More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3221 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  56.62 
 
 
689 aa  652    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3221  translation initiation factor IF-2  100 
 
 
815 aa  1607    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.109257 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  53.07 
 
 
732 aa  620  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  53.77 
 
 
739 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  40.69 
 
 
882 aa  617  1e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  48 
 
 
985 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  53.1 
 
 
920 aa  610  1e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  45.82 
 
 
971 aa  610  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  53.45 
 
 
879 aa  604  1.0000000000000001e-171  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  51.81 
 
 
686 aa  595  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 
686 aa  593  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 
686 aa  592  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 
686 aa  592  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  43.54 
 
 
947 aa  595  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  51.02 
 
 
689 aa  594  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  51.82 
 
 
692 aa  590  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 
686 aa  591  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  50 
 
 
686 aa  590  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  50 
 
 
686 aa  590  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 
686 aa  591  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 
1029 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  47.4 
 
 
888 aa  591  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3190  translation initiation factor IF-2  51.64 
 
 
938 aa  592  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  51.2 
 
 
903 aa  586  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 
688 aa  588  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  48.03 
 
 
945 aa  582  1.0000000000000001e-165  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  42.55 
 
 
860 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  42.52 
 
 
1008 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 
752 aa  585  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 
1161 aa  580  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  50.99 
 
 
822 aa  581  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 
688 aa  582  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  48.94 
 
 
986 aa  581  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  42.22 
 
 
956 aa  578  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7742  translation initiation factor IF-2  52.76 
 
 
1051 aa  575  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  49.23 
 
 
884 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  49.06 
 
 
705 aa  576  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  49.06 
 
 
705 aa  576  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 
980 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  52.44 
 
 
1079 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  48.55 
 
 
720 aa  572  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  49.57 
 
 
882 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  47.44 
 
 
984 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08040  translation initiation factor IF-2  53.1 
 
 
929 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13732  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  49.26 
 
 
892 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  48.63 
 
 
679 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  48.63 
 
 
679 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  52.26 
 
 
997 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  48.82 
 
 
896 aa  571  1e-161  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  52.07 
 
 
928 aa  569  1e-161  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  47.06 
 
 
943 aa  572  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  52.62 
 
 
1035 aa  569  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 
845 aa  571  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  50.55 
 
 
879 aa  569  1e-161  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  48.89 
 
 
883 aa  567  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3966  translation initiation factor IF-2  51.93 
 
 
998 aa  567  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.602986  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  53.17 
 
 
941 aa  567  1e-160  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12854  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 
900 aa  566  1e-160  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000971271  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  48.72 
 
 
921 aa  566  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  49.34 
 
 
984 aa  565  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  46.94 
 
 
885 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0222  translation initiation factor IF-2  48.62 
 
 
877 aa  564  1.0000000000000001e-159  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0273572  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2489  translation initiation factor IF-2  51.91 
 
 
956 aa  562  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.872607  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  49.24 
 
 
882 aa  563  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2152  translation initiation factor IF-2  48.98 
 
 
938 aa  563  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0901193  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  48.78 
 
 
943 aa  565  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  51.61 
 
 
885 aa  559  1e-158  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  49.48 
 
 
898 aa  560  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  47.11 
 
 
903 aa  560  1e-158  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  46.87 
 
 
922 aa  560  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4039  translation initiation factor IF-2  50.16 
 
 
930 aa  561  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.681084 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 
924 aa  560  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14570  translation initiation factor 2  49.14 
 
 
938 aa  559  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00182457  normal  0.54145 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2314  translation initiation factor IF-2  49.38 
 
 
930 aa  560  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596134  normal  0.0338999 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  47.52 
 
 
936 aa  558  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  47.11 
 
 
894 aa  556  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0248  translation initiation factor IF-2  45.89 
 
 
888 aa  558  1e-157  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346086  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  48.89 
 
 
1022 aa  558  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  48.03 
 
 
876 aa  557  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  47.5 
 
 
885 aa  558  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1715  translation initiation factor IF-2  49.37 
 
 
934 aa  558  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  48.76 
 
 
979 aa  555  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  48.95 
 
 
869 aa  556  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  51.92 
 
 
1079 aa  556  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3331  translation initiation factor IF-2  51.91 
 
 
992 aa  556  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  48.28 
 
 
1131 aa  556  1e-157  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0255  translation initiation factor IF-2  42.78 
 
 
979 aa  555  1e-156  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0032  translation initiation factor IF-2  48.63 
 
 
1016 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.247962 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0131  translation initiation factor IF-2  48.27 
 
 
871 aa  555  1e-156  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  47.88 
 
 
902 aa  554  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0778  translation initiation factor IF-2  47.73 
 
 
955 aa  555  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425771  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01760  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 
868 aa  554  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0171  translation initiation factor IF-2  48.1 
 
 
871 aa  552  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00654664  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0149  translation initiation factor IF-2  48.27 
 
 
854 aa  554  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00379745  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23450  translation initiation factor 2  48.82 
 
 
939 aa  554  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0250989  normal  0.0490514 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  49.48 
 
 
907 aa  553  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  49.4 
 
 
881 aa  552  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  46.91 
 
 
895 aa  554  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  48.05 
 
 
838 aa  552  1e-156  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2316  translation initiation factor IF-2  47.23 
 
 
1116 aa  553  1e-156  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>