  53.27 
 
 
921 aa  655    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  100 
 
 
920 aa  1837    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  50.89 
 
 
882 aa  637    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  56.38 
 
 
1029 aa  659    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  58.64 
 
 
688 aa  673    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  60.56 
 
 
739 aa  700    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  52.94 
 
 
891 aa  657    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  54.04 
 
 
822 aa  638    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  54.97 
 
 
854 aa  632  1e-180  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  52.46 
 
 
949 aa  633  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  50.97 
 
 
880 aa  634  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  52.85 
 
 
896 aa  634  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  51.9 
 
 
896 aa  630  1e-179  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  52.41 
 
 
936 aa  630  1e-179  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 
894 aa  630  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  52.12 
 
 
679 aa  630  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  52.12 
 
 
679 aa  631  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  51.12 
 
 
881 aa  630  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  40.02 
 
 
882 aa  632  1e-179  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7742  translation initiation factor IF-2  53.85 
 
 
1051 aa  630  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  50.16 
 
 
880 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  56.57 
 
 
1035 aa  628  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3966  translation initiation factor IF-2  54.04 
 
 
998 aa  626  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.602986  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  50.16 
 
 
880 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  49.69 
 
 
915 aa  625  1e-178  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  51.64 
 
 
884 aa  626  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  49.6 
 
 
896 aa  625  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  54.22 
 
 
979 aa  625  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  50.16 
 
 
880 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1182  translation initiation factor IF-2  53.07 
 
 
1046 aa  626  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  50.16 
 
 
880 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  54.14 
 
 
975 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  54.39 
 
 
964 aa  624  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  54.25 
 
 
997 aa  622  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  54.14 
 
 
975 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  54.14 
 
 
975 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  54.14 
 
 
975 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  56.06 
 
 
984 aa  624  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  54.39 
 
 
964 aa  624  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  53.97 
 
 
976 aa  623  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  54.39 
 
 
964 aa  622  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  54.14 
 
 
971 aa  623  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  49.16 
 
 
962 aa  622  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  53.97 
 
 
975 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3465  translation initiation factor IF-2  46.05 
 
 
905 aa  620  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  50.81 
 
 
907 aa  621  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  51.46 
 
 
875 aa  619  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  54.14 
 
 
971 aa  622  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  53.97 
 
 
975 aa  621  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  53.97 
 
 
975 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  51.46 
 
 
875 aa  619  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  54.14 
 
 
971 aa  622  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3190  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 
938 aa  622  1e-176  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  53.97 
 
 
969 aa  620  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  54.75 
 
 
1079 aa  620  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>