More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0778 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1715  translation initiation factor IF-2  68.95 
 
 		 934 aa  874    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1370  translation initiation factor IF-2  66.4 
 
 		 999 aa  819    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.515442  normal  0.133918 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0285  translation initiation factor IF-2  62.09 
 
 		 954 aa  789    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3331  translation initiation factor IF-2  77.57 
 
 		 992 aa  967    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1510  translation initiation factor IF-2  66.2 
 
 		 957 aa  851    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1426  translation initiation factor IF-2  65.12 
 
 		 954 aa  850    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000203462 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2489  translation initiation factor IF-2  64.96 
 
 		 956 aa  825    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.872607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5834  translation initiation factor IF-2  69.07 
 
 		 1034 aa  854    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0778  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 955 aa  1878    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425771  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1211  translation initiation factor IF-2  67.91 
 
 		 951 aa  861    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186812  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1421  translation initiation factor IF-2  66.51 
 
 		 980 aa  814    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14570  translation initiation factor 2  69.75 
 
 		 938 aa  886    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00182457  normal  0.54145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7742  translation initiation factor IF-2  72.52 
 
 		 1051 aa  911    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1182  translation initiation factor IF-2  70.38 
 
 		 1046 aa  882    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2152  translation initiation factor IF-2  70.68 
 
 		 938 aa  884    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0901193  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2065  translation initiation factor IF-2  68.75 
 
 		 920 aa  868    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.636635  normal  0.928572 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1327  translation initiation factor IF-2  66.72 
 
 		 995 aa  822    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4039  translation initiation factor IF-2  68.44 
 
 		 930 aa  887    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.681084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12854  translation initiation factor IF-2  67.97 
 
 		 900 aa  876    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000971271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10320  translation initiation factor 2  56.98 
 
 		 957 aa  947    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0686977  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3592  translation initiation factor IF-2  85.04 
 
 		 1012 aa  1103    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3966  translation initiation factor IF-2  69.03 
 
 		 998 aa  883    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.602986  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2082  translation initiation factor IF-2  68.75 
 
 		 920 aa  868    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2207  translation initiation factor IF-2  70.52 
 
 		 612 aa  851    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537417  decreased coverage  0.000616715 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07010  translation initiation factor 2  66.4 
 
 		 930 aa  839    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  41.64 
 
 		 882 aa  648    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1416  translation initiation factor IF-2  66.05 
 
 		 968 aa  858    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.919668  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11480  translation initiation factor 2  65.48 
 
 		 969 aa  847    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21089  normal  0.867698 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  60.04 
 
 		 879 aa  974    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3190  translation initiation factor IF-2  69.94 
 
 		 938 aa  877    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2128  translation initiation factor IF-2  68.75 
 
 		 920 aa  868    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524074  normal  0.0207369 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2314  translation initiation factor IF-2  69.06 
 
 		 930 aa  873    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596134  normal  0.0338999 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  42.39 
 
 		 903 aa  618  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  40.17 
 
 		 1029 aa  616  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  53 
 
 		 920 aa  610  1e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  43.03 
 
 		 971 aa  611  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  53.48 
 
 		 692 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  40.35 
 
 		 985 aa  599  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  50.72 
 
 		 884 aa  599  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  51.69 
 
 		 921 aa  601  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  51.58 
 
 		 883 aa  595  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  46.51 
 
 		 888 aa  592  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  54.36 
 
 		 879 aa  590  1e-167  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  54.44 
 
 		 924 aa  589  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  48.81 
 
 		 907 aa  589  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  52.87 
 
 		 686 aa  582  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  45.99 
 
 		 956 aa  581  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  45.1 
 
 		 882 aa  580  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08040  translation initiation factor IF-2  54.67 
 
 		 929 aa  580  1e-164  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13732  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  53.48 
 
 		 860 aa  582  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  48.89 
 
 		 986 aa  579  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 922 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  51.34 
 
 		 739 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  50.83 
 
 		 1161 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  52.38 
 
 		 898 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 		 885 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  48.25 
 
 		 896 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  49.5 
 
 		 896 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  45.75 
 
 		 873 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  49.75 
 
 		 936 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  51.78 
 
 		 895 aa  574  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  46.69 
 
 		 881 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  49.42 
 
 		 980 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  48.23 
 
 		 882 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  50.42 
 
 		 885 aa  571  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  44.03 
 
 		 947 aa  570  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  47.26 
 
 		 884 aa  570  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  51.27 
 
 		 732 aa  572  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  55.09 
 
 		 689 aa  570  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  49.67 
 
 		 885 aa  569  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  49.67 
 
 		 885 aa  569  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 		 889 aa  572  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  47.94 
 
 		 904 aa  566  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  51.36 
 
 		 894 aa  566  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  52.28 
 
 		 822 aa  567  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  48.02 
 
 		 979 aa  566  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 		 880 aa  567  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 911 aa  568  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  48.37 
 
 		 971 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  50.42 
 
 		 896 aa  563  1.0000000000000001e-159  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  51.78 
 
 		 975 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 		 880 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  47.94 
 
 		 889 aa  564  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3993  translation initiation factor IF-2  47.51 
 
 		 884 aa  565  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116527  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  51.78 
 
 		 975 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  47.18 
 
 		 894 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  51.78 
 
 		 948 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  52.03 
 
 		 984 aa  563  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3596  translation initiation factor IF-2  47.51 
 
 		 892 aa  565  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000160504  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  51.78 
 
 		 975 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  51.78 
 
 		 975 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  50.92 
 
 		 752 aa  562  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  53.5 
 
 		 941 aa  564  1.0000000000000001e-159  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  51.78 
 
 		 971 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 		 880 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 882 aa  562  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3730  translation initiation factor IF-2  47.51 
 
 		 892 aa  565  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187768  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  48.37 
 
 		 971 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  47.52 
 
 		 991 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  51.94 
 
 		 845 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>