More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3331 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1019  translation initiation factor IF-2  53.28 
 
 		 1004 aa  942    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1426  translation initiation factor IF-2  64.7 
 
 		 954 aa  822    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000203462 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1327  translation initiation factor IF-2  70.73 
 
 		 995 aa  875    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335521 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3592  translation initiation factor IF-2  73.39 
 
 		 1012 aa  926    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2152  translation initiation factor IF-2  71.75 
 
 		 938 aa  897    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0901193  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0778  translation initiation factor IF-2  77.78 
 
 		 955 aa  982    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425771  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12854  translation initiation factor IF-2  70.94 
 
 		 900 aa  905    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000971271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1211  translation initiation factor IF-2  68.27 
 
 		 951 aa  862    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186812  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2207  translation initiation factor IF-2  70.64 
 
 		 612 aa  847    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537417  decreased coverage  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3966  translation initiation factor IF-2  71.34 
 
 		 998 aa  898    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.602986  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3331  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 992 aa  1925    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23450  translation initiation factor 2  68.07 
 
 		 939 aa  865    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0250989  normal  0.0490514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1370  translation initiation factor IF-2  70.41 
 
 		 999 aa  874    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.515442  normal  0.133918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2314  translation initiation factor IF-2  70.89 
 
 		 930 aa  898    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596134  normal  0.0338999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2116  translation initiation factor IF-2  77.09 
 
 		 1051 aa  988    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5834  translation initiation factor IF-2  71.23 
 
 		 1034 aa  889    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1421  translation initiation factor IF-2  67.86 
 
 		 980 aa  825    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10320  translation initiation factor 2  54.46 
 
 		 957 aa  931    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0686977  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2489  translation initiation factor IF-2  66.25 
 
 		 956 aa  829    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.872607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4039  translation initiation factor IF-2  70.47 
 
 		 930 aa  910    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.681084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1443  translation initiation factor IF-2  67.45 
 
 		 1044 aa  855    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  41.08 
 
 		 882 aa  638    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  60.3 
 
 		 879 aa  1014    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3190  translation initiation factor IF-2  72.46 
 
 		 938 aa  910    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  39.66 
 
 		 1029 aa  629  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  51.85 
 
 		 883 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  51.93 
 
 		 884 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  40.1 
 
 		 985 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  46.35 
 
 		 882 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  39.69 
 
 		 1079 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  53.36 
 
 		 920 aa  602  1e-170  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  41.67 
 
 		 903 aa  602  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  47.76 
 
 		 888 aa  597  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  53.01 
 
 		 739 aa  596  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  41.89 
 
 		 971 aa  599  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  49.16 
 
 		 896 aa  597  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  53.46 
 
 		 692 aa  597  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  51.77 
 
 		 921 aa  597  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  55.2 
 
 		 879 aa  593  1e-168  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  47.76 
 
 		 986 aa  592  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 885 aa  591  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  52.09 
 
 		 732 aa  591  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  47.37 
 
 		 860 aa  592  1e-167  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  50.84 
 
 		 885 aa  586  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 922 aa  586  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  46.39 
 
 		 947 aa  588  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  53.92 
 
 		 924 aa  587  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  48.55 
 
 		 894 aa  586  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  50.92 
 
 		 889 aa  586  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  50.84 
 
 		 880 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  50.5 
 
 		 880 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  50.84 
 
 		 880 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  48.23 
 
 		 984 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  49.11 
 
 		 980 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  50.84 
 
 		 880 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  47.97 
 
 		 907 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  51.26 
 
 		 896 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 881 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  50.84 
 
 		 880 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  40.52 
 
 		 1131 aa  581  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  50.16 
 
 		 873 aa  582  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  52.04 
 
 		 898 aa  579  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  50.25 
 
 		 885 aa  581  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  50.25 
 
 		 885 aa  581  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  52.92 
 
 		 822 aa  581  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  50.59 
 
 		 882 aa  582  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  48.45 
 
 		 936 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  51.6 
 
 		 992 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  47.78 
 
 		 971 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  47.78 
 
 		 971 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  47.78 
 
 		 971 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  47.61 
 
 		 949 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  49.33 
 
 		 884 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  50.59 
 
 		 843 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  51.34 
 
 		 984 aa  573  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  50.92 
 
 		 911 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  52.29 
 
 		 885 aa  575  1.0000000000000001e-162  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  45.66 
 
 		 834 aa  574  1.0000000000000001e-162  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  47.26 
 
 		 896 aa  571  1e-161  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  46 
 
 		 956 aa  570  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 1161 aa  571  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  48.3 
 
 		 975 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  47.57 
 
 		 972 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  48.3 
 
 		 975 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  48.3 
 
 		 975 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  48.3 
 
 		 975 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  47.6 
 
 		 991 aa  572  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  47.54 
 
 		 889 aa  567  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  48.88 
 
 		 904 aa  569  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  49.12 
 
 		 915 aa  569  1e-160  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01760  translation initiation factor IF-2  50.25 
 
 		 868 aa  567  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  47.86 
 
 		 976 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  48.15 
 
 		 975 aa  568  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  51.59 
 
 		 972 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  48.15 
 
 		 975 aa  568  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  54.41 
 
 		 689 aa  567  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  50.85 
 
 		 894 aa  569  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  51.59 
 
 		 971 aa  568  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  51.51 
 
 		 962 aa  567  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  52.63 
 
 		 686 aa  568  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>