More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3592 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2489  translation initiation factor IF-2  65.22 
 
 		 956 aa  816    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.872607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07010  translation initiation factor 2  65.71 
 
 		 930 aa  826    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1426  translation initiation factor IF-2  64.96 
 
 		 954 aa  838    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000203462 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0778  translation initiation factor IF-2  67.76 
 
 		 955 aa  1209    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425771  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1443  translation initiation factor IF-2  67.6 
 
 		 1044 aa  866    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1182  translation initiation factor IF-2  68.47 
 
 		 1046 aa  859    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14570  translation initiation factor 2  68.76 
 
 		 938 aa  889    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00182457  normal  0.54145 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1211  translation initiation factor IF-2  67.44 
 
 		 951 aa  852    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186812  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2152  translation initiation factor IF-2  70.79 
 
 		 938 aa  897    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0901193  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4039  translation initiation factor IF-2  68.7 
 
 		 930 aa  902    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.681084 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  43.65 
 
 		 971 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23450  translation initiation factor 2  67.39 
 
 		 939 aa  849    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0250989  normal  0.0490514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5834  translation initiation factor IF-2  69.97 
 
 		 1034 aa  863    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3562  translation initiation factor IF-2  68.94 
 
 		 1062 aa  846    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1061  translation initiation factor IF-2  73.34 
 
 		 961 aa  922    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271136  normal  0.0744531 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0285  translation initiation factor IF-2  61.08 
 
 		 954 aa  787    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2065  translation initiation factor IF-2  68.7 
 
 		 920 aa  882    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.636635  normal  0.928572 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12854  translation initiation factor IF-2  69.01 
 
 		 900 aa  900    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000971271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10320  translation initiation factor 2  59.5 
 
 		 957 aa  885    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0686977  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1510  translation initiation factor IF-2  67.86 
 
 		 957 aa  851    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1715  translation initiation factor IF-2  69.22 
 
 		 934 aa  890    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2082  translation initiation factor IF-2  68.7 
 
 		 920 aa  882    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1019  translation initiation factor IF-2  68.06 
 
 		 1004 aa  863    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2207  translation initiation factor IF-2  69.66 
 
 		 612 aa  841    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537417  decreased coverage  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  39.98 
 
 		 1029 aa  645    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1743  translation initiation factor IF-2  60.92 
 
 		 975 aa  784    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.695409  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1416  translation initiation factor IF-2  66.05 
 
 		 968 aa  850    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.919668  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  62.84 
 
 		 879 aa  922    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3592  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 1012 aa  1957    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3190  translation initiation factor IF-2  66.61 
 
 		 938 aa  841    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2128  translation initiation factor IF-2  68.7 
 
 		 920 aa  882    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524074  normal  0.0207369 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2314  translation initiation factor IF-2  68.23 
 
 		 930 aa  880    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596134  normal  0.0338999 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  40.51 
 
 		 882 aa  631  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  52.09 
 
 		 920 aa  606  9.999999999999999e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  40.34 
 
 		 985 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 921 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  50.5 
 
 		 883 aa  579  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  49.04 
 
 		 884 aa  581  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  40.53 
 
 		 1161 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  44.82 
 
 		 882 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  52.17 
 
 		 903 aa  578  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  37.78 
 
 		 1131 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  44.46 
 
 		 888 aa  574  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  45.63 
 
 		 986 aa  571  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  45.01 
 
 		 860 aa  566  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  51.09 
 
 		 894 aa  567  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  46.86 
 
 		 907 aa  567  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  44.9 
 
 		 1079 aa  567  1e-160  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  51.49 
 
 		 879 aa  568  1e-160  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 882 aa  566  1e-160  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  45.9 
 
 		 980 aa  569  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  49.45 
 
 		 902 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  50.92 
 
 		 720 aa  564  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  51.53 
 
 		 895 aa  563  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  52.18 
 
 		 924 aa  560  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  44.03 
 
 		 956 aa  560  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  50.51 
 
 		 692 aa  562  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  48.99 
 
 		 752 aa  556  1e-157  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  48.09 
 
 		 947 aa  556  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  47.77 
 
 		 971 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  47.92 
 
 		 971 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  47.77 
 
 		 971 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  47.06 
 
 		 896 aa  553  1e-156  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 885 aa  555  1e-156  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  47.76 
 
 		 904 aa  554  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1867  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 		 1038 aa  553  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  50.61 
 
 		 873 aa  553  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4217  translation initiation factor 2  45.27 
 
 		 1011 aa  553  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726068  normal  0.0540264 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  50.42 
 
 		 739 aa  552  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 732 aa  555  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  46.55 
 
 		 881 aa  555  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  48.4 
 
 		 971 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  48.4 
 
 		 972 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  49.08 
 
 		 889 aa  550  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  50.59 
 
 		 705 aa  552  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 		 686 aa  551  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  50.59 
 
 		 705 aa  552  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  47.48 
 
 		 922 aa  550  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  47.92 
 
 		 972 aa  551  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  46.69 
 
 		 964 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  44.6 
 
 		 984 aa  551  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  50.68 
 
 		 898 aa  551  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  47.84 
 
 		 949 aa  552  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  48.16 
 
 		 896 aa  550  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  45.63 
 
 		 892 aa  551  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  51.61 
 
 		 887 aa  551  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  46.66 
 
 		 885 aa  548  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  50.93 
 
 		 822 aa  548  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  46.41 
 
 		 885 aa  547  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 		 896 aa  549  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  48.39 
 
 		 965 aa  547  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  49.08 
 
 		 891 aa  547  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  46.13 
 
 		 979 aa  547  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  49.5 
 
 		 875 aa  547  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  47.99 
 
 		 936 aa  546  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  48.71 
 
 		 949 aa  549  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  46.41 
 
 		 889 aa  546  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  49.5 
 
 		 875 aa  547  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 		 882 aa  546  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  47.4 
 
 		 880 aa  546  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>