More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1743 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_07010  translation initiation factor 2  67.55 
 
 		 930 aa  848    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1421  translation initiation factor IF-2  62.34 
 
 		 980 aa  767    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1370  translation initiation factor IF-2  60.51 
 
 		 999 aa  753    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.515442  normal  0.133918 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10320  translation initiation factor 2  54.22 
 
 		 957 aa  932    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0686977  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14570  translation initiation factor 2  64.21 
 
 		 938 aa  829    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00182457  normal  0.54145 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11480  translation initiation factor 2  67.08 
 
 		 969 aa  863    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21089  normal  0.867698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2489  translation initiation factor IF-2  67.55 
 
 		 956 aa  856    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.872607  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3592  translation initiation factor IF-2  61.51 
 
 		 1012 aa  795    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0285  translation initiation factor IF-2  90.19 
 
 		 954 aa  1134    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2207  translation initiation factor IF-2  64.59 
 
 		 612 aa  798    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537417  decreased coverage  0.000616715 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1327  translation initiation factor IF-2  60.66 
 
 		 995 aa  756    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335521 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1061  translation initiation factor IF-2  64.61 
 
 		 961 aa  810    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271136  normal  0.0744531 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1443  translation initiation factor IF-2  66.93 
 
 		 1044 aa  868    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1426  translation initiation factor IF-2  67.86 
 
 		 954 aa  879    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000203462 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1743  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 975 aa  1961    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.695409  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3331  translation initiation factor IF-2  62.96 
 
 		 992 aa  794    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1416  translation initiation factor IF-2  68.02 
 
 		 968 aa  887    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.919668  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3966  translation initiation factor IF-2  62.9 
 
 		 998 aa  816    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.602986  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  59.59 
 
 		 879 aa  858    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  42.3 
 
 		 971 aa  624  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  39.77 
 
 		 1161 aa  615  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  40.71 
 
 		 985 aa  615  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  39.94 
 
 		 882 aa  615  9.999999999999999e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  52.75 
 
 		 920 aa  610  1e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  50 
 
 		 907 aa  610  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  39.79 
 
 		 1029 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  51.23 
 
 		 884 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  52.95 
 
 		 732 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  53.69 
 
 		 879 aa  602  1.0000000000000001e-171  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  53.23 
 
 		 692 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  51.16 
 
 		 883 aa  600  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  47.42 
 
 		 986 aa  600  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  50.76 
 
 		 975 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  50.76 
 
 		 975 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  53.27 
 
 		 903 aa  597  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  50.76 
 
 		 975 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  48.17 
 
 		 980 aa  597  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  50.76 
 
 		 975 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  50.6 
 
 		 975 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  47.88 
 
 		 882 aa  595  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  50.6 
 
 		 975 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  50.6 
 
 		 975 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  45.33 
 
 		 860 aa  595  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  49.62 
 
 		 972 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  50.3 
 
 		 976 aa  592  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  48.48 
 
 		 971 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  48.48 
 
 		 971 aa  592  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  49.62 
 
 		 971 aa  592  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  48.48 
 
 		 971 aa  592  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  51.07 
 
 		 921 aa  591  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  50.23 
 
 		 969 aa  587  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 965 aa  589  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 972 aa  587  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  52.42 
 
 		 924 aa  586  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  49.77 
 
 		 989 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  49.33 
 
 		 979 aa  588  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  52.03 
 
 		 739 aa  588  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  51.07 
 
 		 822 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  52.74 
 
 		 1035 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  49.47 
 
 		 986 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  48.51 
 
 		 834 aa  583  1.0000000000000001e-165  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  50.67 
 
 		 720 aa  580  1e-164  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  49.1 
 
 		 922 aa  582  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  48.39 
 
 		 964 aa  582  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  50.41 
 
 		 947 aa  580  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  48.52 
 
 		 964 aa  579  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  49.4 
 
 		 992 aa  582  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  51.86 
 
 		 689 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  51.19 
 
 		 686 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  51.36 
 
 		 686 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  51.36 
 
 		 686 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  51.36 
 
 		 686 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  52.79 
 
 		 686 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  51.66 
 
 		 885 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  44.67 
 
 		 888 aa  578  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  51.19 
 
 		 686 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 		 892 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  44.5 
 
 		 956 aa  573  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 945 aa  573  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  51.02 
 
 		 686 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  51.02 
 
 		 686 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  49.85 
 
 		 968 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  50.5 
 
 		 845 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  50.93 
 
 		 1079 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  49.39 
 
 		 964 aa  569  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  49.1 
 
 		 904 aa  569  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  50.68 
 
 		 688 aa  572  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  52.63 
 
 		 948 aa  568  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  47.99 
 
 		 876 aa  568  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  49.5 
 
 		 936 aa  566  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  50.51 
 
 		 688 aa  567  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  50.25 
 
 		 1131 aa  568  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  49.75 
 
 		 896 aa  564  1.0000000000000001e-159  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 949 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  50.89 
 
 		 966 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08040  translation initiation factor IF-2  53.59 
 
 		 929 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13732  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  46.08 
 
 		 984 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  47.9 
 
 		 875 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  50.25 
 
 		 752 aa  565  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  47.22 
 
 		 991 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>