More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5834 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2207  translation initiation factor IF-2  75.2 
 
 		 612 aa  916    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537417  decreased coverage  0.000616715 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1743  translation initiation factor IF-2  63.75 
 
 		 975 aa  806    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.695409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2116  translation initiation factor IF-2  71.23 
 
 		 1051 aa  902    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4039  translation initiation factor IF-2  80.41 
 
 		 930 aa  1040    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.681084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3966  translation initiation factor IF-2  76.08 
 
 		 998 aa  964    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.602986  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1715  translation initiation factor IF-2  79.97 
 
 		 934 aa  1019    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1510  translation initiation factor IF-2  70.08 
 
 		 957 aa  892    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0778  translation initiation factor IF-2  69.17 
 
 		 955 aa  884    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425771  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23450  translation initiation factor 2  70.54 
 
 		 939 aa  902    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0250989  normal  0.0490514 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1443  translation initiation factor IF-2  68.48 
 
 		 1044 aa  874    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1421  translation initiation factor IF-2  69.53 
 
 		 980 aa  856    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3562  translation initiation factor IF-2  69.57 
 
 		 1062 aa  849    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0285  translation initiation factor IF-2  63.75 
 
 		 954 aa  812    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1211  translation initiation factor IF-2  68.99 
 
 		 951 aa  872    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186812  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3331  translation initiation factor IF-2  71.38 
 
 		 992 aa  902    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5834  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 1034 aa  2000    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7742  translation initiation factor IF-2  73.96 
 
 		 1051 aa  954    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1426  translation initiation factor IF-2  67.13 
 
 		 954 aa  857    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000203462 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2489  translation initiation factor IF-2  67.6 
 
 		 956 aa  852    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.872607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10320  translation initiation factor 2  53.71 
 
 		 957 aa  852    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0686977  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1061  translation initiation factor IF-2  71.7 
 
 		 961 aa  895    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271136  normal  0.0744531 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11480  translation initiation factor 2  67.55 
 
 		 969 aa  862    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21089  normal  0.867698 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1019  translation initiation factor IF-2  69.61 
 
 		 1004 aa  886    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3592  translation initiation factor IF-2  69.86 
 
 		 1012 aa  887    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12854  translation initiation factor IF-2  80.28 
 
 		 900 aa  1034    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000971271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1416  translation initiation factor IF-2  68.06 
 
 		 968 aa  875    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.919668  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1182  translation initiation factor IF-2  69.54 
 
 		 1046 aa  866    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  72.3 
 
 		 879 aa  910    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3190  translation initiation factor IF-2  70.25 
 
 		 938 aa  910    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07010  translation initiation factor 2  68.36 
 
 		 930 aa  837    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2314  translation initiation factor IF-2  80.72 
 
 		 930 aa  1019    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596134  normal  0.0338999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  43.47 
 
 		 971 aa  632  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  40.89 
 
 		 985 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  54.45 
 
 		 920 aa  613  9.999999999999999e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  39.04 
 
 		 1029 aa  615  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  52.08 
 
 		 947 aa  600  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  54.95 
 
 		 860 aa  597  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  43.85 
 
 		 882 aa  597  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  54.47 
 
 		 739 aa  597  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  48.08 
 
 		 986 aa  593  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  54.16 
 
 		 732 aa  595  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  51.75 
 
 		 883 aa  590  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  51.42 
 
 		 884 aa  590  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  47.64 
 
 		 980 aa  590  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  48.12 
 
 		 922 aa  588  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  47.1 
 
 		 907 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  51.51 
 
 		 898 aa  581  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  50.9 
 
 		 882 aa  582  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08040  translation initiation factor IF-2  54.96 
 
 		 929 aa  581  1e-164  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13732  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  49.37 
 
 		 921 aa  580  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  39.31 
 
 		 1079 aa  579  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  50.75 
 
 		 752 aa  577  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  51.34 
 
 		 894 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  52.18 
 
 		 879 aa  572  1e-161  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  50.08 
 
 		 843 aa  570  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  49.92 
 
 		 949 aa  571  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  46.72 
 
 		 964 aa  568  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  50.5 
 
 		 891 aa  567  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  54.47 
 
 		 941 aa  568  1e-160  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  49.08 
 
 		 903 aa  568  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 		 692 aa  566  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  49.34 
 
 		 1161 aa  568  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  48.48 
 
 		 902 aa  567  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  46.12 
 
 		 888 aa  566  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  46.78 
 
 		 964 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  51.75 
 
 		 720 aa  564  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 		 936 aa  565  1.0000000000000001e-159  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 948 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  47.32 
 
 		 896 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 834 aa  565  1.0000000000000001e-159  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  51.86 
 
 		 845 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  46.86 
 
 		 992 aa  562  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  49.58 
 
 		 889 aa  562  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  46.44 
 
 		 975 aa  562  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  46.44 
 
 		 975 aa  562  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  46.3 
 
 		 975 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  47.45 
 
 		 971 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  46.3 
 
 		 975 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  48.23 
 
 		 972 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  48.71 
 
 		 896 aa  561  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  46.44 
 
 		 975 aa  562  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  46.3 
 
 		 975 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  50.51 
 
 		 876 aa  560  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  48.11 
 
 		 873 aa  561  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  46.98 
 
 		 979 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  47.45 
 
 		 971 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  46.44 
 
 		 975 aa  562  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  48.23 
 
 		 971 aa  562  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  47.45 
 
 		 971 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  51.32 
 
 		 689 aa  561  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  47.32 
 
 		 894 aa  558  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  51.59 
 
 		 686 aa  558  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  47.77 
 
 		 969 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1701  translation initiation factor IF-2  50.76 
 
 		 991 aa  556  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192656 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  51.76 
 
 		 686 aa  558  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  46.01 
 
 		 976 aa  558  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  47.08 
 
 		 968 aa  557  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  51.59 
 
 		 686 aa  558  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  51.53 
 
 		 686 aa  559  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  48.19 
 
 		 885 aa  558  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>