More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7742 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4039  translation initiation factor IF-2  74.33 
 
 		 930 aa  980    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.681084 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10320  translation initiation factor 2  55.84 
 
 		 957 aa  983    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0686977  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1715  translation initiation factor IF-2  74.06 
 
 		 934 aa  961    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07010  translation initiation factor 2  68.47 
 
 		 930 aa  869    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1426  translation initiation factor IF-2  69.21 
 
 		 954 aa  904    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000203462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1182  translation initiation factor IF-2  72.57 
 
 		 1046 aa  902    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0778  translation initiation factor IF-2  72.73 
 
 		 955 aa  936    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425771  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23450  translation initiation factor 2  71.43 
 
 		 939 aa  927    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0250989  normal  0.0490514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1327  translation initiation factor IF-2  65.3 
 
 		 995 aa  815    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3331  translation initiation factor IF-2  75.24 
 
 		 992 aa  950    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11480  translation initiation factor 2  59.29 
 
 		 969 aa  912    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21089  normal  0.867698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2489  translation initiation factor IF-2  69.72 
 
 		 956 aa  900    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.872607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14570  translation initiation factor 2  74.02 
 
 		 938 aa  959    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00182457  normal  0.54145 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1061  translation initiation factor IF-2  75.28 
 
 		 961 aa  937    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271136  normal  0.0744531 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3562  translation initiation factor IF-2  72.45 
 
 		 1062 aa  874    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1019  translation initiation factor IF-2  56.92 
 
 		 1004 aa  996    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7742  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 1051 aa  2027    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2152  translation initiation factor IF-2  74.56 
 
 		 938 aa  948    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0901193  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1743  translation initiation factor IF-2  64.98 
 
 		 975 aa  841    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.695409  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2082  translation initiation factor IF-2  74.18 
 
 		 920 aa  955    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2116  translation initiation factor IF-2  73.54 
 
 		 1051 aa  945    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0285  translation initiation factor IF-2  65.29 
 
 		 954 aa  844    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1510  translation initiation factor IF-2  70.34 
 
 		 957 aa  915    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3592  translation initiation factor IF-2  71.14 
 
 		 1012 aa  926    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1370  translation initiation factor IF-2  71.84 
 
 		 999 aa  892    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.515442  normal  0.133918 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1211  translation initiation factor IF-2  72.05 
 
 		 951 aa  926    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186812  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1416  translation initiation factor IF-2  69.83 
 
 		 968 aa  919    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.919668  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3966  translation initiation factor IF-2  71.5 
 
 		 998 aa  926    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.602986  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  64.63 
 
 		 879 aa  962    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2065  translation initiation factor IF-2  74.18 
 
 		 920 aa  955    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.636635  normal  0.928572 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3190  translation initiation factor IF-2  71.61 
 
 		 938 aa  920    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2207  translation initiation factor IF-2  73.08 
 
 		 612 aa  908    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537417  decreased coverage  0.000616715 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2128  translation initiation factor IF-2  74.18 
 
 		 920 aa  955    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524074  normal  0.0207369 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12854  translation initiation factor IF-2  74.06 
 
 		 900 aa  968    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000971271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2314  translation initiation factor IF-2  74.65 
 
 		 930 aa  962    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596134  normal  0.0338999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  42.6 
 
 		 971 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  53.76 
 
 		 920 aa  627  1e-178  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  40 
 
 		 1029 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  38.07 
 
 		 1131 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  43.03 
 
 		 985 aa  612  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  55.46 
 
 		 879 aa  611  1e-173  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  50.64 
 
 		 883 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  53.31 
 
 		 739 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  50.32 
 
 		 884 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  47.32 
 
 		 860 aa  602  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  52.38 
 
 		 732 aa  598  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  42.59 
 
 		 882 aa  598  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  50.83 
 
 		 1161 aa  593  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  50.89 
 
 		 921 aa  593  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  50.85 
 
 		 903 aa  592  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  51.52 
 
 		 692 aa  589  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  48.19 
 
 		 986 aa  590  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  47.73 
 
 		 980 aa  587  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  45.55 
 
 		 947 aa  580  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  53.01 
 
 		 885 aa  582  1e-164  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  50.25 
 
 		 752 aa  580  1e-164  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 936 aa  582  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08040  translation initiation factor IF-2  53.85 
 
 		 929 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13732  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  45.08 
 
 		 888 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  51.18 
 
 		 845 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  44.41 
 
 		 956 aa  574  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  52.9 
 
 		 689 aa  576  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  50.75 
 
 		 882 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  46.98 
 
 		 907 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3221  translation initiation factor IF-2  52.51 
 
 		 815 aa  575  1.0000000000000001e-162  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.109257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  49.76 
 
 		 992 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  51.93 
 
 		 720 aa  572  1e-161  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  50.66 
 
 		 686 aa  572  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  50.16 
 
 		 686 aa  570  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  50.66 
 
 		 686 aa  572  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  50.66 
 
 		 686 aa  572  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  47.49 
 
 		 922 aa  572  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  52.05 
 
 		 686 aa  570  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  47.09 
 
 		 984 aa  571  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  50.16 
 
 		 686 aa  570  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  50.66 
 
 		 686 aa  572  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  48.49 
 
 		 952 aa  570  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  43.33 
 
 		 1008 aa  572  1e-161  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  51.02 
 
 		 686 aa  572  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  46.5 
 
 		 834 aa  570  1e-161  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  47 
 
 		 991 aa  572  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0255  translation initiation factor IF-2  38.43 
 
 		 979 aa  569  1e-160  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  48.1 
 
 		 915 aa  569  1e-160  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  52.01 
 
 		 949 aa  567  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  51.18 
 
 		 822 aa  569  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  53.52 
 
 		 941 aa  565  1.0000000000000001e-159  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  51.63 
 
 		 1035 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  51.17 
 
 		 948 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  49.11 
 
 		 949 aa  565  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  50.59 
 
 		 705 aa  560  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0398  translation initiation factor IF-2  48.58 
 
 		 986 aa  559  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0010836  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 911 aa  561  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  48.99 
 
 		 1022 aa  559  1e-158  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 898 aa  560  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  51.03 
 
 		 688 aa  561  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  50.86 
 
 		 688 aa  562  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  48.49 
 
 		 882 aa  560  1e-158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  50.59 
 
 		 705 aa  560  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  47.6 
 
 		 945 aa  561  1e-158  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  47.09 
 
 		 971 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>