More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3393 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  57.86 
 
 		 1005 aa  1025    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16161  translation initiation factor IF-2  58.73 
 
 		 1113 aa  841    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.446889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16851  translation initiation factor IF-2  59.72 
 
 		 1114 aa  817    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  56.4 
 
 		 739 aa  641    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  57.48 
 
 		 1183 aa  830    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  55.7 
 
 		 1042 aa  987    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1867  translation initiation factor IF-2  55.96 
 
 		 1038 aa  996    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  56.13 
 
 		 692 aa  640    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18951  translation initiation factor IF-2  57.06 
 
 		 1183 aa  826    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0592  translation initiation factor IF-2  51.27 
 
 		 1176 aa  830    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  60.06 
 
 		 1104 aa  832    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  66.1 
 
 		 1128 aa  827    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  54.91 
 
 		 1030 aa  999    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  58.18 
 
 		 903 aa  653    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04131  translation initiation factor IF-2  61.23 
 
 		 1124 aa  843    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 992 aa  1987    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  99.9 
 
 		 992 aa  1984    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2357  translation initiation factor IF-2  74.4 
 
 		 1101 aa  1040    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16741  translation initiation factor IF-2  58.01 
 
 		 1161 aa  813    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16981  translation initiation factor IF-2  65.99 
 
 		 1126 aa  814    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  53.82 
 
 		 720 aa  632  1e-180  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  54.07 
 
 		 705 aa  627  1e-178  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  54.38 
 
 		 686 aa  628  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  54.38 
 
 		 686 aa  628  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  54.07 
 
 		 705 aa  627  1e-178  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  53.87 
 
 		 686 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  54.04 
 
 		 686 aa  624  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  54.04 
 
 		 686 aa  624  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  53.87 
 
 		 686 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  53.87 
 
 		 686 aa  625  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  54.04 
 
 		 688 aa  624  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  54.68 
 
 		 679 aa  622  1e-177  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  54.68 
 
 		 679 aa  623  1e-177  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  54.19 
 
 		 689 aa  621  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  53.87 
 
 		 688 aa  622  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  53.24 
 
 		 884 aa  617  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  54.72 
 
 		 883 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  55.38 
 
 		 985 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  53.31 
 
 		 1029 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  54.2 
 
 		 882 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  54.56 
 
 		 888 aa  605  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  53.37 
 
 		 947 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  53.72 
 
 		 971 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  54.2 
 
 		 980 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  54.2 
 
 		 986 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  53.87 
 
 		 845 aa  599  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  52.22 
 
 		 1161 aa  602  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  51.32 
 
 		 686 aa  597  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  52.24 
 
 		 882 aa  598  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  53.69 
 
 		 921 aa  597  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  54.61 
 
 		 997 aa  593  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  53.48 
 
 		 860 aa  595  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  52.11 
 
 		 822 aa  593  1e-168  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  52.95 
 
 		 1079 aa  592  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  49.45 
 
 		 949 aa  585  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  53.85 
 
 		 1131 aa  580  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  53.33 
 
 		 924 aa  582  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  48.04 
 
 		 892 aa  581  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  48.19 
 
 		 962 aa  579  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  51.52 
 
 		 968 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_118781  chloroplast translation initiation factor 2  51.19 
 
 		 1053 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.106372 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  51.78 
 
 		 964 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  54.03 
 
 		 949 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  52.2 
 
 		 979 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  51.78 
 
 		 964 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 945 aa  571  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  52.05 
 
 		 880 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  50.17 
 
 		 907 aa  572  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  47.08 
 
 		 897 aa  570  1e-161  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 		 884 aa  571  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  52.05 
 
 		 880 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  51.94 
 
 		 1079 aa  570  1e-161  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  52.05 
 
 		 880 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  50.86 
 
 		 854 aa  571  1e-161  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  52.05 
 
 		 880 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  52.22 
 
 		 882 aa  571  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  51.95 
 
 		 964 aa  568  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  51.71 
 
 		 885 aa  566  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  49.59 
 
 		 843 aa  566  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  48.55 
 
 		 956 aa  568  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  51.63 
 
 		 880 aa  568  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  51.71 
 
 		 885 aa  566  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  51.71 
 
 		 885 aa  566  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  52.32 
 
 		 881 aa  567  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0874  translation initiation factor IF-2  49.74 
 
 		 593 aa  568  1e-160  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0133057  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  52.49 
 
 		 738 aa  568  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  51.69 
 
 		 940 aa  567  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  51.03 
 
 		 920 aa  568  1e-160  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  50.93 
 
 		 992 aa  566  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_002936  DET0983  translation initiation factor IF-2  48.83 
 
 		 593 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  49.01 
 
 		 896 aa  563  1.0000000000000001e-159  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  50.59 
 
 		 885 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  51.28 
 
 		 896 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 895 aa  564  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  48.12 
 
 		 656 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  50.77 
 
 		 673 aa  563  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  52.52 
 
 		 887 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  52.68 
 
 		 941 aa  563  1.0000000000000001e-159  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3751  translation initiation factor IF-2  52.32 
 
 		 729 aa  564  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00372327  unclonable  0.0000243777 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  51.54 
 
 		 889 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>