More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11480 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2065  translation initiation factor IF-2  68.02 
 
 		 920 aa  836    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.636635  normal  0.928572 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1327  translation initiation factor IF-2  67.93 
 
 		 995 aa  831    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335521 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1443  translation initiation factor IF-2  75.12 
 
 		 1044 aa  978    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3592  translation initiation factor IF-2  65.78 
 
 		 1012 aa  844    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3966  translation initiation factor IF-2  66.3 
 
 		 998 aa  851    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.602986  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1019  translation initiation factor IF-2  76.05 
 
 		 1004 aa  959    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0778  translation initiation factor IF-2  65.58 
 
 		 955 aa  845    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425771  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07010  translation initiation factor 2  72.74 
 
 		 930 aa  913    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3331  translation initiation factor IF-2  66.3 
 
 		 992 aa  837    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12854  translation initiation factor IF-2  66.3 
 
 		 900 aa  843    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000971271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5834  translation initiation factor IF-2  67.45 
 
 		 1034 aa  843    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3562  translation initiation factor IF-2  66.35 
 
 		 1062 aa  795    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1510  translation initiation factor IF-2  76.36 
 
 		 957 aa  971    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1421  translation initiation factor IF-2  67.03 
 
 		 980 aa  816    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1426  translation initiation factor IF-2  74.34 
 
 		 954 aa  968    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000203462 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2207  translation initiation factor IF-2  68.62 
 
 		 612 aa  836    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537417  decreased coverage  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2152  translation initiation factor IF-2  67.25 
 
 		 938 aa  843    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0901193  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2082  translation initiation factor IF-2  68.02 
 
 		 920 aa  836    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7742  translation initiation factor IF-2  69.38 
 
 		 1051 aa  883    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1743  translation initiation factor IF-2  66.67 
 
 		 975 aa  851    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.695409  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23450  translation initiation factor 2  75.58 
 
 		 939 aa  969    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0250989  normal  0.0490514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1182  translation initiation factor IF-2  65.71 
 
 		 1046 aa  814    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2116  translation initiation factor IF-2  67.61 
 
 		 1051 aa  851    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0285  translation initiation factor IF-2  65.71 
 
 		 954 aa  845    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1416  translation initiation factor IF-2  74.65 
 
 		 968 aa  971    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.919668  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11480  translation initiation factor 2  100 
 
 		 969 aa  1910    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21089  normal  0.867698 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  58.83 
 
 		 879 aa  977    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1370  translation initiation factor IF-2  67.77 
 
 		 999 aa  828    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.515442  normal  0.133918 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3190  translation initiation factor IF-2  65.63 
 
 		 938 aa  828    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2128  translation initiation factor IF-2  68.02 
 
 		 920 aa  836    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524074  normal  0.0207369 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2314  translation initiation factor IF-2  67.71 
 
 		 930 aa  855    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596134  normal  0.0338999 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10320  translation initiation factor 2  62.73 
 
 		 957 aa  1098    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0686977  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1061  translation initiation factor IF-2  68.78 
 
 		 961 aa  851    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271136  normal  0.0744531 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  40.19 
 
 		 1029 aa  629  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  40.88 
 
 		 882 aa  627  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  41.14 
 
 		 985 aa  624  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  41.65 
 
 		 903 aa  608  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  41.15 
 
 		 971 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  52.84 
 
 		 920 aa  602  1.0000000000000001e-171  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  52.84 
 
 		 739 aa  602  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  46.01 
 
 		 980 aa  598  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  49.25 
 
 		 986 aa  597  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  52.54 
 
 		 732 aa  595  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  45.66 
 
 		 860 aa  593  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  51.86 
 
 		 883 aa  590  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  45.36 
 
 		 882 aa  592  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  47.37 
 
 		 907 aa  586  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  50.93 
 
 		 692 aa  586  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 884 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  52.8 
 
 		 984 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  52.24 
 
 		 949 aa  581  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  51.69 
 
 		 921 aa  579  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 1161 aa  579  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  53.27 
 
 		 924 aa  579  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  52.42 
 
 		 689 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  45.68 
 
 		 956 aa  579  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  45.76 
 
 		 888 aa  578  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  51.67 
 
 		 822 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  40.16 
 
 		 1079 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  51.41 
 
 		 720 aa  573  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  52.09 
 
 		 686 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08040  translation initiation factor IF-2  54.68 
 
 		 929 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13732  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  52.09 
 
 		 686 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  52.09 
 
 		 686 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  49.03 
 
 		 979 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  52.52 
 
 		 885 aa  575  1.0000000000000001e-162  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  52.09 
 
 		 686 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  51.92 
 
 		 686 aa  572  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  51.92 
 
 		 686 aa  572  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  51.92 
 
 		 686 aa  572  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  49.5 
 
 		 752 aa  570  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  48.43 
 
 		 975 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  47.75 
 
 		 971 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  47.42 
 
 		 1058 aa  567  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  47.2 
 
 		 922 aa  568  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  48.43 
 
 		 975 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  51.17 
 
 		 1131 aa  567  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  49.61 
 
 		 876 aa  567  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 		 945 aa  568  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  51.44 
 
 		 686 aa  567  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  48.43 
 
 		 975 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  47.75 
 
 		 971 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  42.71 
 
 		 1008 aa  567  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  47.75 
 
 		 971 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  48.43 
 
 		 975 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  51.77 
 
 		 1035 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  47.56 
 
 		 964 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  53.68 
 
 		 941 aa  563  1.0000000000000001e-159  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  48.28 
 
 		 975 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  48.93 
 
 		 972 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  48.28 
 
 		 975 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  48.28 
 
 		 975 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  47.08 
 
 		 984 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  49.32 
 
 		 873 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  48.13 
 
 		 976 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  51.68 
 
 		 879 aa  563  1.0000000000000001e-159  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  51.43 
 
 		 845 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  50.92 
 
 		 688 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  46.03 
 
 		 897 aa  565  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  48.62 
 
 		 971 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>