More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0032 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0653  translation initiation factor IF-2  49.38 
 
 		 1204 aa  819    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.696738  normal  0.0609071 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  50.32 
 
 		 883 aa  640    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0255  translation initiation factor IF-2  49.24 
 
 		 979 aa  897    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  53.06 
 
 		 1029 aa  640    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  52.41 
 
 		 911 aa  684    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  55.64 
 
 		 732 aa  640    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  60.2 
 
 		 924 aa  729    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  47.59 
 
 		 945 aa  886    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0139  translation initiation factor IF-2  49.27 
 
 		 908 aa  893    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  55.97 
 
 		 739 aa  639    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0141  translation initiation factor IF-2  67.13 
 
 		 1010 aa  884    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  52.43 
 
 		 952 aa  699    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  54.42 
 
 		 947 aa  669    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  52.34 
 
 		 915 aa  694    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  45.59 
 
 		 1022 aa  693    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  51.13 
 
 		 884 aa  647    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  47.6 
 
 		 956 aa  870    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  44.44 
 
 		 907 aa  650    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0032  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 1016 aa  2048    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.247962 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  44.47 
 
 		 882 aa  639    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  63.96 
 
 		 943 aa  847    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  54.68 
 
 		 1008 aa  1030    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  52.85 
 
 		 971 aa  636    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  46.2 
 
 		 936 aa  704    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0398  translation initiation factor IF-2  42.84 
 
 		 986 aa  686    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0010836  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  54.08 
 
 		 943 aa  637    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  43.95 
 
 		 921 aa  645    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  41.93 
 
 		 991 aa  702    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1215  translation initiation factor IF-2  73.66 
 
 		 1148 aa  931    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  53.91 
 
 		 943 aa  635  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  52.83 
 
 		 992 aa  635  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  51.2 
 
 		 986 aa  630  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  50.3 
 
 		 964 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  52.11 
 
 		 876 aa  631  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  52.58 
 
 		 989 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  52.58 
 
 		 986 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  50.3 
 
 		 964 aa  631  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 		 980 aa  630  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  51.92 
 
 		 894 aa  629  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  52.69 
 
 		 975 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  52.69 
 
 		 975 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  51.05 
 
 		 892 aa  627  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  53.45 
 
 		 896 aa  626  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  54.55 
 
 		 953 aa  626  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  53.59 
 
 		 984 aa  625  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  52.53 
 
 		 975 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  52.42 
 
 		 976 aa  626  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  52.01 
 
 		 885 aa  628  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 		 985 aa  628  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  52.69 
 
 		 975 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  52.69 
 
 		 975 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  51.8 
 
 		 1079 aa  626  1e-178  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  52.92 
 
 		 968 aa  622  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  52.76 
 
 		 896 aa  624  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  53.11 
 
 		 898 aa  623  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  52.4 
 
 		 880 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  52.4 
 
 		 880 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  52.53 
 
 		 975 aa  625  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  52.4 
 
 		 880 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  52.74 
 
 		 880 aa  625  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  53.45 
 
 		 894 aa  622  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  52.53 
 
 		 975 aa  625  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  52.81 
 
 		 889 aa  623  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  52.4 
 
 		 880 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  52.39 
 
 		 943 aa  622  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  50.81 
 
 		 889 aa  620  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  52.74 
 
 		 885 aa  620  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  52.18 
 
 		 971 aa  622  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  52.34 
 
 		 972 aa  621  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  52.67 
 
 		 969 aa  622  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  54.78 
 
 		 948 aa  622  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  50.48 
 
 		 884 aa  620  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  51.66 
 
 		 902 aa  620  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  52.18 
 
 		 971 aa  622  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  52.99 
 
 		 885 aa  621  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  52.99 
 
 		 885 aa  621  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  52.04 
 
 		 971 aa  621  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  52.5 
 
 		 965 aa  622  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  52.18 
 
 		 971 aa  622  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01760  translation initiation factor IF-2  51.45 
 
 		 868 aa  619  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2134  translation initiation factor IF-2  52.91 
 
 		 978 aa  618  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149988  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  52.04 
 
 		 972 aa  619  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  52.33 
 
 		 979 aa  618  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  51.14 
 
 		 869 aa  618  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  52.24 
 
 		 984 aa  618  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  51.72 
 
 		 881 aa  618  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  52.65 
 
 		 822 aa  615  9.999999999999999e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  53.42 
 
 		 904 aa  615  9.999999999999999e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  43.69 
 
 		 922 aa  613  9.999999999999999e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  51.11 
 
 		 997 aa  615  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  52.23 
 
 		 1161 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  51.55 
 
 		 903 aa  614  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  51.38 
 
 		 692 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  51.72 
 
 		 891 aa  614  9.999999999999999e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1701  translation initiation factor IF-2  53.87 
 
 		 991 aa  613  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192656 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  52.3 
 
 		 882 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  50.94 
 
 		 897 aa  609  1e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  51.53 
 
 		 968 aa  610  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  50.66 
 
 		 854 aa  612  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  51.67 
 
 		 686 aa  612  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>