More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0495 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  55.18 
 
 		 890 aa  655    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  55.18 
 
 		 890 aa  655    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  49.72 
 
 		 883 aa  780    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3603  translation initiation factor IF-2  55.18 
 
 		 890 aa  655    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3581  translation initiation factor IF-2  55.52 
 
 		 892 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.544549  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  54.15 
 
 		 896 aa  657    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  55.21 
 
 		 720 aa  639    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  60.1 
 
 		 949 aa  706    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  55.16 
 
 		 964 aa  649    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  55.84 
 
 		 686 aa  642    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  51.13 
 
 		 889 aa  662    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  55.18 
 
 		 890 aa  655    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  52.7 
 
 		 885 aa  679    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  54.2 
 
 		 895 aa  670    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  55.5 
 
 		 686 aa  639    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  55.67 
 
 		 686 aa  641    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  55.67 
 
 		 686 aa  641    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  54.09 
 
 		 975 aa  666    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  56.44 
 
 		 868 aa  659    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  56.61 
 
 		 868 aa  661    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  40.81 
 
 		 885 aa  638    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  61.88 
 
 		 882 aa  747    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  53.4 
 
 		 904 aa  642    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  53.3 
 
 		 972 aa  653    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  54.82 
 
 		 966 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  46.3 
 
 		 922 aa  639    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  53.62 
 
 		 880 aa  670    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  55.4 
 
 		 948 aa  640    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  53.93 
 
 		 975 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3730  translation initiation factor IF-2  47.61 
 
 		 892 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187768  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  52.39 
 
 		 894 aa  674    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  48.29 
 
 		 947 aa  772    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  52.73 
 
 		 972 aa  654    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  56.19 
 
 		 689 aa  644    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  52.73 
 
 		 971 aa  659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  49.4 
 
 		 884 aa  805    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  68.51 
 
 		 984 aa  928    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  55.08 
 
 		 896 aa  670    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  55.5 
 
 		 686 aa  639    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3596  translation initiation factor IF-2  47.61 
 
 		 892 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000160504  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  54.09 
 
 		 975 aa  666    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  53.93 
 
 		 975 aa  664    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  52.39 
 
 		 876 aa  636    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  54.1 
 
 		 965 aa  662    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  45.24 
 
 		 903 aa  713    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  53.46 
 
 		 976 aa  660    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  52.87 
 
 		 964 aa  652    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  53.95 
 
 		 880 aa  676    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  55.18 
 
 		 890 aa  655    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  54.12 
 
 		 705 aa  636    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  55.15 
 
 		 953 aa  637    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  54.12 
 
 		 705 aa  636    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  53.62 
 
 		 880 aa  670    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  44.19 
 
 		 907 aa  683    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3544  translation initiation factor IF-2  55.52 
 
 		 892 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  54.86 
 
 		 989 aa  668    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  53.54 
 
 		 884 aa  667    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  53.62 
 
 		 880 aa  670    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  54.65 
 
 		 843 aa  655    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  53.93 
 
 		 975 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3608  translation initiation factor IF-2  54.02 
 
 		 828 aa  636    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  53.93 
 
 		 979 aa  662    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  53.61 
 
 		 969 aa  659    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4217  translation initiation factor 2  51.52 
 
 		 1011 aa  644    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726068  normal  0.0540264 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  54.84 
 
 		 688 aa  640    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  52.73 
 
 		 971 aa  658    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  54.28 
 
 		 970 aa  659    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  53.9 
 
 		 869 aa  656    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  48 
 
 		 854 aa  639    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  56.03 
 
 		 679 aa  640    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  56.03 
 
 		 679 aa  640    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  57.97 
 
 		 692 aa  686    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0530  translation initiation factor IF-2  55.18 
 
 		 890 aa  655    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  decreased coverage  0.0000498988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  53.01 
 
 		 885 aa  681    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  53.01 
 
 		 885 aa  681    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  52.3 
 
 		 883 aa  643    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  52.62 
 
 		 881 aa  672    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  43.27 
 
 		 882 aa  690    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  53.65 
 
 		 971 aa  657    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3993  translation initiation factor IF-2  45.04 
 
 		 884 aa  640    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  53.85 
 
 		 894 aa  675    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  54.09 
 
 		 975 aa  666    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3035  translation initiation factor IF-2  54.08 
 
 		 884 aa  687    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.19789  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  54.66 
 
 		 898 aa  652    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  54.09 
 
 		 975 aa  666    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  53.95 
 
 		 885 aa  683    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  52.73 
 
 		 971 aa  658    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  53.61 
 
 		 949 aa  647    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  52.86 
 
 		 889 aa  679    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  55.52 
 
 		 985 aa  673    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  53.39 
 
 		 896 aa  676    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  62.11 
 
 		 921 aa  736    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3605  translation initiation factor IF-2  55.48 
 
 		 898 aa  647    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600034  normal  0.0461803 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3464  translation initiation factor IF-2  55.18 
 
 		 890 aa  655    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  54.49 
 
 		 986 aa  669    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 880 aa  660    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  53.38 
 
 		 848 aa  644    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  73.66 
 
 		 1079 aa  925    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  52.6 
 
 		 943 aa  639    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  53.8 
 
 		 992 aa  648    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>