More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3966 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1443  translation initiation factor IF-2  69.88 
 
 		 1044 aa  905    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2207  translation initiation factor IF-2  71.57 
 
 		 612 aa  880    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537417  decreased coverage  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0285  translation initiation factor IF-2  62.42 
 
 		 954 aa  806    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1715  translation initiation factor IF-2  71.36 
 
 		 934 aa  918    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0778  translation initiation factor IF-2  69.33 
 
 		 955 aa  892    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3331  translation initiation factor IF-2  71.43 
 
 		 992 aa  894    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23450  translation initiation factor 2  69.41 
 
 		 939 aa  882    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0250989  normal  0.0490514 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10320  translation initiation factor 2  57.08 
 
 		 957 aa  865    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0686977  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2489  translation initiation factor IF-2  67.55 
 
 		 956 aa  855    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.872607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1426  translation initiation factor IF-2  68.27 
 
 		 954 aa  870    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000203462 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1061  translation initiation factor IF-2  73.7 
 
 		 961 aa  922    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271136  normal  0.0744531 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1510  translation initiation factor IF-2  70.19 
 
 		 957 aa  895    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3562  translation initiation factor IF-2  73.87 
 
 		 1062 aa  894    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2116  translation initiation factor IF-2  73.27 
 
 		 1051 aa  934    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1182  translation initiation factor IF-2  73.68 
 
 		 1046 aa  913    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1019  translation initiation factor IF-2  69.46 
 
 		 1004 aa  895    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2082  translation initiation factor IF-2  72.57 
 
 		 920 aa  920    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3966  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 998 aa  1927    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.602986  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2065  translation initiation factor IF-2  72.57 
 
 		 920 aa  920    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.636635  normal  0.928572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5834  translation initiation factor IF-2  75.87 
 
 		 1034 aa  943    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12854  translation initiation factor IF-2  71.79 
 
 		 900 aa  929    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000971271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2152  translation initiation factor IF-2  72.41 
 
 		 938 aa  925    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0901193  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14570  translation initiation factor 2  73.54 
 
 		 938 aa  949    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00182457  normal  0.54145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7742  translation initiation factor IF-2  71.47 
 
 		 1051 aa  912    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3592  translation initiation factor IF-2  69.13 
 
 		 1012 aa  882    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1416  translation initiation factor IF-2  69.5 
 
 		 968 aa  885    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.919668  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  66.75 
 
 		 879 aa  945    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3190  translation initiation factor IF-2  67.71 
 
 		 938 aa  860    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2128  translation initiation factor IF-2  72.57 
 
 		 920 aa  920    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524074  normal  0.0207369 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2314  translation initiation factor IF-2  71.94 
 
 		 930 aa  926    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596134  normal  0.0338999 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  40.76 
 
 		 1079 aa  623  1e-177  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  53.77 
 
 		 920 aa  621  1e-176  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  42.59 
 
 		 971 aa  619  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  38.65 
 
 		 1029 aa  618  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  39.38 
 
 		 882 aa  607  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  52.63 
 
 		 739 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  39.47 
 
 		 985 aa  598  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  49.84 
 
 		 883 aa  592  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  52.37 
 
 		 732 aa  595  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  49.52 
 
 		 884 aa  593  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  50.92 
 
 		 947 aa  591  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  47.78 
 
 		 980 aa  590  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  47.78 
 
 		 986 aa  590  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  44.63 
 
 		 882 aa  587  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  51.52 
 
 		 692 aa  580  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  52.19 
 
 		 879 aa  580  1e-164  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  47.85 
 
 		 921 aa  580  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  44.62 
 
 		 888 aa  576  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  49.14 
 
 		 903 aa  577  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  47.24 
 
 		 907 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 936 aa  578  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  49.17 
 
 		 1161 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  46.85 
 
 		 860 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  49.33 
 
 		 896 aa  568  1e-160  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  50.33 
 
 		 720 aa  569  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  50.6 
 
 		 686 aa  568  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  51.66 
 
 		 885 aa  567  1e-160  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  50.25 
 
 		 689 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  48.8 
 
 		 873 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  51.19 
 
 		 822 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  42.4 
 
 		 1008 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  48.59 
 
 		 882 aa  565  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  51.09 
 
 		 924 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  50.94 
 
 		 949 aa  563  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  46.94 
 
 		 991 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  45.95 
 
 		 896 aa  560  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  49.2 
 
 		 922 aa  560  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  46.77 
 
 		 915 aa  561  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  53.53 
 
 		 941 aa  561  1e-158  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  49.26 
 
 		 686 aa  556  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  49.26 
 
 		 686 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  47.82 
 
 		 952 aa  556  1e-157  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  49.26 
 
 		 686 aa  556  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  49.26 
 
 		 686 aa  556  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  51.18 
 
 		 887 aa  556  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  48.96 
 
 		 876 aa  559  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  48.82 
 
 		 997 aa  556  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  49.4 
 
 		 843 aa  557  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  49.32 
 
 		 1079 aa  558  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08040  translation initiation factor IF-2  53.77 
 
 		 929 aa  559  1e-157  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13732  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 		 911 aa  556  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  48.48 
 
 		 949 aa  556  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 686 aa  554  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  48.24 
 
 		 752 aa  555  1e-156  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  49.67 
 
 		 940 aa  554  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  49.09 
 
 		 686 aa  555  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  49.09 
 
 		 686 aa  555  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  46.62 
 
 		 885 aa  553  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  47.5 
 
 		 979 aa  554  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  46.57 
 
 		 971 aa  555  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  45.02 
 
 		 834 aa  553  1e-156  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  46.57 
 
 		 971 aa  555  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  46.57 
 
 		 971 aa  555  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 		 705 aa  550  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  49.33 
 
 		 688 aa  550  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  45.55 
 
 		 894 aa  550  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 948 aa  551  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  47.55 
 
 		 884 aa  551  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  49.5 
 
 		 975 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  48.23 
 
 		 882 aa  550  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>