More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0139 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0139  translation initiation factor IF-2  100 
 
 
908 aa  1828    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0255  translation initiation factor IF-2  46.66 
 
 
979 aa  815    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0141  translation initiation factor IF-2  60.49 
 
 
1010 aa  814    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  49.37 
 
 
952 aa  660    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  61.61 
 
 
945 aa  820    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  47.25 
 
 
956 aa  824    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  44.19 
 
 
947 aa  647    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  49.37 
 
 
915 aa  666    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  49.61 
 
 
1022 aa  652    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 
884 aa  642    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0032  translation initiation factor IF-2  63.36 
 
 
1016 aa  817    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.247962 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  53.4 
 
 
1029 aa  647    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0653  translation initiation factor IF-2  60.36 
 
 
1204 aa  742    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.696738  normal  0.0609071 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  61.93 
 
 
943 aa  816    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  49.53 
 
 
911 aa  653    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  49.3 
 
 
936 aa  660    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  59.77 
 
 
1008 aa  915    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1215  translation initiation factor IF-2  62.92 
 
 
1148 aa  805    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16026  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0398  translation initiation factor IF-2  45.58 
 
 
986 aa  648    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0010836  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  48.36 
 
 
991 aa  662    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  51.92 
 
 
883 aa  634  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  51.21 
 
 
986 aa  630  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  51.72 
 
 
980 aa  632  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  52.08 
 
 
892 aa  631  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  51.21 
 
 
882 aa  631  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  52.5 
 
 
1079 aa  627  1e-178  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  50.52 
 
 
921 aa  627  1e-178  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  52.31 
 
 
903 aa  625  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  52.06 
 
 
971 aa  620  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  49.6 
 
 
822 aa  617  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  51.71 
 
 
985 aa  609  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 
732 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  49.67 
 
 
962 aa  608  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  51.81 
 
 
692 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  49.68 
 
 
880 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  50.41 
 
 
984 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  50.95 
 
 
907 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  52.05 
 
 
989 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  50.6 
 
 
896 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  51.36 
 
 
1079 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  47.53 
 
 
889 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  49.26 
 
 
949 aa  600  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  49.58 
 
 
997 aa  602  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  50.77 
 
 
885 aa  600  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  50.77 
 
 
894 aa  601  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  49.37 
 
 
880 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  49.37 
 
 
880 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  51.02 
 
 
885 aa  600  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01760  translation initiation factor IF-2  51.04 
 
 
868 aa  600  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  49.67 
 
 
888 aa  601  1e-170  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  50.77 
 
 
885 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  50.77 
 
 
885 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  49.37 
 
 
880 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  49.37 
 
 
880 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  50.77 
 
 
882 aa  600  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  51.71 
 
 
986 aa  597  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  51.42 
 
 
984 aa  598  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  48.59 
 
 
686 aa  598  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  51.2 
 
 
975 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  51.2 
 
 
975 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  50.68 
 
 
884 aa  598  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  51.2 
 
 
975 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  51.03 
 
 
975 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  50.51 
 
 
881 aa  597  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  51.2 
 
 
975 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  50.6 
 
 
896 aa  598  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  50.86 
 
 
971 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  51.03 
 
 
975 aa  595  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  51.29 
 
 
739 aa  595  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  51.03 
 
 
975 aa  595  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  51.03 
 
 
976 aa  594  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  50.86 
 
 
969 aa  595  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  50.86 
 
 
971 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  50.86 
 
 
971 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  50.77 
 
 
880 aa  595  1e-168  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  51.11 
 
 
965 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  50.95 
 
 
898 aa  592  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  50.86 
 
 
971 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  50.51 
 
 
968 aa  590  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  49.57 
 
 
896 aa  590  1e-167  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  50.78 
 
 
845 aa  590  1e-167  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  46.69 
 
 
875 aa  591  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  46.69 
 
 
875 aa  591  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  48.89 
 
 
992 aa  591  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  50.86 
 
 
972 aa  591  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 
894 aa  590  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  51.02 
 
 
979 aa  591  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  51.2 
 
 
869 aa  592  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 
686 aa  586  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 
686 aa  586  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  50.51 
 
 
964 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  49.49 
 
 
904 aa  587  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  50.68 
 
 
964 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  50.68 
 
 
972 aa  586  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  50.43 
 
 
891 aa  588  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  49.37 
 
 
968 aa  588  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  50.08 
 
 
673 aa  588  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  51.63 
 
 
948 aa  587  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  50.09 
 
 
895 aa  587  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  47.56 
 
 
949 aa  587  1e-166  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>