More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2128 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0285  translation initiation factor IF-2  62.58 
 
 		 954 aa  795    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1421  translation initiation factor IF-2  66.51 
 
 		 980 aa  825    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2207  translation initiation factor IF-2  72.27 
 
 		 612 aa  872    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537417  decreased coverage  0.000616715 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2128  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 920 aa  1804    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524074  normal  0.0207369 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1019  translation initiation factor IF-2  66.98 
 
 		 1004 aa  847    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1510  translation initiation factor IF-2  66.82 
 
 		 957 aa  841    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23450  translation initiation factor 2  68.07 
 
 		 939 aa  855    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0250989  normal  0.0490514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3331  translation initiation factor IF-2  70.59 
 
 		 992 aa  895    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1370  translation initiation factor IF-2  67.41 
 
 		 999 aa  830    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.515442  normal  0.133918 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10320  translation initiation factor 2  57.16 
 
 		 957 aa  943    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0686977  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0778  translation initiation factor IF-2  68.6 
 
 		 955 aa  884    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425771  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11480  translation initiation factor 2  56.7 
 
 		 969 aa  940    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21089  normal  0.867698 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2065  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 920 aa  1804    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.636635  normal  0.928572 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1426  translation initiation factor IF-2  65.11 
 
 		 954 aa  835    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000203462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3562  translation initiation factor IF-2  71.77 
 
 		 1062 aa  858    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14570  translation initiation factor 2  79.3 
 
 		 938 aa  1011    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00182457  normal  0.54145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3966  translation initiation factor IF-2  72.2 
 
 		 998 aa  925    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.602986  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07010  translation initiation factor 2  67.83 
 
 		 930 aa  833    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3592  translation initiation factor IF-2  68.4 
 
 		 1012 aa  892    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2082  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 920 aa  1804    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1327  translation initiation factor IF-2  67.04 
 
 		 995 aa  823    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335521 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2489  translation initiation factor IF-2  66.46 
 
 		 956 aa  833    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.872607  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1715  translation initiation factor IF-2  91.05 
 
 		 934 aa  1160    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1211  translation initiation factor IF-2  67.65 
 
 		 951 aa  848    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186812  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1416  translation initiation factor IF-2  65.89 
 
 		 968 aa  842    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.919668  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2116  translation initiation factor IF-2  69.4 
 
 		 1051 aa  884    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  60.96 
 
 		 879 aa  988    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1061  translation initiation factor IF-2  70.46 
 
 		 961 aa  874    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271136  normal  0.0744531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3190  translation initiation factor IF-2  71.63 
 
 		 938 aa  922    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  41.75 
 
 		 882 aa  625  1e-177  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  42.55 
 
 		 883 aa  598  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  39.44 
 
 		 985 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  53.02 
 
 		 920 aa  593  1e-168  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  51.29 
 
 		 884 aa  591  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  44.87 
 
 		 980 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  52.55 
 
 		 686 aa  581  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  38.31 
 
 		 1029 aa  582  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  47.32 
 
 		 907 aa  580  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  42.41 
 
 		 882 aa  580  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  51 
 
 		 898 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  41.83 
 
 		 971 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  51.44 
 
 		 947 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  53.57 
 
 		 860 aa  578  1.0000000000000001e-163  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  51.36 
 
 		 732 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  52.72 
 
 		 739 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  46.62 
 
 		 922 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  51.03 
 
 		 692 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  51.9 
 
 		 921 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1867  translation initiation factor IF-2  38.73 
 
 		 1038 aa  571  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  48.77 
 
 		 902 aa  566  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  51.68 
 
 		 903 aa  566  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  50.67 
 
 		 894 aa  566  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  50.16 
 
 		 949 aa  566  1e-160  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08040  translation initiation factor IF-2  54.36 
 
 		 929 aa  566  1e-160  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13732  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  49.33 
 
 		 891 aa  564  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3221  translation initiation factor IF-2  51.7 
 
 		 815 aa  565  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.109257 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  51.84 
 
 		 879 aa  564  1.0000000000000001e-159  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  44.99 
 
 		 888 aa  565  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  47.41 
 
 		 964 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  47.02 
 
 		 964 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  49.33 
 
 		 896 aa  561  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  45.86 
 
 		 889 aa  556  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  48.57 
 
 		 885 aa  556  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  53.86 
 
 		 941 aa  556  1e-157  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 936 aa  558  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  50 
 
 		 843 aa  558  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  47.89 
 
 		 979 aa  557  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  48.57 
 
 		 880 aa  557  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  49.24 
 
 		 752 aa  558  1e-157  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  48.07 
 
 		 881 aa  556  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  46.02 
 
 		 834 aa  558  1e-157  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 895 aa  555  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  50.85 
 
 		 948 aa  552  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  48.4 
 
 		 880 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  48.4 
 
 		 880 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  47.57 
 
 		 873 aa  552  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  47.05 
 
 		 885 aa  553  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  48.5 
 
 		 894 aa  553  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  47.9 
 
 		 884 aa  553  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  46.87 
 
 		 880 aa  555  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  38.91 
 
 		 897 aa  554  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  48.24 
 
 		 885 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  48.24 
 
 		 885 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  49.34 
 
 		 883 aa  554  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  48.4 
 
 		 880 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  48.73 
 
 		 992 aa  554  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  48.57 
 
 		 889 aa  555  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  48.4 
 
 		 880 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 720 aa  552  1e-155  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  51.85 
 
 		 924 aa  550  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 868 aa  549  1e-155  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3730  translation initiation factor IF-2  48.26 
 
 		 892 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187768  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3596  translation initiation factor IF-2  48.26 
 
 		 892 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000160504  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  48.84 
 
 		 876 aa  552  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 854 aa  550  1e-155  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  47.86 
 
 		 896 aa  551  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  51.51 
 
 		 949 aa  552  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1749  translation initiation factor IF-2  49.11 
 
 		 890 aa  550  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0133551  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  46.97 
 
 		 1058 aa  550  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  48.58 
 
 		 882 aa  551  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>