More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1715 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_23450  translation initiation factor 2  69.25 
 
 		 939 aa  870    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0250989  normal  0.0490514 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1743  translation initiation factor IF-2  63.22 
 
 		 975 aa  789    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.695409  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4039  translation initiation factor IF-2  90.42 
 
 		 930 aa  1175    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.681084 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10320  translation initiation factor 2  56.91 
 
 		 957 aa  936    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0686977  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1510  translation initiation factor IF-2  67.55 
 
 		 957 aa  850    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1715  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 934 aa  1829    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3966  translation initiation factor IF-2  71.88 
 
 		 998 aa  917    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.602986  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0778  translation initiation factor IF-2  68.76 
 
 		 955 aa  884    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425771  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11480  translation initiation factor 2  56.63 
 
 		 969 aa  927    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21089  normal  0.867698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2489  translation initiation factor IF-2  66.56 
 
 		 956 aa  833    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.872607  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1061  translation initiation factor IF-2  69.83 
 
 		 961 aa  869    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271136  normal  0.0744531 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1327  translation initiation factor IF-2  68.35 
 
 		 995 aa  843    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335521 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2207  translation initiation factor IF-2  71.29 
 
 		 612 aa  863    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537417  decreased coverage  0.000616715 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3592  translation initiation factor IF-2  68.88 
 
 		 1012 aa  894    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5834  translation initiation factor IF-2  79.78 
 
 		 1034 aa  997    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7742  translation initiation factor IF-2  73.72 
 
 		 1051 aa  949    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14570  translation initiation factor 2  77.25 
 
 		 938 aa  992    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00182457  normal  0.54145 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12854  translation initiation factor IF-2  86.48 
 
 		 900 aa  1126    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000971271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07010  translation initiation factor 2  66.72 
 
 		 930 aa  825    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2082  translation initiation factor IF-2  91.05 
 
 		 920 aa  1157    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2065  translation initiation factor IF-2  91.05 
 
 		 920 aa  1157    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.636635  normal  0.928572 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1426  translation initiation factor IF-2  65.99 
 
 		 954 aa  840    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000203462 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0285  translation initiation factor IF-2  64.01 
 
 		 954 aa  802    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1443  translation initiation factor IF-2  69.83 
 
 		 1044 aa  886    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1211  translation initiation factor IF-2  67.24 
 
 		 951 aa  848    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186812  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1370  translation initiation factor IF-2  68.4 
 
 		 999 aa  847    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.515442  normal  0.133918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1416  translation initiation factor IF-2  66.77 
 
 		 968 aa  857    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.919668  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1019  translation initiation factor IF-2  67.81 
 
 		 1004 aa  853    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  59.35 
 
 		 879 aa  972    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1421  translation initiation factor IF-2  66.82 
 
 		 980 aa  827    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3190  translation initiation factor IF-2  72.03 
 
 		 938 aa  922    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2128  translation initiation factor IF-2  91.05 
 
 		 920 aa  1157    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524074  normal  0.0207369 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2314  translation initiation factor IF-2  90.74 
 
 		 930 aa  1146    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596134  normal  0.0338999 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  42.23 
 
 		 882 aa  626  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  41.9 
 
 		 985 aa  612  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  38.57 
 
 		 1029 aa  597  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  51.45 
 
 		 883 aa  591  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  42.15 
 
 		 971 aa  590  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  47.9 
 
 		 980 aa  587  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  50.4 
 
 		 884 aa  588  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  48.09 
 
 		 907 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  46.67 
 
 		 882 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  51.34 
 
 		 920 aa  582  1.0000000000000001e-165  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  40.44 
 
 		 903 aa  579  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  52.72 
 
 		 686 aa  579  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  51.25 
 
 		 921 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  50.5 
 
 		 898 aa  574  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  50.42 
 
 		 947 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  52.55 
 
 		 739 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 891 aa  570  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  45.8 
 
 		 888 aa  572  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  49.52 
 
 		 949 aa  569  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  50.5 
 
 		 894 aa  568  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  52.04 
 
 		 860 aa  567  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  49.58 
 
 		 885 aa  566  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  42.41 
 
 		 922 aa  566  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  51.02 
 
 		 732 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  49.75 
 
 		 880 aa  566  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  50.09 
 
 		 692 aa  567  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  49.24 
 
 		 881 aa  565  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  47.71 
 
 		 889 aa  566  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 		 880 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  46.97 
 
 		 885 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 752 aa  564  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 		 880 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 		 880 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 		 880 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  47.39 
 
 		 885 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  47.39 
 
 		 885 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  49.67 
 
 		 896 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08040  translation initiation factor IF-2  53.69 
 
 		 929 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13732  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  49.6 
 
 		 992 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  49.2 
 
 		 902 aa  562  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  49.08 
 
 		 884 aa  562  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  48.74 
 
 		 882 aa  559  1e-158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  47.16 
 
 		 834 aa  559  1e-158  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  47.57 
 
 		 979 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  48.83 
 
 		 894 aa  556  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  51.33 
 
 		 879 aa  558  1e-157  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  46.81 
 
 		 964 aa  558  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  47 
 
 		 882 aa  557  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  42.26 
 
 		 1131 aa  558  1e-157  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3221  translation initiation factor IF-2  50.68 
 
 		 815 aa  554  1e-156  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.109257 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  46.72 
 
 		 964 aa  555  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  45.92 
 
 		 1058 aa  553  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  47.57 
 
 		 880 aa  554  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 895 aa  552  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  48.02 
 
 		 964 aa  551  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  46.58 
 
 		 889 aa  551  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  52.66 
 
 		 941 aa  552  1e-155  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  38.04 
 
 		 992 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1867  translation initiation factor IF-2  47.76 
 
 		 1038 aa  551  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  51.01 
 
 		 949 aa  550  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  48.02 
 
 		 876 aa  550  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  50.51 
 
 		 948 aa  551  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  39.94 
 
 		 940 aa  551  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  48.2 
 
 		 896 aa  551  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  49.67 
 
 		 1079 aa  549  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  45.65 
 
 		 897 aa  548  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  38.04 
 
 		 992 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.718402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>