More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1435 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  56.58 
 
 		 986 aa  647    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  57.33 
 
 		 738 aa  656    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  56.41 
 
 		 975 aa  646    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  61.61 
 
 		 883 aa  716    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  61.55 
 
 		 692 aa  741    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  52.12 
 
 		 896 aa  668    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  63.33 
 
 		 720 aa  779    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  57.98 
 
 		 949 aa  691    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  54.73 
 
 		 895 aa  636    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  64.62 
 
 		 686 aa  796    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  50.7 
 
 		 889 aa  637    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3751  translation initiation factor IF-2  56.62 
 
 		 729 aa  654    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00372327  unclonable  0.0000243777 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  60.03 
 
 		 927 aa  707    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  46.29 
 
 		 959 aa  638    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  68.54 
 
 		 732 aa  842    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  63.79 
 
 		 686 aa  791    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  64.12 
 
 		 686 aa  792    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  63.97 
 
 		 688 aa  785    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  64.12 
 
 		 686 aa  792    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  56.41 
 
 		 975 aa  646    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  64.27 
 
 		 1035 aa  729    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  56.24 
 
 		 975 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  64.65 
 
 		 686 aa  792    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  55.16 
 
 		 969 aa  646    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  61.13 
 
 		 822 aa  755    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  53.96 
 
 		 922 aa  657    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  48.18 
 
 		 985 aa  825    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  56.24 
 
 		 975 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  61.37 
 
 		 752 aa  739    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  45.93 
 
 		 964 aa  643    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  56.07 
 
 		 971 aa  643    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  58.33 
 
 		 947 aa  692    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  56.07 
 
 		 972 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  55.92 
 
 		 898 aa  639    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  56.24 
 
 		 975 aa  644    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  56.06 
 
 		 854 aa  649    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  65.88 
 
 		 689 aa  803    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  57.46 
 
 		 884 aa  719    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  51.18 
 
 		 984 aa  653    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  63.79 
 
 		 686 aa  791    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  64.62 
 
 		 686 aa  797    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1034  translation initiation factor IF-2  53.36 
 
 		 774 aa  655    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  53.25 
 
 		 888 aa  725    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  52.36 
 
 		 873 aa  646    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  48.74 
 
 		 903 aa  784    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  56.24 
 
 		 976 aa  645    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 860 aa  1728    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  54.73 
 
 		 894 aa  639    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  63.88 
 
 		 705 aa  765    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  54.7 
 
 		 907 aa  653    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  56.41 
 
 		 989 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  49.38 
 
 		 845 aa  781    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  57.28 
 
 		 971 aa  787    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  55.73 
 
 		 972 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  46.29 
 
 		 990 aa  637    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  55.37 
 
 		 979 aa  641    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  63.88 
 
 		 705 aa  765    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  69.45 
 
 		 739 aa  852    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0831  translation initiation factor IF-2  44.76 
 
 		 882 aa  664    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.857351  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  58.6 
 
 		 924 aa  655    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  56.07 
 
 		 971 aa  643    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  54.69 
 
 		 673 aa  664    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  51.96 
 
 		 940 aa  635    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  55.69 
 
 		 856 aa  651    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  61.43 
 
 		 679 aa  723    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  61.43 
 
 		 679 aa  723    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  60.28 
 
 		 986 aa  726    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  64.31 
 
 		 688 aa  790    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  50.06 
 
 		 1161 aa  754    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  59.11 
 
 		 686 aa  699    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  60.56 
 
 		 941 aa  660    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  46.56 
 
 		 882 aa  749    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  55.73 
 
 		 971 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  56.41 
 
 		 975 aa  646    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0817  translation initiation factor IF-2  58.67 
 
 		 950 aa  682    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0433  translation initiation factor IF-2  57.62 
 
 		 829 aa  675    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  44.51 
 
 		 882 aa  729    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  54.04 
 
 		 834 aa  695    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  59.73 
 
 		 943 aa  719    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  55.81 
 
 		 965 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  56.07 
 
 		 971 aa  643    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  52.21 
 
 		 962 aa  644    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  53.61 
 
 		 949 aa  659    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  54.61 
 
 		 879 aa  645    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  44.08 
 
 		 879 aa  640    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  47.69 
 
 		 1131 aa  683    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  52.81 
 
 		 921 aa  706    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  60.45 
 
 		 980 aa  724    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  56.41 
 
 		 975 aa  646    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  56.61 
 
 		 945 aa  659    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  50.12 
 
 		 1029 aa  777    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  55.56 
 
 		 943 aa  638    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  58.15 
 
 		 887 aa  644    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  48.49 
 
 		 1079 aa  654    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  51.57 
 
 		 892 aa  657    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  55.08 
 
 		 943 aa  632  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1867  translation initiation factor IF-2  52.71 
 
 		 1038 aa  634  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2295  translation initiation factor IF-2  54.86 
 
 		 886 aa  634  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0792369 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  55.03 
 
 		 853 aa  632  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  54.83 
 
 		 992 aa  632  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>