More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2116 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_10320  translation initiation factor 2  59.46 
 
 		 957 aa  860    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0686977  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2207  translation initiation factor IF-2  70.47 
 
 		 612 aa  861    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537417  decreased coverage  0.000616715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1370  translation initiation factor IF-2  69.51 
 
 		 999 aa  855    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.515442  normal  0.133918 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1019  translation initiation factor IF-2  69.25 
 
 		 1004 aa  887    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4039  translation initiation factor IF-2  69.48 
 
 		 930 aa  894    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.681084 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0778  translation initiation factor IF-2  74.14 
 
 		 955 aa  948    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425771  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1327  translation initiation factor IF-2  69.78 
 
 		 995 aa  856    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335521 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07010  translation initiation factor 2  68.04 
 
 		 930 aa  834    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2065  translation initiation factor IF-2  69.8 
 
 		 920 aa  871    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.636635  normal  0.928572 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1715  translation initiation factor IF-2  69.53 
 
 		 934 aa  880    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  41.5 
 
 		 985 aa  641    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7742  translation initiation factor IF-2  73.44 
 
 		 1051 aa  921    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0285  translation initiation factor IF-2  62.97 
 
 		 954 aa  805    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11480  translation initiation factor 2  67.7 
 
 		 969 aa  852    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21089  normal  0.867698 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1743  translation initiation factor IF-2  62.5 
 
 		 975 aa  796    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.695409  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1443  translation initiation factor IF-2  71.47 
 
 		 1044 aa  914    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14570  translation initiation factor 2  68.71 
 
 		 938 aa  868    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00182457  normal  0.54145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1421  translation initiation factor IF-2  71.67 
 
 		 980 aa  884    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2116  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 1051 aa  2016    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1510  translation initiation factor IF-2  70.54 
 
 		 957 aa  889    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2082  translation initiation factor IF-2  69.8 
 
 		 920 aa  871    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1061  translation initiation factor IF-2  85.15 
 
 		 961 aa  1073    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271136  normal  0.0744531 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2489  translation initiation factor IF-2  68.63 
 
 		 956 aa  857    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.872607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2152  translation initiation factor IF-2  70.43 
 
 		 938 aa  877    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0901193  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12854  translation initiation factor IF-2  69.01 
 
 		 900 aa  885    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000971271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23450  translation initiation factor 2  71.01 
 
 		 939 aa  901    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0250989  normal  0.0490514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3331  translation initiation factor IF-2  76.98 
 
 		 992 aa  974    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1426  translation initiation factor IF-2  68.27 
 
 		 954 aa  857    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000203462 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1416  translation initiation factor IF-2  69.66 
 
 		 968 aa  877    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.919668  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1211  translation initiation factor IF-2  70.08 
 
 		 951 aa  881    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186812  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  71.21 
 
 		 879 aa  969    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3190  translation initiation factor IF-2  69.58 
 
 		 938 aa  872    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2128  translation initiation factor IF-2  69.8 
 
 		 920 aa  871    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524074  normal  0.0207369 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3966  translation initiation factor IF-2  73.27 
 
 		 998 aa  931    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.602986  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1182  translation initiation factor IF-2  71.82 
 
 		 1046 aa  884    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  42.51 
 
 		 971 aa  625  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  39.63 
 
 		 1029 aa  628  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  38.4 
 
 		 1131 aa  617  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  44.96 
 
 		 882 aa  617  1e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  48.74 
 
 		 986 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  51.2 
 
 		 883 aa  602  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  53.59 
 
 		 920 aa  602  1e-170  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  48.29 
 
 		 980 aa  600  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  53.74 
 
 		 692 aa  598  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  49.68 
 
 		 884 aa  597  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  53.23 
 
 		 732 aa  594  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  52.93 
 
 		 896 aa  592  1e-167  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  53.3 
 
 		 739 aa  592  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  50.64 
 
 		 921 aa  592  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  51.08 
 
 		 903 aa  587  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  45.93 
 
 		 860 aa  585  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  54.03 
 
 		 879 aa  584  1.0000000000000001e-165  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  51.33 
 
 		 882 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  51.08 
 
 		 947 aa  582  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  46.12 
 
 		 888 aa  581  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  50.42 
 
 		 936 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  53.78 
 
 		 689 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  52.6 
 
 		 885 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  52.51 
 
 		 720 aa  575  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 1161 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  52.77 
 
 		 686 aa  570  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  52.61 
 
 		 686 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  52.77 
 
 		 686 aa  571  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  52.77 
 
 		 686 aa  571  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  47.25 
 
 		 896 aa  569  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  52.61 
 
 		 686 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  52.77 
 
 		 686 aa  571  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  52.77 
 
 		 686 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  50.67 
 
 		 898 aa  570  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  48.02 
 
 		 889 aa  568  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08040  translation initiation factor IF-2  54.42 
 
 		 929 aa  568  1e-160  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13732  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  51.91 
 
 		 705 aa  567  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  51.91 
 
 		 705 aa  567  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  47.46 
 
 		 907 aa  568  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 884 aa  567  1e-160  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  47.23 
 
 		 881 aa  568  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 885 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  50.67 
 
 		 894 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  53.22 
 
 		 686 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  46.11 
 
 		 984 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  47.73 
 
 		 885 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  49.75 
 
 		 880 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  49.42 
 
 		 952 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  51.35 
 
 		 962 aa  564  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  50 
 
 		 949 aa  563  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 889 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  50.5 
 
 		 752 aa  563  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  48.09 
 
 		 991 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 882 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  49.42 
 
 		 896 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  51.76 
 
 		 688 aa  560  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  47.26 
 
 		 894 aa  561  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  51.76 
 
 		 688 aa  562  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 		 880 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 		 880 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 		 880 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  49.67 
 
 		 885 aa  562  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  49.67 
 
 		 885 aa  562  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 911 aa  561  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  52.69 
 
 		 845 aa  561  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>