More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0991 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  60.93 
 
 		 688 aa  713    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  53.91 
 
 		 892 aa  670    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  58.7 
 
 		 883 aa  716    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  54.28 
 
 		 656 aa  640    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  53.83 
 
 		 896 aa  639    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  62.48 
 
 		 720 aa  747    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  55.29 
 
 		 887 aa  648    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  54.35 
 
 		 964 aa  640    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  61.54 
 
 		 686 aa  724    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  58.77 
 
 		 752 aa  724    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  61.29 
 
 		 705 aa  722    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  55.61 
 
 		 927 aa  653    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  59.5 
 
 		 822 aa  742    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  58.92 
 
 		 673 aa  694    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  61.03 
 
 		 686 aa  719    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  61.2 
 
 		 686 aa  721    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  61.2 
 
 		 686 aa  721    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  52.07 
 
 		 975 aa  649    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  52.22 
 
 		 975 aa  651    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  100 
 
 		 1035 aa  2077    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  54.04 
 
 		 904 aa  639    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0993  translation initiation factor IF-2  54.12 
 
 		 668 aa  642    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000676499  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  52.07 
 
 		 975 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  56.39 
 
 		 966 aa  648    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  55.63 
 
 		 922 aa  673    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  56.73 
 
 		 928 aa  653    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  53.19 
 
 		 964 aa  649    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  52.22 
 
 		 975 aa  651    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  58.02 
 
 		 686 aa  680    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  55.74 
 
 		 711 aa  663    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  58.83 
 
 		 947 aa  714    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  52.63 
 
 		 972 aa  638    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  61.1 
 
 		 686 aa  720    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  68.28 
 
 		 845 aa  812    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  52.07 
 
 		 975 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  59.04 
 
 		 884 aa  723    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  54.24 
 
 		 984 aa  650    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  61.03 
 
 		 686 aa  719    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  58.22 
 
 		 882 aa  712    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  56.99 
 
 		 1079 aa  659    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2316  translation initiation factor IF-2  52.97 
 
 		 1116 aa  644    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100815  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  51.88 
 
 		 873 aa  640    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  62.69 
 
 		 903 aa  779    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  52.22 
 
 		 976 aa  649    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  53.27 
 
 		 969 aa  647    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  63.21 
 
 		 860 aa  776    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  53.19 
 
 		 964 aa  649    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  62.16 
 
 		 689 aa  730    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  56 
 
 		 997 aa  679    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  55.1 
 
 		 907 aa  670    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  61.54 
 
 		 686 aa  724    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3751  translation initiation factor IF-2  56.32 
 
 		 729 aa  666    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00372327  unclonable  0.0000243777 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  61.29 
 
 		 705 aa  722    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  52.22 
 
 		 975 aa  651    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  55.18 
 
 		 984 aa  640    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  56.39 
 
 		 979 aa  664    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  65.28 
 
 		 1161 aa  992    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  55.08 
 
 		 968 aa  645    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  57.63 
 
 		 949 aa  698    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  51.85 
 
 		 971 aa  644    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  57.49 
 
 		 854 aa  667    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  61.32 
 
 		 985 aa  791    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  58.01 
 
 		 945 aa  679    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  59.97 
 
 		 888 aa  746    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  62.71 
 
 		 679 aa  742    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  62.71 
 
 		 679 aa  742    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  50.8 
 
 		 940 aa  643    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  55.3 
 
 		 924 aa  645    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  66.61 
 
 		 692 aa  789    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  60.61 
 
 		 688 aa  713    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  64.77 
 
 		 739 aa  779    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  57.14 
 
 		 920 aa  667    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  47.96 
 
 		 882 aa  718    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  52.95 
 
 		 971 aa  646    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  56.48 
 
 		 879 aa  657    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0433  translation initiation factor IF-2  53 
 
 		 829 aa  643    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  55.74 
 
 		 882 aa  693    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  56.17 
 
 		 834 aa  686    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  57.34 
 
 		 943 aa  657    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  66.21 
 
 		 971 aa  792    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  51.85 
 
 		 971 aa  644    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  54.63 
 
 		 962 aa  664    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  53.02 
 
 		 949 aa  659    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  51.85 
 
 		 971 aa  644    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07010  translation initiation factor 2  54.42 
 
 		 930 aa  639    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  56.32 
 
 		 738 aa  665    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  56.43 
 
 		 921 aa  717    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  55.57 
 
 		 980 aa  728    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  52.95 
 
 		 972 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  65.26 
 
 		 732 aa  786    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  53.75 
 
 		 965 aa  651    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  54.73 
 
 		 894 aa  639    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  61.92 
 
 		 1131 aa  718    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  55.54 
 
 		 1079 aa  666    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  54.18 
 
 		 943 aa  635    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1034  translation initiation factor IF-2  54.01 
 
 		 774 aa  655    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  53.07 
 
 		 936 aa  643    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  65.47 
 
 		 1029 aa  780    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  52.07 
 
 		 975 aa  649    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  58.4 
 
 		 986 aa  729    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>