More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1327 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_10320  translation initiation factor 2  54.74 
 
 		 957 aa  917    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0686977  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12854  translation initiation factor IF-2  67.96 
 
 		 900 aa  851    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000971271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07010  translation initiation factor 2  65.98 
 
 		 930 aa  813    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1061  translation initiation factor IF-2  70.91 
 
 		 961 aa  867    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271136  normal  0.0744531 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1327  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 995 aa  1946    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335521 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2489  translation initiation factor IF-2  69.41 
 
 		 956 aa  863    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.872607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5834  translation initiation factor IF-2  68.5 
 
 		 1034 aa  837    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23450  translation initiation factor 2  70.5 
 
 		 939 aa  892    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0250989  normal  0.0490514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2314  translation initiation factor IF-2  67.71 
 
 		 930 aa  856    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596134  normal  0.0338999 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  40.36 
 
 		 1029 aa  640    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11480  translation initiation factor 2  67.65 
 
 		 969 aa  845    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21089  normal  0.867698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3592  translation initiation factor IF-2  66.56 
 
 		 1012 aa  832    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1421  translation initiation factor IF-2  80.38 
 
 		 980 aa  1016    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4039  translation initiation factor IF-2  69.16 
 
 		 930 aa  875    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.681084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2207  translation initiation factor IF-2  68.29 
 
 		 612 aa  812    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537417  decreased coverage  0.000616715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2065  translation initiation factor IF-2  67.29 
 
 		 920 aa  838    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.636635  normal  0.928572 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2082  translation initiation factor IF-2  67.29 
 
 		 920 aa  838    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1715  translation initiation factor IF-2  68.22 
 
 		 934 aa  872    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1426  translation initiation factor IF-2  66.41 
 
 		 954 aa  846    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000203462 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1019  translation initiation factor IF-2  69.77 
 
 		 1004 aa  880    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1510  translation initiation factor IF-2  69.88 
 
 		 957 aa  888    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1211  translation initiation factor IF-2  69.41 
 
 		 951 aa  874    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186812  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3331  translation initiation factor IF-2  70.73 
 
 		 992 aa  886    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0285  translation initiation factor IF-2  60.51 
 
 		 954 aa  771    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1182  translation initiation factor IF-2  72.13 
 
 		 1046 aa  890    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1743  translation initiation factor IF-2  60.51 
 
 		 975 aa  767    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.695409  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1443  translation initiation factor IF-2  69.83 
 
 		 1044 aa  885    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1416  translation initiation factor IF-2  67.03 
 
 		 968 aa  860    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.919668  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  64.56 
 
 		 879 aa  890    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3190  translation initiation factor IF-2  69.42 
 
 		 938 aa  862    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7742  translation initiation factor IF-2  71.77 
 
 		 1051 aa  891    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2128  translation initiation factor IF-2  67.29 
 
 		 920 aa  838    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524074  normal  0.0207369 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  49.85 
 
 		 907 aa  619  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  39.64 
 
 		 882 aa  611  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  40.49 
 
 		 985 aa  612  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  53.69 
 
 		 920 aa  607  9.999999999999999e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  50.29 
 
 		 979 aa  607  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  53.05 
 
 		 732 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  48.41 
 
 		 964 aa  602  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  48.41 
 
 		 964 aa  601  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  51.85 
 
 		 903 aa  601  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  53.9 
 
 		 739 aa  601  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  47.72 
 
 		 986 aa  596  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  51.07 
 
 		 921 aa  596  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  53.47 
 
 		 975 aa  594  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  49.12 
 
 		 971 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  53.47 
 
 		 975 aa  594  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  50.23 
 
 		 922 aa  595  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  53.47 
 
 		 975 aa  594  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  53.3 
 
 		 975 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  53.98 
 
 		 968 aa  593  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  53.3 
 
 		 975 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  53.47 
 
 		 975 aa  594  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 883 aa  590  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  43.46 
 
 		 882 aa  590  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  47.85 
 
 		 980 aa  590  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  49.93 
 
 		 904 aa  589  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  53.3 
 
 		 975 aa  592  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  53.92 
 
 		 924 aa  592  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  53.13 
 
 		 976 aa  589  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  49.26 
 
 		 971 aa  592  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  45.93 
 
 		 1079 aa  589  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  46.85 
 
 		 860 aa  590  1e-167  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  49.26 
 
 		 971 aa  592  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  53.96 
 
 		 885 aa  588  1e-166  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  51.52 
 
 		 947 aa  586  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  49.37 
 
 		 884 aa  587  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  49.75 
 
 		 936 aa  586  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 876 aa  588  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  50.84 
 
 		 896 aa  586  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  52.1 
 
 		 971 aa  588  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  52.66 
 
 		 949 aa  588  1e-166  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  52.1 
 
 		 972 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  50.76 
 
 		 896 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  52.03 
 
 		 971 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  53.47 
 
 		 966 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  49.1 
 
 		 972 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  52.62 
 
 		 969 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  48 
 
 		 881 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 911 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  50.83 
 
 		 896 aa  581  1e-164  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  48.73 
 
 		 964 aa  581  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  48.16 
 
 		 880 aa  580  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  51.45 
 
 		 898 aa  580  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  49.61 
 
 		 992 aa  580  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  51.7 
 
 		 986 aa  579  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  53.85 
 
 		 962 aa  581  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  48 
 
 		 880 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  48 
 
 		 880 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  48 
 
 		 880 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  47.55 
 
 		 885 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  51.28 
 
 		 692 aa  579  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  48 
 
 		 880 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  47.66 
 
 		 884 aa  579  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 		 894 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  47.55 
 
 		 889 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  49.16 
 
 		 948 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  51.87 
 
 		 965 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1701  translation initiation factor IF-2  52.62 
 
 		 991 aa  576  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  51.44 
 
 		 989 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>