More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3422 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0141  translation initiation factor IF-2  63.4 
 
 		 1010 aa  870    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  46.42 
 
 		 1029 aa  652    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  44.1 
 
 		 883 aa  644    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  62.79 
 
 		 945 aa  853    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0255  translation initiation factor IF-2  48.36 
 
 		 979 aa  857    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  47.16 
 
 		 943 aa  857    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  47.02 
 
 		 971 aa  670    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  51.4 
 
 		 986 aa  644    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  59.05 
 
 		 924 aa  731    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  46.28 
 
 		 949 aa  636    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  48.18 
 
 		 947 aa  665    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  44.55 
 
 		 1022 aa  676    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  51.29 
 
 		 884 aa  644    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  50.46 
 
 		 907 aa  642    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  52.65 
 
 		 936 aa  709    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  47.56 
 
 		 985 aa  665    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0032  translation initiation factor IF-2  67.6 
 
 		 1016 aa  882    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.247962 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 1008 aa  2031    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  45.35 
 
 		 952 aa  692    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  48.73 
 
 		 980 aa  642    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  50.95 
 
 		 911 aa  696    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  53.9 
 
 		 898 aa  639    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  46.58 
 
 		 956 aa  867    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  45.86 
 
 		 882 aa  642    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0139  translation initiation factor IF-2  57.85 
 
 		 908 aa  914    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  44.49 
 
 		 921 aa  647    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  53.74 
 
 		 991 aa  707    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  53.27 
 
 		 984 aa  632  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  52.63 
 
 		 732 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  54.17 
 
 		 968 aa  633  1e-180  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  53.02 
 
 		 894 aa  634  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  48.45 
 
 		 943 aa  633  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  53.12 
 
 		 975 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  53.12 
 
 		 975 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  46.17 
 
 		 888 aa  631  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  52.32 
 
 		 885 aa  631  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  53.12 
 
 		 975 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  48.31 
 
 		 943 aa  631  1e-179  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  53.12 
 
 		 975 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  51.64 
 
 		 896 aa  630  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  51.88 
 
 		 880 aa  632  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  52.09 
 
 		 979 aa  631  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  52.15 
 
 		 896 aa  631  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  51.45 
 
 		 885 aa  628  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  52.46 
 
 		 739 aa  626  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  52.78 
 
 		 904 aa  627  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  52.87 
 
 		 975 aa  628  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  47.45 
 
 		 984 aa  626  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  51.88 
 
 		 884 aa  628  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  52.87 
 
 		 975 aa  628  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  51.45 
 
 		 885 aa  628  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  51.45 
 
 		 885 aa  628  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  52.8 
 
 		 969 aa  626  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  52.87 
 
 		 975 aa  628  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  51.28 
 
 		 889 aa  626  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  52.48 
 
 		 882 aa  628  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  53.42 
 
 		 896 aa  623  1e-177  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  52.06 
 
 		 986 aa  622  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  51.19 
 
 		 880 aa  625  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  52.33 
 
 		 891 aa  623  1e-177  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  51.19 
 
 		 880 aa  625  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  52.12 
 
 		 822 aa  624  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  51.19 
 
 		 880 aa  625  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  50.31 
 
 		 992 aa  623  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  51.46 
 
 		 892 aa  625  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  51.9 
 
 		 989 aa  623  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  51.19 
 
 		 880 aa  625  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 		 881 aa  625  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  51.77 
 
 		 943 aa  625  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  51.68 
 
 		 972 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  52.68 
 
 		 902 aa  619  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  52.32 
 
 		 971 aa  622  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  52.93 
 
 		 686 aa  620  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  54.1 
 
 		 948 aa  620  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  52.32 
 
 		 971 aa  621  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  53.74 
 
 		 964 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  51.68 
 
 		 971 aa  621  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  51.46 
 
 		 894 aa  622  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  52.32 
 
 		 971 aa  621  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  51.2 
 
 		 997 aa  619  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  50.77 
 
 		 889 aa  618  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  52.77 
 
 		 692 aa  618  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  54.08 
 
 		 966 aa  616  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  50.8 
 
 		 922 aa  617  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  52.48 
 
 		 972 aa  617  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  51.64 
 
 		 895 aa  619  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  53.57 
 
 		 964 aa  619  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  46.96 
 
 		 835 aa  615  1e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  52.33 
 
 		 831 aa  618  1e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1701  translation initiation factor IF-2  53.15 
 
 		 991 aa  617  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192656 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  51.46 
 
 		 880 aa  619  1e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  53.2 
 
 		 890 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  53 
 
 		 953 aa  615  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3476  translation initiation factor IF-2  53.37 
 
 		 892 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  53.25 
 
 		 1079 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  52.33 
 
 		 968 aa  614  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3464  translation initiation factor IF-2  53.2 
 
 		 890 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345648 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  51.51 
 
 		 965 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02986  hypothetical protein  53.2 
 
 		 890 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.201323  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  53.2 
 
 		 890 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>