More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0255 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  53.38 
 
 		 883 aa  659    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0255  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 979 aa  1979    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0139  translation initiation factor IF-2  46.29 
 
 		 908 aa  804    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  59.8 
 
 		 924 aa  721    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  64.69 
 
 		 945 aa  890    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  54.1 
 
 		 947 aa  645    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  52.99 
 
 		 915 aa  683    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  54.27 
 
 		 1022 aa  678    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  53.16 
 
 		 884 aa  655    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  47.47 
 
 		 952 aa  691    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0141  translation initiation factor IF-2  49.56 
 
 		 1010 aa  880    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  55.75 
 
 		 907 aa  643    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  50.8 
 
 		 911 aa  678    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  41.36 
 
 		 971 aa  660    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  48.89 
 
 		 956 aa  866    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  52.87 
 
 		 980 aa  640    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  48.18 
 
 		 1008 aa  844    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  54.81 
 
 		 936 aa  694    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0653  translation initiation factor IF-2  52.26 
 
 		 1204 aa  662    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.696738  normal  0.0609071 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  64.53 
 
 		 943 aa  855    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0398  translation initiation factor IF-2  54.2 
 
 		 986 aa  673    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0010836  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  54.84 
 
 		 882 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0032  translation initiation factor IF-2  62.81 
 
 		 1016 aa  795    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.247962 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  54 
 
 		 921 aa  660    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  53.69 
 
 		 991 aa  694    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1215  translation initiation factor IF-2  62.85 
 
 		 1148 aa  791    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  47.83 
 
 		 1029 aa  633  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  53.69 
 
 		 985 aa  631  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  54.72 
 
 		 822 aa  627  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  54.47 
 
 		 903 aa  625  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  54.48 
 
 		 686 aa  620  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  51.5 
 
 		 949 aa  619  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  55.02 
 
 		 922 aa  619  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  51.98 
 
 		 892 aa  616  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  55.63 
 
 		 965 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  54.01 
 
 		 975 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  53.85 
 
 		 975 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  53.38 
 
 		 898 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  53.85 
 
 		 975 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  54.01 
 
 		 975 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  53.68 
 
 		 976 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  53.66 
 
 		 692 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  54.01 
 
 		 975 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  53.85 
 
 		 975 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  54.01 
 
 		 975 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  51.98 
 
 		 896 aa  610  1e-173  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  51.65 
 
 		 720 aa  610  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  52.79 
 
 		 732 aa  610  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  52.6 
 
 		 876 aa  612  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  54.08 
 
 		 888 aa  611  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  55.11 
 
 		 989 aa  611  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  53.9 
 
 		 845 aa  612  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  53.19 
 
 		 971 aa  611  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  55.88 
 
 		 968 aa  607  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  51.11 
 
 		 959 aa  608  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  52.41 
 
 		 1161 aa  608  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  51.99 
 
 		 887 aa  606  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  53.95 
 
 		 971 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  50.83 
 
 		 835 aa  608  9.999999999999999e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  53.95 
 
 		 971 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  53.19 
 
 		 972 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  54.64 
 
 		 969 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  53.95 
 
 		 971 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  53.78 
 
 		 739 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  50.94 
 
 		 964 aa  607  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  52.81 
 
 		 984 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  54.59 
 
 		 986 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  53.09 
 
 		 979 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  51.99 
 
 		 894 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  53.66 
 
 		 679 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  53.16 
 
 		 679 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  51.48 
 
 		 689 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  51.11 
 
 		 990 aa  604  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  52.17 
 
 		 686 aa  599  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 		 875 aa  602  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  52.51 
 
 		 686 aa  600  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  51.38 
 
 		 705 aa  600  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  53.95 
 
 		 972 aa  601  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  52.51 
 
 		 686 aa  600  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  51.38 
 
 		 705 aa  600  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 		 875 aa  602  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  52.17 
 
 		 686 aa  599  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  52.17 
 
 		 686 aa  598  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  54.39 
 
 		 964 aa  598  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  53.25 
 
 		 1079 aa  597  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  52.17 
 
 		 686 aa  598  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  53.63 
 
 		 992 aa  598  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  52.17 
 
 		 686 aa  598  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  52.71 
 
 		 887 aa  598  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  54.3 
 
 		 904 aa  597  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  53.29 
 
 		 943 aa  596  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  50.69 
 
 		 1079 aa  598  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  53.29 
 
 		 943 aa  596  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  54.05 
 
 		 860 aa  597  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  46.67 
 
 		 881 aa  598  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  52.15 
 
 		 962 aa  596  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  51.41 
 
 		 848 aa  597  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  54.58 
 
 		 966 aa  593  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  51.12 
 
 		 884 aa  594  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  50.77 
 
 		 896 aa  592  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>