More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0697 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  50 
 
 
890 aa  796    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  50 
 
 
890 aa  796    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  74.69 
 
 
975 aa  968    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  56.75 
 
 
883 aa  681    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4712  translation initiation factor IF-2  61.93 
 
 
846 aa  758    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333126  normal  0.0123461 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5462  translation initiation factor IF-2  64.7 
 
 
837 aa  756    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  57.12 
 
 
854 aa  771    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  53.73 
 
 
720 aa  640    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1315  translation initiation factor IF-2  63.05 
 
 
868 aa  746    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  72.84 
 
 
964 aa  935    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  55.65 
 
 
686 aa  639    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1749  translation initiation factor IF-2  61.14 
 
 
890 aa  734    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0133551  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  53.87 
 
 
959 aa  676    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  61.48 
 
 
885 aa  787    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4490  translation initiation factor IF-2  63.34 
 
 
841 aa  751    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0593821  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  55.48 
 
 
686 aa  636    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  55.65 
 
 
686 aa  637    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  55.65 
 
 
686 aa  637    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  74.69 
 
 
975 aa  968    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  62.68 
 
 
868 aa  795    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4180  translation initiation factor IF-2  63.51 
 
 
841 aa  753    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  46.85 
 
 
908 aa  756    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  66.89 
 
 
904 aa  957    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2749  translation initiation factor IF-2  63.76 
 
 
990 aa  834    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.867679  normal  0.130193 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  64.19 
 
 
948 aa  889    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  70.12 
 
 
966 aa  942    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  100 
 
 
922 aa  1834    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  51.87 
 
 
885 aa  658    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  58.25 
 
 
848 aa  725    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  74.84 
 
 
975 aa  969    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  62.12 
 
 
845 aa  754    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0779  translation initiation factor IF-2  62.75 
 
 
837 aa  753    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679376  normal  0.0113763 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  51.63 
 
 
836 aa  648    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  56.7 
 
 
947 aa  685    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  71.11 
 
 
972 aa  964    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  52.82 
 
 
985 aa  665    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  74.84 
 
 
975 aa  969    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  66.93 
 
 
943 aa  863    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  47.47 
 
 
884 aa  690    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  54.68 
 
 
984 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1123  translation initiation factor IF-2  60.56 
 
 
818 aa  722    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  55.48 
 
 
686 aa  636    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  61.07 
 
 
880 aa  783    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  55.08 
 
 
1079 aa  655    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  65.7 
 
 
876 aa  959    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  52.33 
 
 
873 aa  688    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  53.09 
 
 
903 aa  685    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  74.11 
 
 
976 aa  963    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  62.85 
 
 
943 aa  874    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  56.58 
 
 
882 aa  681    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  56.6 
 
 
689 aa  654    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2134  translation initiation factor IF-2  68.16 
 
 
978 aa  861    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149988  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2708  translation initiation factor IF-2  59.56 
 
 
908 aa  694    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.334172  normal  0.377403 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  53.82 
 
 
880 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  65.6 
 
 
907 aa  1121    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  68.91 
 
 
968 aa  884    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  74.92 
 
 
989 aa  972    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  61.1 
 
 
884 aa  781    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4577  translation initiation factor IF-2  61.93 
 
 
846 aa  758    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126639  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  64.02 
 
 
843 aa  780    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  61.07 
 
 
880 aa  783    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  47.17 
 
 
908 aa  760    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  70.22 
 
 
979 aa  967    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0631  translation initiation factor IF2-2  45.25 
 
 
880 aa  735    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  52.74 
 
 
990 aa  671    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  52.66 
 
 
835 aa  652    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  74.69 
 
 
975 aa  968    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  71.16 
 
 
971 aa  971    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3608  translation initiation factor IF-2  63.07 
 
 
828 aa  760    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  60.49 
 
 
869 aa  739    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  55.52 
 
 
856 aa  662    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  45.93 
 
 
905 aa  732    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  53.89 
 
 
921 aa  636    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  58.1 
 
 
887 aa  666    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  63.24 
 
 
831 aa  746    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  74.69 
 
 
975 aa  968    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  61.48 
 
 
885 aa  787    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  61.48 
 
 
885 aa  787    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  61.22 
 
 
883 aa  763    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  49.79 
 
 
881 aa  838    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  51.13 
 
 
882 aa  637    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  51.47 
 
 
964 aa  675    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  71.51 
 
 
971 aa  970    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62760  translation initiation factor IF-2  64.7 
 
 
840 aa  755    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0503522  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  58.91 
 
 
885 aa  806    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  67.76 
 
 
920 aa  903    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  51.78 
 
 
836 aa  649    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  74.84 
 
 
975 aa  969    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  71.16 
 
 
971 aa  971    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  50.66 
 
 
962 aa  640    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  56.49 
 
 
949 aa  696    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  61.64 
 
 
889 aa  790    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2757  translation initiation factor IF-2  51.48 
 
 
838 aa  645    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141804  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  45.26 
 
 
848 aa  648    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  55.79 
 
 
921 aa  685    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3605  translation initiation factor IF-2  49.79 
 
 
898 aa  795    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600034  normal  0.0461803 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  51.52 
 
 
848 aa  641    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  61.38 
 
 
880 aa  785    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  61.35 
 
 
882 aa  793    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  50.22 
 
 
880 aa  822    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>